Identification of the genes involved in“Phyotsiderophore”synthesis and metal ion uptake in wheat using RT-PCR
Buğdayda“Fitosiderofor”sentezinde ve metal iyon alımında görev alan genlerin RT-PCR ile tanımlanması
- Tez No: 143396
- Danışmanlar: PROF. DR. MAHİNUR AKKAYA, PROF. DR. SEMRA KOCABIYIK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Buğday, fitosidorofor, demir eksikliği, çinko eksikliği, ters transkriptaz zincir reaksiyonu, SAM-synthetase, IDI-1, Wheat, phytosiderophores, iron deficiency, zinc deficiency, RT-PCR, SAM-synthetase, IDI-1
- Yıl: 2003
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Tarımsal alanların çoğunda topraklar, çinko ve demir elementlerinin düşük çözünürlüğü ve ulaşılabilirliği ile sonuçlanan yüksek pH'a sahiptir. Bu tip topraklarda yetişen bitkiler çinko ve demir eksikliği ile karşılaşırlar. Bu tip topraklarda normal gelişimlerine devam edebilen dayanıklı bitkilerin toprakta düşük çözünürlükte bulunan demiri alabilmek için çeşitli stratejiler geliştirdikleri tespit edilmiştir. Demir eksikliğine dayanıklı monokotlar, demir stresine cevap olarak topraktaki düşük çözünürlüklü demiri bağlayan mugineik asit ailesine bağlı fîtosideroforlan salgılarlar. Bir çok araştırıcı fitosidoroforlann graminelerin çinko beslenmesinde ve çinko eksikliğine dayanıklılık mekanizmasında da rol oynadıklarını öne sürmüşler. Fitosiderofor sentezinde rol aldığı düşünülen veya demir eksikliği sırasında uyarılan bir çok gen bazı organizmada gösterilmiş ancak henüz bu genler buğdayda araştırılmamıştır. Bu çalışmada, dayanıklı bir arpa kültüvan olan Tokak-157, dayanıklı buğday kültüvan Kıraç-66 ve daha az dayanıklı bir buğday kültüvan olan BDMM-19 bitkileri normal büyüme koşullannda 1 hafta yetiştirildikten sonra çinko içermeyen, demir içermeyen ve hem çinko hem de demir içermeyen olmak üzere 3 farklı solüsyona aktanlıp yetiştirilmeye devam edilmiştir. 1 hafta sonunda hem çinko hemde demir yönünden eksik ortamda yetiştirilen bitkiler tekrar normal büyüme koşullanna transfer edilmiştir. Daha önce buğday dışındaki diğer bitkilerde fitosiderofor sentezinde rol aldığı bulunmuş genlerin ortak ve korunmuş bölgeleri için dejenere primerler dizayn edilmiş ve bu primerler kullanılarak RT-PCR (ters transkriptaz zincir reaksiyonu) yapılmıştır. Sonuçta; buğday IDI-1 geni ve buğday SAM-synthetase gen fragmanı bulunmuştur.
Özet (Çeviri)
Soils in many agricultural areas have high pH, resulting in low availability of zinc and iron. Plants grown on such soils suffer from either Zn or Fe deficiency or both. The efficient plant genotypes grown normally in calcerous soils were found to evolve some strategies to acquire the iron which is in insoluble form. Iron efficient graminaceous monocots release iron chelating substances, mugineic acid family p hytosiderophores (MAs), in response to iron deficiency stress. Several researchers have suggested that phytosiderophores also can play role in grass Zn nutrition and thus it may be possible that it is the uptake mechanism for Zn efficiency. Several possible genes that take role in phytosiderophore synthesis or found to be induced under iron deficient conditions were identified in several organisms but not on wheat. In this study, the efficient barley cultivar Tokak-157, efficient wheat cultivar Kıraç -66 and relatively less efficient wheat cultivar BDMM-19 were grown in normal growth conditions for 1 week and transfered to zinc deficient, iron deficient and both zinc and iron deficient nutrient solutions. After growing 1 week on these conditions, plants grown on both zinc and iron deficient nutrient solutions were retransfered to zinc and iron sufficient conditions. Degenerate primers were designed for the conserved regions of previously identified genes that take role in phytosiderophore synthesis or induced under iron deficient conditions and RT-PCRs were performed. The complete open reading frame of IDI-l(Iron deficiency induced-1) gene and the putative gene fragment for SAM-s (S-adenosylmethionine synthetase) were identified.
Benzer Tezler
- Identification of genes involved in hepatocellular carcinoma : Evaluation of hCdc4 and B-Raf genes
Hepatoselüler karsinomda R01 alan genlerinin tanımlanması: hCdc4 and B-Raf genlerinin değerlendirilmesi
BANU SÜRÜCÜ
Yüksek Lisans
İngilizce
2003
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. CENGİZ YAKICIER
- Identification of genes induced by BRCA1 in breast cancer cells
Meme kanseri hücrelerinde BRCA1 tarafından indüklenen genlerin tanımlanması
ARZU ATALAY
Doktora
İngilizce
2002
Tıbbi Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. IŞIK YULUĞ
- Identification of the role of p33ING1 protein in the cellular activities of p53 tumor suppressor protein
p33ING1 proteininin p53 tümör baskılıyıcı proteininin hücresel aktiviteleri üzerindeki etkisinin belirlenmesi
N.C. TOLGA EMRE
Yüksek Lisans
İngilizce
1999
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. RENGÜL ÇETİN-ATALAY
- Identification of new genes related with bacilysin biosynthesis by Tn-10 mutagenesis method in Bacillus subtilis
Basillus subtilis`te bacilysin biyosentezi ile ilgili yeni genlerin Tn-10 transpozon mutajenez metodu ile tanımlanması
TÜRKAN EBRU AYDOĞDU KÖROĞLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2005
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiYRD. DOÇ. DR. AYTEN YAZGAN KARATAŞ
- Identifcation of the interacting domain of P53 family members with P33 ING1 protein
P53 protein ailesinin P33 ING1 proteini ile ilişkiye giren bölgesinin belirlenmesi
DENİZ DİNÇEL
Yüksek Lisans
İngilizce
2002
Tıbbi Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. RENGÜL ÇETİN ATALAY