Assessment of genetic diversity based on agro-morphological traits and issr molecular markers in einkorn wheat (Triticum monococcum ssp. Monococcum) landraces populations from Turkey
Türkiye'nin yerel einkorn buğday (Triticum monococcum ssp. Monococcum) populasyonlarında genetik çeşitliliğin argro-morfolojik özelliklere ve ISSR moleküler belirteçlerine dayalı olarak değerlendirilmesi
- Tez No: 679558
- Danışmanlar: PROF. DR. NUSRET ZENCİRCİ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Eğitim ve Öğretim, Education and Training
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Bolu Abant İzzet Baysal Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada, Bolu ve Kastamonu'da çiftçi tarlalarında yetişen 48 einkorn yerel buğday (Triticum monococcum ssp. monococcum) popülasyonunda genetik çeşitlilik, popülasyon genetik yapısı ve genetik farklılaşmanın araştırılması hedeflendi. Bunun için yedi agro-morfolojik özellik ile morfolojik varyasyon araştırılırken ISSR moleküler markerleri ile genetik çeşitlilik moleküler düzeyde araştırıldı. Agro-morfolojik karakterler olarak yaprak ağırlığı (mg), koleoptil uzunluğu (cm), kök sayısı (n), kök uzunluğu (cm), taze kök ağırlığı (mg), kuru kök ağırlığı (mg) incelendi. Elde edilen morfometrik verilerde genetik varyasyon varyasyon katsayısı, ANOVA ve temel koordinatlar analizi istatistik analiz yöntemleri ile değerlendirildi. Tanımlayıcı istatistiklere göre, agro-morfolojik özellikler için minimum değerler RL ve LW özellikleri için sırasıyla 0.37 ve 74.48 arasında değişirken, maksimum değerler CL ve LW özellikleri için sırasıyla 1.70 ile 426.90 arasında değişmektedir. Varyasyon katsayısı değerlerine göre en yüksek değer %52,09 ile FRW'de, en düşük değer ise %8,9 ile LW'de gözlenmiştir. Agro-morfolojik özellikler arasındaki Pearson korelasyon sonuçlarına göre en yüksek anlamlı korelasyon değeri 0,910 (p <0,01 anlamlı düzeyde r = 0,00) olarak DRW ile RL arasında, en düşük anlamlı korelasyon değeri 0,296 (p <0,05 anlamlı düzeyde r = 0,04) olarak LW ile RL arasında belirlendi. PCA sonuçları iki temel bileşende varyasyonu %76,93 olarak açıkladı. Morfometrik verilere göre linkaj bağlantı (gruplar arası) kullanılarak Öklit karesi ile bir kümeleme analizi gerçekleştirildi. Einkorn yerel buğday popülasyonları iki temel gruba rastgele şekilde ayrıldı. Dendrograma göre agro-morfolojik özelliklerin popülasyonları ayırmada yeterli olmadığı gözlendi. Moleküler karakterizasyon için ISSR primerleri ile elde edilen veriler popülasyon genetiği analiz programı olan PopGene (ver. 1.32) ile analiz edildi. PopGene sonuçlarına göre ortalama alel sayısı, etkili alel sayısı ve genetik çeşitlilik değerleri sırasıyla na = 2, nea = 1.33 ve h = 0.13 olarak hesaplandı. En yüksek polimorfik bant sayısı 22 (%73) ile Bolu-Seben popülasyonunda, en düşük polimorfik bant ise 15 (%50) ile Kastamonu-İhsangazi popülasyonunda belirlendi. Popülasyonlar arasındaki genetik farklılaşma (% 63), popülasyonlar içinde (% 37) olduğu kadar önemli ölçüde yüksek düzeyde gözlendi. Einkorn popülasyonlarında genetik çeşitlilik düzeyinin hala oldukça yüksek olduğu gözlendi. Agro-morfolojik özellikler arasında çimlenme gücü, kök sayısı ve coleoptil uzunluğu güvenilir özellikler olarak ortaya çıktı. Populasyonlarda genetik çeşitlilik için morfolojik karakterlerin tek başına kullanılması popülasyonlar arasındaki farklılaşmayı ve popülasyon genetik yapısını belirlemek için yeterli olmadığı belirlendi. Bu nedenle popülasyonlarda genetik çeşitlilik, popülasyon genetik yapısı ve genetik farklılaşmayı araştırma çalışmalarında morfolojik özelliklerin yanı sıra moleküler karakterizasyonun yapılmasının daha güvenilir sonuçlar üreteceği sonucuna varıldı.
