Identification of genes induced by BRCA1 in breast cancer cells
Meme kanseri hücrelerinde BRCA1 tarafından indüklenen genlerin tanımlanması
- Tez No: 129237
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. IŞIK YULUĞ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: BRCA1, Genler, Meme neoplazmları, BRCA1, Genes, Breast neoplasms
- Yıl: 2002
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
ÖZET MEME KANSERİ HÜCRELERİNDE BRCA1 TARAFINDAN İNDÜKLENEN GENLERİN TANIMLANMASI ARZU ATALAY Doktora Tezi, Molekül er Biyoloji ve Genetik Bölümü Tez Yöneticisi: Yar. Doç. Dr. Işık G.Yuluğ Aralık 2002, 235 sayfa BRCA1 geninin kalıtsal mutasyonları meme, rahim ve diğer organlarda kansere yatkınlığa yol açar. BRCA1 -eksik hücrelerde yeni kromozomal düzenlenmeler görüldüğünden BRCA1 protein ürününün kromozomal bütünlüğün devam ettirilmesinde görevli olduğu düşünülmektedir. BRCA1 -eksik hücrelerdeki kromozomal dengesizlik DNA çift-ipliğinin yanlış tamiriyle ilişkilidir. BRCA1 geninin kromozomal bütünlüğün sağlanmasındaki rolü protein ürününün transkripsiyonel düzenleme dahil bir kaç biyolojik özelliğine bağlıdır. Bu çalışmanın amacı BRCA1 tarafından düzenlenen genlerin tanımlanmasıdır. BRCAl'i meme kanseri hücrelerinde sıkı-düzenlenen“ecdysone”ile indüklenebilen bir sistemle fazla ifade etmek için yapılan ilk çalışmalar, istenen düzeyde BRCA1 proteini vermemiştir ve bu nedenle ektopik BRCA1 ifadesi konstitütif ekspresyon vektörü kullanılarak yapılmıştır. Bu çalışmada MCF7 meme kanseri hücrelerinde BRCAl'in fazla ifade edilmesi sonucu ifade düzeyleri artan genler“Suppression Subtractive Hybridisation”(SSH) metodu kullanılarak tanımlanmıştır. Ayrımsal tarama, dizileme ve homoloji araştırma çalışmaları meme kanseri hücrelerinde BRCAl'in fazla ifade edilmesinin DNA tamiri, kromozom yapımı ve ayrılması, sinyal iletimi, RNA tarama, ubikitin aracılıklı proteoliz, amino asit taşınımı, RNA metabolizması ve glukoz metabolizması gibi hücresel olaylarda yer alan proteinleri kodlayan farklı gen gruplarının ifadelerinde artışa yol açtığını göstermiştir. Bu çalışma meme karsinom hücrelerinde SSH tekniği kullanılarak BRCA1 tarafından indüklenen genleri gösteren ilk çalışmadır. Bu çalışmada tanımlanan genler BRCAl'in tümör baskılayıcı görevlerine yeni bir bakış açısı sağlayabilir. IV
Özet (Çeviri)
ABSTRACT IDENTIFICATION OF GENES INDUCED BY BRCA1 IN BREAST CANCER CELLS ARZU ATALAY Ph.D. in Molecular Biology and Genetics Supervisor: Assist. Prof. Işık G.Yuluğ December 2002, 235 Pages Inherited mutations of the BRCA1 gene predispose to cancer of the breast, ovaries and other organs. The BRCA1 protein product is implicated in the maintenance of chromosomal integrity as BRCA1 -deficient cells display gross chromosomal rearrangements. Chromosomal instability in BRCA1 -deficient cells is related to inappropriate DNA double-strand break repair. The role of the BRCA1 gene in the maintenance of chromosomal integrity is linked to a number of biological properties of its protein product including transcriptional regulation. The aim of this study is to identify genes that are regulated by BRCA1. Initial attempts to overexpress BRCA1 in breast cancer cells with the tightly-regulated ecdysone inducible system did not result in the desired levels of BRCA1 protein and ectopic BRCA1 expression was therefore performed by using the constitutive expression vector. In this study, we have identified genes whose expression levels are upregulated as a result of BRCA1 overexpression in MCF7 breast carcinoma cells by using the suppression subtractive hybridisation (SSH) method. Differential screening, sequencing and homology search studies showed that BRCA1 overexpression in breast cancer cells leads to transcriptional upregulation of distinct classes of genes encoding proteins involved in cellular processes such as DNA repair, chromosome assembly and segregation, signal transduction, RNA surveillance, ubiquitin-mediated proteolysis, amino acid transport, RNA metabolism and glucose metabolism. This study is the first to report BRCA1- induced genes in breast carcinoma cells with the SSH technique. The identified genes in this study may provide new insights into the tumour suppressor functions of BRCA1.
Benzer Tezler
- Çiftlik hayvanlarında major genler. Bunların belirlenmesi, transferi ve endüstriyel kullanımı
Major genes in farm animals: Their identification, transfer and industrial utilization
İBRAHİM CEMAL
- TAF7 ekspresyonunun sirna ile baskılanması sonrasında apoptotik süreçteki değişikliklerin araştırılması
Study of the apoptotic process and the effects induced by TAF7 gene expression silencing using sirna
DİLEK GÖKTÜRK
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
Tıbbi BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
Y.DOÇ.DR. ZEYNEP SERCAN
- Kalıtsal duyma kayıplarına neden olan genlerin; haritalama, kritik bölge analizi ve mutasyon tarama yöntemleri ile saptanması
Identification of genes causing hereditary hearing loss by gene mapping, linkage analysis and mutation screening
ABDULLAH ÜZÜMCÜ
- Abiyotik stresle ilişkili genlerin mRNA farklılık gösterim tekniği kullanılarak belirlenmesi ve karakterize edilmesi
Identification and characterization of abiotic stress-related genes by using mRNA differential display technique
DİĞDEM AKTOPRAKLIGİL
