İneklerde subklinik mastitis etkenlerinin multipleks PCR ile araştırılması
Investigation of subclinical mastitis pathogens by multiplex PCR in cows
- Tez No: 663953
- Danışmanlar: PROF. DR. SERKAN İKİZ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: A Clergyman's Daughter, Gıda mikrobiyolojisi, Mastit, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Sığırlar, İnekler, A Clergyman's Daughter, Food microbiology, Mastitis, Polymerase chain reaction, Cattles, Cows
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Veterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada, İstanbul ve çevre illerinde yetiştirilen laktasyon dönemindeki ineklerde subklinik mastitise neden olan 5 kontagiyöz, 10 çevresel patojen olmak üzere toplam 15 patojen suşun ve Staphylococcal β-laktatamaz direnç geni Multipleks PCR ile tespit edilmesi amaçlandı. Böylelikle mastitise neden olan yaygın patojenlerin belirlenmesinde klasik kültür yöntemleri ile çoğunlukla gözardı edilebilen patojenlerin de araştırılması amaçlandı. Bu amaçla İstanbul ve çevre illerinden olmak üzere toplamda 4 farklı çiftlikten laktasyon dönemindeki 108 hayvana ait 150 adet CMT pozitif süt örnekleri toplandı. CMT pozitif süt numunelerinden total DNA ekstraksiyonu yapıldı ve ekstraktlar multipleks real time PCR kullanılarak amplifiye edildi. Çalışmada toplam 108 hayvandan alınan 150 adet süt örneğinden 131'i (%87,33) araştırılan etkenler yönünden pozitif, 19'u (%12,67) negatif olarak değerlendirildi. 131 pozitif süt örneğinin 85'inde (%64,89) birden fazla mikroorganizma, 46'sında (%35,11) birer mikroorganizma tespit edildi. Toplam 278 mikroorganizmadan 76'sı (%27,34) Staphylococcus spp., 66'sı (%23,74) Escherichiacoli, 46'sı (%16,55) Enterecoccus spp., 22'si (%7,92 ) Corynebacterium bovis, 18'i (%6,47) Trueperella pyogenes, 14'ü (%5,04) Streptococcus uberis, 9'u (3,23) Candida spp., 7'si (%2,51) Streptococcus dysgalactiae, 5'i (%1,80) Staphylococcus aureus, 4'ü (1,44) Streptococcus agalactiae, 4'ü (%1,44) Prototheca spp., 2'si (%0,72) Mycoplasma bovis, 2'si (%0,72 ) Mycoplasma spp., 2'si (% 0,72) Klebsiella spp., 1'i (% 0,36) Serratia marcescens olarak tespit edilmiştir. Staphylococcal β-lactamaz direnç geni 81 Staphylococcus spp.'nin 42'sinde (%51,8) saptandı. Gram negatif ve Gram pozitif bakteriler karşılaştırıldığında istatistiki olarak negatif bakterilerin görülme oranı daha yüksek bulundu (P<0,001). Kontagiyöz ve çevresel patojenler karşılaştırıldığında çevresel patojenlerin görülme oranı daha yüksek saptandı (P<0,001). Bu tez çalışmanın sonuçları sağım hijyeni ve çiftliklerdeki zooteknik şartların geliştirilmesi gerektiğini, aşılama başta olmak üzere koruyucu önlemlerin önemini bir kez daha gösterdi. Bununla birlikte Prototheca spp.'nin subklinik mastitis olgularında varlığı Türkiye'de ilk kez gösterildi. Ayrıca subklinik mastitislerde Candida spp.'nin varlığının araştırılması gerektiğini bir kez daha ortaya çıkardı.
Özet (Çeviri)
The scope of this study was to detect a total of 15 pathogenic strains, including 5 contagious, 10 environmental pathogens, and Staphylococcal β-lactamase resistant gene, that cause subclinical mastitis in lactating cows raised in Istanbul and surrounding provinces by Multiplex PCR. Thus, it was aimed to investigate common pathogens that cause mastitis, and pathogens that could be ignored with classical culture methods. For this purpose, 150 CMT positive milk samples belonging to 108 lactating animals were collected from 4 different farms in total, from Istanbul and surrounding provinces. Total DNA was extracted from CMT positive milk samples and the extracts were amplified by using multiplex real time PCR. In the study, 131 (87.33%) of 150 milk samples taken from a total of 108 animals were evaluated as positive while 19 (12.67%) were evaluated as negative. Among 131 positive milk samples, more than one microorganism was detected in 85 (64.89%) and one microorganism each of 46 (35.11%). Of the total 278 microorganisms were determined as 76 (27.34%) Staphylococcus spp., 66 (23.74%) Escherichia coli, 46 (16.55%) Enterecoccus spp., 22 (7.92%) Corynebacterium bovis, 18 (6.47%) Trueperella pyogenes, 14 (5.04%) Streptococcus uberis, 9 (3.23) Candida spp., 7 (2.51%) Streptococcus dysgalactiae, 5 (1.80%) Staphylococcus aureus, 4 (1.44) Streptococcus agalactiae, 4 (1.44%) Prototheca spp., 2 (0.72%) Mycoplasma bovis, 2 (0.72%) Mycoplasma spp., 2 (0.72%) Klebsiella spp. and 1 (0.36%) Serratia marcescens. Staphylococcal β-lactamase resistant gene was detected in 42 (51.8%) of 81 Staphylococcus spp. When Gram-negative and Gram-positive bacteria were compared, the incidence of negative bacteria was statistically higher (P <0.001). Comparing contagious and environmental pathogens, the incidence of environmental pathogens was found to be higher (P<0.001). The results of this thesis study showed once again the importance of milking hygiene and zootechnical conditions in farms, and the importance of protective measures, especially vaccination. Furthermore, Prototheca spp. that cause subclinical mastitis was sturdied for the first time in Turkey. In addition, it has once again revealed that the presence of Candida spp. in subclinical mastitis which shoud be also investigated.
Benzer Tezler
- Üzüm sularının pastörizasyonu ve kontsantresi sırasında hidroksimetilfurfural oluşumu üzerinde bir araştırma
Başlık çevirisi yok
ŞERİFE ŞAHİN
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiTarım Ürünleri Teknolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYDIN URAL
- ODTÜ Beden Eğitimi ve Spor bölümü 1985-1986 programının öğrencilerin fizyolojik kapasitelerine etkisi
Başlık çevirisi yok
ALİ AHMET DOĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Eğitim ve ÖğretimGazi ÜniversitesiBeden Eğitimi ve Spor Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EYYUP GÜNAY İSBİR
- İzmir bölgesi mandarinlerinin mikro-element durumu üzerinde araştırmalar
Başlık çevirisi yok
NİLGÜN SAATÇI
- Atatürk Üniversitesi Ziraat Fakültesi Ziraat İşletmesi'nde inek sütü maliyetleri
Başlık çevirisi yok
FAHRİ YAVUZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1987
ZiraatAtatürk ÜniversitesiTarım Ekonomisi Ana Bilim Dalı
PROF.DR. TAYYAR AYYILDIZ
- Kronik hastalığı olan çocukların hastalığa ve hastaneye yatmaya tepkileri
Başlık çevirisi yok
MEDİHA DOĞANAY