Yeni pirimidin türevlerinin sentezi, yapısal karakterizasyonu ve yapı-aktivite ilişkilerinin hesaplamalı kimya yöntemleriyle incelenmesi
Synthesis of new pyrimidine derivatives, structural characterization and investigation of structure-activity relationships by computational chemistry methods
- Tez No: 974311
- Danışmanlar: DOÇ. DR. TUĞBA GÜNGÖR, DR. ÖĞR. ÜYESİ GÜLBİN KURTAY
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kanser, milyonlarca insanı etkileyen küresel çapta bir hastalık olup, tedavisinde pirimidin içeren ilaç etken maddeler antikanser ajan olarak yaygın bir şekilde kullanılmaktadır. Yeni pirimidin türevlerinin sentezi, kuantum kimyasal özelliklerinin hesaplamalı kimya yöntemleriyle araştırılması ve biyolojik etkinliklerinin incelenmesi ilaç keşfi ve geliştirmesinde büyük önem arz etmektedir. Bu tez çalışmasının ilk bölümünde, çeşitli heterohalkalar ya da alifatik gruplar içeren sekiz yeni pirimidin türevi (PM1-8) deneysel koşulların optimizasyonu neticesinde sentezlenmiş ve uygun tekniklerle saflaştırılmıştır. Başarıyla sentezi gerçekleştirilen hedef moleküllerin yapıları FT-IR, 1H NMR, 13C NMR ve HR-MS spektroskopik verileri ile kanıtlanmıştır. Araştırmanın ikinci bölümünde ise hesaplamalı kimya çalışmaları ile bileşiklerin HOMO-LUMO enerjileri, elektronegatiflikleri, sertlik/yumuşaklık vb. çeşitli kimyasal parametreleri hesaplanmıştır. Oral kullanılabilirlikleri ile toksikolojik özelliklerini belirlemek için ADMET analizleri gerçekleştirilmiştir. Ayrıca, sentezlenen bileşiklerin, vücuttaki taşınımı hakkında bilgi sahibi olmak için insan serum albümini (HSA) proteini ve antikanser potansiyelini belirlemek için epidermal büyüme faktörü reseptörü (EGFR) proteini ile etkileşimleri moleküler kenetleme çalışmaları gerçekleştirilerek tespit edilmiştir. Sentezlenen bileşikler arasında PM7 bileşiği, yüksek etkinlik ve güçlü protein bağlanma potansiyeli özellikleri ile öne çıkan bileşik olarak tespit edilmiştir. Yapı-etkinlik ilişkisi (SAR) değerlendirildiğinde, nitrofenil piperazin birimi içeren PM7 başta olmak üzere PM4 (2-aminoetilpiperidin türevi), PM5 (2-metilpiperidin türevi) ve PM6 (pirolidin türevi) bileşiklerinin de kanser tedavisinde potansiyel ilaç adayı olarak değerlendirilebileceği öngörülmektedir.
Özet (Çeviri)
Cancer is a global disease affecting millions of people, and pyrimidine-containing compounds are widely employed as anticancer agents in its treatment. The synthesis of new pyrimidine derivatives, investigation of their quantum chemical properties using computational chemistry methods, and evaluation of their biological activities hold great significance in drug discovery and development. In the first part of this thesis, eight novel pyrimidine derivatives (PM1–8) incorporating various heterocycles or aliphatic groups were synthesized through optimized experimental conditions and purified by appropriate techniques. The structures of successfully synthesized target molecules was confirmed by FT-IR, 1H NMR, 13C NMR, and HR-MS spectroscopic data. In the second part, computational chemistry studies were carried out to calculate the HOMO–LUMO energies, electronegativities, hardness/softness, and other chemical parameters of the compounds. ADMET analyses were performed to assess their oral bioavailability and toxicological profiles. Furthermore, molecular docking studies were conducted to evaluate their interactions with human serum albumin (HSA), providing insight into their transport in the body, and with the epidermal growth factor receptor (EGFR), to explore their anticancer potential. Among the synthesized compounds, PM7 exhibited the most promising activity and strong protein-binding potential. Structure–activity relationship (SAR) analysis revealed that, in addition to PM7 containing a nitrophenyl piperazine moiety, PM4 (2-aminoethylpiperidine derivative), PM5 (2-methylpiperidine derivative), and PM6 (pyrrolidine derivative) could also be considered as potential drug candidates for cancer therapy.
Benzer Tezler
- Yeni sübstitüe ftalosiyaninlerin sentezi ve özelliklerinin incelenmesi
The Synthesis and properties of new substituded pathalocyanines
SÜLEYMAN GÜRSOY
- Kinolin grubu içeren bazı yeni porfirin bileşiklerinin sentezi ve yapılarının aydınlatılması
Synthesis and structures elucidation of some new porphyrin compounds containing quinoline group
MILAD NOROUZIDASTJERDI
- Sentezlenen tek kristal Cu(II) kompleksinin yapı-özellik ilişkilerinin incelenmesi
Investigation of structure-property relations of synthesized single crystal Cu(II) complex
HATİCE ESRA CÖMERT
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Fizik ve Fizik MühendisliğiSakarya ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DAVUT AVCI
- 2-(metiltiyo)kinolin grubu içeren yeni ftalosiyaninlerin sentezi ve karakterizasyonu
Synthesis and characterization of new phthalocyanines containing 2-(methylthio)quinoline group
MUSTAFA ALALOUSH
- Pirimidin türevi içeren yeni tür ftalosiyaninlerin sentezi ve karakterizasyonu
Synthesis and characterization of new types of phthalocyanines containing pyrimidine derivatives
BİLGE YAZAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
KimyaSakarya ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MERYEM NİLÜFER YARAŞIR