Bacillus cereus, B. tubtilis ve B. thuringiensis türü bakterilerin mısırda (Zea mays L.) protein ifade profili üzerine etkisinin araştırılması
Investigation of the effect of Bacillus cereus, B. subtilis and b. thuringiensis type of bacteria on the protein expression profile of corn (Zea mays L.)
- Tez No: 650652
- Danışmanlar: PROF. DR. SEMİH YILMAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Bacillus cereus, Bacillus subtilis, Bacillus thuringiensis, Rhizobium bakterileri, Rizobakteriler, SDS-PAGE, Zea mays, Bacillus cereus, Bacillus subtilis, Bacillus thuringiensis, Rhizobium bacteria, Rhizobacteria
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Serbest yaşayan, bitki gelişimini teşvik eden ve biyolojik savaş ajanı olarak kullanılabilen PGPR'ler son 30 yıldan fazla süredir tarımda kullanılmaktadır. PGPR grubunda olan Bacillus türü bakterilerin bitkilere uygulanması hakkında yürütülen araştırmalarda bitkiler üzerinde önemli verim artışları olduğu bildirilmiştir. Yapılan bu tez çalışmasının amacı Bacillus cereus, B. subtilis ve B. thuringiensis bakterilerinin önemli tahıl grubundan olan mısır (Zea mays L.) bitkisinde verim, gelişim ve protein ifade profilinde oluşturduğu farklılıkların belirlenmesidir. Araştırmada ACC deaminaz, fosfataz ve siderofor taşdığı bilinen yerel bakteriler mısır tohumlarına kaplama şeklinde uygulanmış ve bitki fiziksel gelişimi incelemeleri için verim parametreleri belirlenmiştir. Bitkilerin en üst kısımdaki taze yapraklarından protein extraksiyonu yapılmış SDS-PAGE ve 2D analizleri ile protein farklılıkları belirlenmiştir. Elde edilen sonuçlarda klorofil içeriği bakteri uygulanan mısır bitkilerinde kontrole göre önemli bulunmuştur (p<0.05). Ayrıca kök yaş ağırlıkları bakteri uygulanan mısır bitkilerinde kontrol bitkilerine göre istatiksel olarak yüksek bulunmuştur (p<0.05). Yine sürgün yaş ağırlıklarıda bakteri uygulanan bitkilerde kontrol bitkilerine göre istatiksel olarak yüksek bulunmuştur (p<0.05). SDS-PAGE ve 2D de Bacillus sp. KH16.2 (MH847787), Bacillus thuringiensis SY49.1 (MW197418) ve Bacillus sp. KH6.4 bakteri uygulamaları yapılan bitkilerde kontrole göre artış ve azalış yönünde ifade farklılıkları belirlenmiştir. Sonuç olarak mısır bitkisine uygulanan bakterilerin hem verim parametrelerinde hem de protein ifade profilinde farklılık oluşturduğu belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Plant growth promoting free living and biological warfare agents as PGPRs have been used in agriculture for more than 30 years. Studies conducted on the application of Bacillus type of bacteria as PGPRs on plants have reported significant yield increases. The aim of this study is to determine the effect of local Bacillus cereus, B. subtilis and B. thuringiensis species strains on the growth, yiled and protein expressin profile of maize (Zea mays L.), which is an important cereal crop. The local bacterial species known to carry ACC deaminase, phosphatase and siderofore were applied as seed coating and yield parameters were determined on plant physical developments. Protein extraction was performed using the upper fresh leaves of the plants and expressional differences were determined through SDS-PAGE and 2D gel electrophoresis. Results indicated that, chlorophyll content in corn plants treated with bacteria were significant when compared with control plants (p <0.05). Also, root dry weights of plants treated with bacteria were significantly higher compared with that of control plants (p <0.05). Shoot fresh weight in treated plants were significantly higher than that of control plants (p <0.05). In plants with Bacillus sp. KH16.2 (MH847787), Bacillus thuringiensis SY49.1 (MW197418) and Bacillus sp. KH6.4 species application SDS-PAGE and 2D analysis revealed considerable expressional differences both as up and down regulations compared with control groups. In conclusion, it was determined that the bacteria applied to the corn plants gave rise to differences in both yield parameters and protein expression profiles.
Benzer Tezler
- Bacillus cereus, Bacillus subtilis, Bacillus thuringiensis bakterilerinin ACC deaminaz (1-aminosiklopropan-1 karboksilat) aktivitelerinin araştırılması
Investigating the ACC deaminase (1-aminociclopropan-1 carboxylat) activities of Bacillus cereus, Bacillus subtilis, Bacillus thuringiensis bacteria
GÜLSÜM COŞKUN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
ZiraatErciyes ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEMİH YILMAZ
- Çeşitli gıdalarda bacillus cereus toksinlerinin varlığı ve tiplendirilmesi
The presence of bacillus cereus toxins and classification of their toxins in various foods
BAŞAK GÖKÇE ÇÖL
Doktora
Türkçe
2014
Besin Hijyeni ve Teknolojisiİstanbul ÜniversitesiBesin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HARUN AKSU
- Çiğ sütte bacillus cereus sayılması için yöntem modifikasyonları üzerine çalışmalar
Study of method modifications for enumeration of bacillus cereus in raw milk
SELİN KALKAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
Gıda MühendisliğiAnkara ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF.DR. KADİR HALKMAN
- Enterotoksijenik bacillus cereus'un çiğ köftede enterotoksin oluşturma yeteneğinin belirlenmesi
The detection of the ability to growth and enterotoxin production of bacillus cereus in raw meatball
SEVDA PEHLİVANLAR
Doktora
Türkçe
2003
Besin Hijyeni ve TeknolojisiAnkara ÜniversitesiBesin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. U. TANSEL ŞİRELİ
- Bacıllus cereus sensu lato grubu bakterilerin yeşil yapraklı sebzelerden izolasyonu ve toksin genlerinin belirlenmesi
Isolation of Bacillus cereus group bacteria from fresh salad vegetables and determination of toxin genes
BÜŞRA SULTAN ÇETİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
MikrobiyolojiSüleyman Demirel ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YASİN TUNCER