Özet (Çeviri)
Number of pages (xv + 85) In this study, it was aimed to investigate genetic diversity, population genetic structure, and genetic differentiation in 48 einkorn landraces wheat (Triticum monococcum ssp. monococcum) populations grown in farmer fields in Bolu and Kastamonu. For this purpose, seven agro-morphological traits and morphological variation were investigated, while genetic variation was investigated at the molecular level with ISSR molecular markers. As agro-morphological traits, leaf weight (mg), coleoptile length (cm), root number (n), root length (cm), fresh root weight (mg), dry root weight (mg) were examined. Genetic variation was evaluated in the obtained morphometric data by using coefficient of variation, ANOVA and principal coordinates analysis statistical analysis methods. According to descriptive statistics, the minimum values for agro-morphological traits ranged between 0.37 and 74.48 for RL and LW traits, while the maximum values ranged between 1.70 and 426.90 for CL and LW traits, respectively. According to coefficient of variation values, the highest value was observed in FRW as 52.09%, while the lowest value was observed in LW as 8.9%. According to Pearson's correlation values between agro-morphological traits, the highest significant correlation value was 0.910 (p <0.01 significant level r = 0.00), the lowest significant correlation value was 0.296 (p <0.05 significant level r = 0.04) between LW and RL. PCA results revealed the variation in the two main components as 76.93%. A clustering analysis was performed with Euclidean square using linkage (between groups) according to morphometric data. Einkorn local wheat populations were randomly clustered into two main groups. According to the dendrogram, it was observed that agro-morphological traits were not sufficient to differentiate the populations. For molecular characterization, data obtained with ISSR primers were analyzed with the population genetics analysis program PopGene (ver. 1.32). According to PopGene results, the mean number of alleles, the mean number of effective alleles and average genetic diversity values were calculated as na = 2, nea = 1.33 and h = 0.13, respectively. The highest number of polymorphic bands were determined as 22 (73%) in Bolu-Seben population, while the lowest polymorphic band was determined as 15 (50%) in Kastamonu-İhsangazi population. Genetic differentiation between populations (63%) was observed at significantly higher levels as well as within populations (37%). It was observed that the level of genetic diversity in einkorn populations was still quite high. Among the agro-morphological traits, germination power, root number and coleoptile length appeared to be reliable traits. It was determined that the use of morphological characters alone for genetic diversity in populations is not sufficient to determine the differentiation between populations and population genetic structure. For this reason, it was concluded that in the studies of genetic diversity, population genetic structure and genetic differentiation in populations, molecular characterization as well as morphological traits will produce more reliable results.
Benzer Tezler
- Türkiye'nin farklı bölgelerinden sağlanan susam (Sesamum indicum L.) populasyonlarının agro-morfolojik özellikler bakımından karşılaştırılması
The assessment of genetic diversity of sesame (Sesamum indicum L.) populations supplied from different regions of Turkey based on agro-morphological traits
AYNUR BİLMEZ
- Yenileme yatırımları
Başlık çevirisi yok
OSMAN NURİ FİLİZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
İşletmeGazi ÜniversitesiEndüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. OSMAN OKKA
- Türkiye'de dış borçlanmayı etkileyen faktörler ve dış borçlanmanın ekonomik katkıları
Başlık çevirisi yok
MEHMET AKÇAY
- Computer aided investigation of the relationships between sensory, chemical and physical properties of set yogurt
Başlık çevirisi yok
SERMET YALÇINKAYA
Yüksek Lisans
İngilizce
1987
Gıda MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiYRD. DOÇ. DR. MEHMET D. ÖNER
- Anıtkabir çevresi yapılaşma düzeni ve çevre ilişkilerinin görsel değerlendirilmesi üzerinde uygulamalı bir araştırma
Structural developments around Anıtkabir and a research on visual evaluation of environmental relations
IŞIK UÇMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
1987
Şehircilik ve Bölge PlanlamaAnkara ÜniversitesiPeyzaj Mimarlığı Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YALÇIN MEMLUK