Evaluation of microRNAs (MIR-92A, MIR-126, MIR-195, MIR-214, MIR-224 and MIR-1247), as predictive markers of colorectal cancer (CRC) and/or prognostic factor in Turkish population
Türk popülasyonunda mikroRNA'larin (MİR-92a, MİR-126, MİR-195, MİR-214, MİR-224 ve MİR-1247), kolorektal kanser (CRC) tanı ve / veya prognostik faktör olarak değerlendirilmesi
- Tez No: 637073
- Danışmanlar: PROF. DR. SADRETTİN PENÇE
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Moleküler Tıp, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Biyobelirteçler, Biyobelirteçler-tümör, Kolorektal neoplazmlar, Mikro RNA, Neoplazmlar, RNA, Biomarkers, Biomarkers-tumor, Colorectal neoplasms, Micro RNA, Neoplasms, RNA
- Yıl: 2020
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kolorektal Kanser (Kalın Bağırsak Kanseri), multifaktöriyel bir hastalık olup, ölümcül kanserlerden biridir. Geç tanı konan hastalar için kötü bir prognoz vardır. Patogenezin moleküler düzeyde tam olarak anlaşılması, CRC'nin saptanması ve tedavisi ile ilgili önemli sonuçlara yol açabilir. Ayrıca, erken non-invaziv tanısal biyobelirteçlerin kurulması, hastalık tedavisinin ve genel survi seyrine yardımcı olacaktır. MikroRNA'lar, kanserin ilerlemesinde kritik unsurlar olup kanda saptanabilen aday biyobelirteçlerdir. miR-195, miR-92a, miR-126, miR-1247, miR-214 ve miR-224 seviyelerini CRC evreleriyle ilişkilendirmek ve Türk popülasyonundaki hasta ve kontrol grubundan örnekleri karşılaştırmak için altı miRNA'nın dolaşım ifadelenme seviyesini inceledik. 40 Kolorektal kanserli ve 40 kontrol altındaki bireylerin miRNAlarındaki ifade seviyelerinin istatistiksel analizi için qRT-PCR uygulayıp, tek yönlü ANOVA ve Pearson korelasyon testi kullandık. Çalışmamızta, miRNA'ların (miR-195, miR-224, miR-126-3p ve miR-1247) kat değişimine sahip kontrol grubuna kıyasla hastanın serumunda önemli ölçüde downregüle olduğu, (sırasıyla -18, -6.4, -9 ve -11) 0.05.'ten küçük bir p değeri ile miRNA'lar (miR-214 ve miR-92a) kanserde upregüle edilirken, hastalar ve kontrol vakaları arasında düzenli olarak 6.6 ve 35 kat değişimi vardır. İlginç bir şekilde, farklı kanser evreleri arasında ekspresyon seviyesinde önemli bir fark olmasına rağmen MiRNA'ların sigara içme, yaş ve cinsiyete göre ekspresyon düzeyinde önemli bir fark yoktur. Fakat mir-1247 seviyesi, sigara içen grupta daha yüksekti. Sonuç, kolorektal kanserde bu miRNA'yı biyobelirteç olarak kullanma olasılığının olduğunu gösterir.
Özet (Çeviri)
Colorectal Cancer (CRC) is one of deadly cancer; It is a multifactorial disease. There is a poor prognosis for patients who diagnosed late. Complete understanding of the pathogenesis at the molecular level could have significant implications concerning the detection and treatment of CRC. Moreover, establishing early non-invasive diagnostic biomarkers will aid the course of the disease treatment and overall survival. MicroRNAs are critical elements in the progression of cancer and are candidate biomarkers detectable in blood. We studied the expression level of circulating level of six miRNA, namely; miR-195, miR-92a, miR-126, miR-1247, miR-214, and miR-224, to correlate their level with CRC stages and compare the samples from patients and control group among the Turkish population. We performed qRT-PCR, to detect the expression level of miRNAs in 40 patients have colorectal cancer and 40 control individuals, for statical analysis, we used one-way ANOVA and Pearson correlation test. Our study revealed that miRNAs (miR-195, miR-224, miR-126-3p and miR-1247) are significantly downregulated in patient's serum compared with the control group with a fold change (-18, -6.4, -9 and -11, respectively), with a p-value less than 0.05. while miRNAs (miR-214 and miR-92a) are upregulated in cancer, having 6.6 and 35 fold-change orderly between the patients and control cases. Interestingly, there is a significant difference in expression level among different cancer stages. There is an insignificant difference in the expression level of miRNAs based on smoking, age and gender. However, mir-1247 was higher among the smoker group. The result indicates the possibility of using those miRNA as biomarkers in colorectal cancer.
Benzer Tezler
- Aşırı aktif mesaneli hastalarda ADRB3, ARHGEF10, ROCK2 gen polimorfizmlerinin ve bu genlerle ilgili mikroRNA'ların klinik bulgular ile ilişkisi
Relation of ADRB3, ARHGEF10, ROCK2 gene polymorphisms and miRNAs related to these genes to clinical findings in overactive bladder patients
ELİF FIRAT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
BiyokimyaPamukkale ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HÜLYA AYBEK
- Hematolojik kanserlerde miRNA ifade düzeyleri ve tedaviye yanıt arasındaki ilişkinin araştırılması
The releationship between micro RNA (miRNA) expression levels and response to treatment in hematologic malignancies
HALİME SABANCI
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Moleküler TıpGaziantep ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SİBEL OĞUZKAN BALCI
- Diyabetik nefropatili hastalarda miR-184, miR-98, miR-185, miR-196a-3p ve miR-203 ekspresyon düzeyleri ve hastalık şiddeti ile ilişkisinin değerlendirilmesi
Evaluation of miR-184, miR-98, miR-185, miR-196a-3P and miR-203 expression levels and relationship between disease aktivity in patients with diabetic nephropathy
İSMET EROĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Endokrinoloji ve Metabolizma HastalıklarıSüleyman Demirel Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HAKAN KORKMAZ
- Aktif akciğer tüberkülozunun erken tani ve prognozunda MIR-29a, MIR-144, MIR-146A ve MIR-155 ile IL-6, TNF-α, IFN-γ, IL-17 ve IL1-β'nin prediktif marker olarak değerlendirilmesi
Evaluation of MIR-29a, MIR-144, MIR-146A and MIR-155 with il-6, TNF-α, IFN-γ, IL-17 and il1-β as A predictive marker for early diagnosis and prognosis of active pulmonary tuberculosis
FIRAT KARSLI
Doktora
Türkçe
2020
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATİH KÖKSAL
- Osteogenezis ımperfektalı hastalarda plazma mirna (MİR26a, MİR29A, MİR133A) ekspresyon düzeylerinin değerlendirilmesi
Evaluation of serum mirna MİR-26A, MİR-29A, MİR-133A) expression levels in patients with osteogenesis imperfecta
LATİFE ÖZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıAkdeniz ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. BANU NUR