Effect of silencing ERG transcription factor on epithelial and mesenchymal transition markers in H596 lung cancer cell line
H596 NSCLC akciğer kanser hücre hattında ERG transkripsiyon faktörünün susturulmasının EMD belirleycileri üzerine etkisi
- Tez No: 613028
- Danışmanlar: DOÇ. DR. GÜLAY BULUT
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Küçük Hücreli Akciğer Kanseri (NSCLC), Epitel ve Mezenkimal Geçiş (EMT), ETS-İlişkili Gen (ERG), siRNA Transfeksiyonu, qRT-PCR, Non-Small Cell Lung Cancer (NSCLC), Epithelial to Mesenchymal Transition (EMT), ETS-Related Gene (ERG), siRNA transfection, qRT- PCR
- Yıl: 2018
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Bahçeşehir Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Akciğer kanseri dünya çapında en çok ölümle sonuçlanan kanser türlerinden biri olmakla beraber hastaların yaklaşık yüzde 40`ında yayılma eğilimi göstererek ölümlere sebebiyet vermektedir. NSCLC hastaları, akciğer kanserlerinin yüzde 85`ini olusturmaktadır. Epitel mezenkimal dönüşüm (EMD) embriyon gelişimi ve kanser yayılımı süreçlerinde önemli rol üstlenir. EMD'den sorumlu olan membran proteinlerinin işlevini yitirmesi ile hücrelerin mezenkimal özellik kazanması ile ilişkili olarak hastalığın gidişatı konusunda belirsizlik yaratarak kemoterapi sırasında ilaç direnci oluşmasına neden olur. EMD, hücreler arası baglantıları etkileyerek hücre göçü ve yayılmasını tetikler. Bir transkripsyon faktörü olan ERG, ETS-ilişkili gen ailesi üyesidir ve kanser metastazını ilk olarak prostat kanserinde, daha sonrasında diğer kanser türlerinde tetiklediği bildirilmiştir. Bu bilgilere dayanarak, akciğer kanserinde ERG`nin EMD oluşumunu tetikleyebileceği düşünülmüştür. Akciğer kanserinde ERG`nin EMD oluşumu üzerindeki olası etkisini incelemek amacıyla, ERG siRNA kullanılarak H596 NSCLC hücre hattında ERG ifadesi mRNA düzeyinde susturulmuştur. ERG geninin susturulmasını takiben EMD belirteçleri olan E-cadherin, Vimentin, SNAIL1, SLUG ve ZEB ifade düzeyleri qRT PCR ile analiz edilmiştir. Sonuç olarak, ERG'nin susturulması, Vimentin, SNAIL1, SLUG ve ZEB ifade düzeylerini azalttığıve E-cadherin`nin regulasyonunu arttırarak EMD'yi devreden çıkardığı gözlemlenmiştir. Bu veriler, yeni akciğer kanseri ilaçlarının geliştirilebilmesi için ERG'nin önemli bir hedef olabileceğini göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Lung cancer is one of the most fatal cancer types that causes death worldwide, and has 40% of incidence in distant metastatic activity. NSCLC is present in more than 85% of lung cancer cases. Epithelial to mesenchymal transition (EMT) is a crucial event during embryonic development and metastatic capability of cancer cells. EMT has been correlated with drug resistancy, poor prognosis due to the down-regulation of the endothelial cell membrane (ECM) receptors,development of mesenchymal-like cell structures and various functional properties often during chemotherapy. EMT disintegrates intercellular tight junctions, enhancing cell migration and invasion, respectively. ERG is a transcription factor and a member of ETS-related gene family. It was first discovered to promote EMT in prostate cancer and subsequently in many other types of cancer. According to this knowledge, we hypothesized that ERG may also trigger EMT in lung cancer. In order to prove the effect of ERG on EMT, ERG siRNA was successfully used to knock-down the ERG mRNAs in H596 NSCLC cell line. