Geri Dön

İmmün yeterli ve immün yetmezlikli ishalli olgularda gözden kaçan protozoonların konvansiyonel ve moleküler yöntemlerle araştırılması

The investigation of neglected protozoans in immunocompetent and immunodeficient diarrheal patients using by both conventional and molecular methods

PDF İndir

  1. Tez No: 638640
  2. Yazar: FAKHRIDDIN SARZHANOV
  3. Danışmanlar: PROF. DR. FUNDA DOĞRUMAN AL
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Parazitoloji, Microbiology, Parasitology
  6. Anahtar Kelimeler: Blastocystis, Dientamoeba fragilis, Diyare, Dizi analizi, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Protozoa, Teşhis, İmmün sistem, İmmün yetmezlik, İmmünite, Blastocystis, Dientamoeba fragilis, Diarrhea, Sequence analysis, Polymerase chain reaction, Protozoa, Diagnosis, Immune system, Immun deficiency, Immunity
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gazi Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Gastrointestinal semptomları olan olgularda Blastocystis ve Dientamoeba fragilis (D.fragillis)'in klinik önemi tartışmalı konulardan birisidir. Bu protozoonların patojenitesi tam olarak aydınlatılamadığı için çoğu rutin laboratuvar ve klinisyen tarafından ihmal edilen bir yaklaşım bulunmaktadır. Bu çalışmada immün yeterli (kadın: 99, erkek: 94, yaş ortalaması-standart sapma:43,88+17,53) ve immün yetmezlikli (kadın:136, erkek:109, yaş ortalaması-standart sapma:52,58+16,05) ishalli hastaların dışkı örneklerinde Blastocystis ve D. fragilis'in görülme sıklığının konvansiyonel ve moleküler yöntemlerle belirlenmesi, Blastocystis alt türlerinin Yeni Nesil Dizi analizi (NGS) yöntemi kullanılarak saptanması amaçlanmıştır. Çalışmamıza toplam 245 immün yetmezlikli ve 193 immün yeterli hastaya ait toplam 438 örnek dahil edilmiştir. Tüm dışkı örnekleri direkt mikroskobik (Serum fizyolojik, Lugol) Formol-eter konsantrasyon tekniği, Trikrom boyama, kültür ve moleküler yöntemlerle incelenmiştir. Çalışmamızda Blastocystis prevalansı %15,5, D. fragilis prevalansı ise %11,9 olarak saptanmıştır. Blastocystis ve D. fragilis prevalansı immün yetmezlikli hastalarda (sırasıyla %11,4 ve %10,6) immün yeterli olan hastalara (%20,7 ve %13,5) göre daha düşük bulunmuştur. Blastocystis prevalansı için her iki grup arasında istatistiksel olarak anlamlı fark (χ2=7,07, p=0,008) saptanırken D. fragilis için istatiksel olarak anlamlı fark bulunmamıştır. Blastocystis enfeksiyonu iki grup arasında erkeklerde kadınlara göre anlamlı olarak yüksek tespit edilmiştir (χ2=6,83, p=0,01). Toplam 68 Blastocystis izolatının NGS analiziyle alt tür analizi yapılmış ve alt tür dağılımı: ST3 %54,4 (n=37), ST2 %16,2 (n=11), ST1 %4,4 (n=3), ST6 %2,9 (n=2), ST4 %1,5 (n=1), ST2/ST3 %11,8 (n=8) ve ST1/ST3 %8,8 (n=6) şeklinde bulunmuştur. İki grup arasında Blastocystis alt tür dağılımında istatistiksel olarak anlamlı fark sadece miks alt türlerde saptanmış (χ2=4,43, p=0,04) ve immün yeterlilerde daha yüksek sıklıkta belirlenmiştir. İmmün yetmezlikli kadınlarda Blastocystis döngü eşiği (Ct) ortalaması immün yeterli kadınlara göre daha düşük bulunmuş dolayısıyla parazit yükü daha yüksek tespit edilmiştir (p=0,04). Her iki hasta grubunda da Blastocystis ve D. fragilis enfeksiyonunun yüksek prevalansta saptanması ishalli olgularda bu etkenlerin gözönünde bulundurulması gerektiğini göstermektedir.

Özet (Çeviri)

The clinical significance of Blastocystis and Dientamoeba fragilis in patients with gastrointestinal symptoms is a controversial issue. Since the pathogenicity of these protozoans cannot be fully elucidated, there is an approach neglected by most routine laboratories and clinicians. This study aimed to determine the prevalence of Blastocystis and D. fragilis using conventional and molecular methods and identify Blastocystis subtypes using the next-generation sequencing (NGS) method in the diarrheic stool samples of immunodeficient and immunocompetent patients. A total of 438 samples of 245 immunodeficient (female: 136, male: 109, mean age-standard deviation: 52,58±16,05 years) and 193 immunocompetent (female: 99, male: 94, mean age-standard deviation: 43,88±17,53 years) patients were included. All stool samples were examined by direct microscopy (serum physiologic, Lugol's staining), formalin-ether concentration technique, and trichrome staining, culture and molecular methods. In our study, the prevalence of Blastocystis was detected as 15,5%, and that of D. fragilis was 11,9%. The prevalence of Blastocystis and D. fragilis was lower in immunodeficient patients (11,4% and 10,6%, respectively) compared to the immunocompetent patients (20,7% and 13,5%, respectively). While there was a statistically significant difference (χ2=7,07, p=0,008) between the two groups for the Blastocystis prevalence, no statistically significant difference was found for D. fragilis. The rate of Blastocystis infection was significantly higher among males than females in both groups (χ2=6,83, p=0,01). A subtype analysis was performed by NGS on 68 Blastocystis isolates, which revealed the subtype distribution as follows: ST3 54,4% (n=37), ST2 16,2% (n=11), ST1 4,4% (n=3), ST6 2,9% (n=2), ST4 1,5% (n=1), ST2/ST3 11,8% (n=8) and ST1/ST3 8,8% (n=6). There was a statistically significant difference in the distribution of Blastocystis subtypes between the two groups only for mixed subtypes (χ2=4,43, p=0,04), which was determined at a higher rate among the immunocompetent patients. The mean of Blastocystis cycle threshold (Ct) was found to be lower in women with immunodeficiency compared to immunocompetent women; thus, the parasite load was higher in the former (p=0,04). The detection of Blastocystis and D. fragilis infection at high prevalence in both patient groups shows that these factors should be considered in cases with diarrhea.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    809548

    Development and validation of in-house elisa prototypes for anti-F5 (K99) antibody detection in neonatal calf diarrhea and total IgG detection in immune sera

    Sığır immun serumlarında total IgG ve yenidoğan buzağı ishallerinde anti-F5 (K99) antikor tespitine yönelik ın-house elısa prototipleri geliştırilmesi ve valıdasyon çalışmaları

    MUHAMMAD SHAHBAZ SHARIF

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Veteriner HekimliğiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Veterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. OKTAY GENÇ

  2. Tez No

    919272

    Bağırsak hasar modellerinde kemik iliği mezenkimal kök hücre ve bağırsak mezenkimal kök hücrelerin rejeneratif ve immün modülatuvar etkilerinin karşılaştırılması

    Comparison of regenerative and immune modulatory effecets of bone marrow and intestinal mesenchymal stem cells i intestinal damage models

    BURCU PERVİN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2025

    BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Kök Hücre Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATİMA AERTS KAYA

  3. Tez No

    699403

    Primer immün yetmezlikli çocuklarda tanımlayıcı öykü özelliklerinin araştırılması

    Investigation of descriptive history characteristics in children with primary immunodeficiency

    FADİME CEYDA ELDENİZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İSMAİL REİSLİ

  4. Tez No

    452545

    Primer immün yetmezlikli çocuklarda latent tüberküloz infeksiyonu tanısında tüberkülin deri testi ile interferon gamma release assay metodlarının karşılaştırılması

    Comparison of tuberculin skin test and interferon gamma release assay methods for diagnosis of latent tuberculosis infection in patients with primary immunodeficiency disease

    ÖZLEM MURZOĞLU KURT

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıMarmara Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AHMET OĞUZHAN ÖZEN

  5. Tez No

    847928

    Primer immün yetmezlikli hastalarda biyotinidaz enzim aktivitesinin retrospektif değerlendirilmesi

    Evaluation of biotinidase enzyme activity in patients with primary immunodeficiency: A retrospective analysis

    MERVE DENİZ BAŞKAYA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıBursa Uludağ Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ŞAHİN ERDÖL

    PROF. DR. SARA ŞEBNEM KILIÇ GÜLTEKİN

Geri Dön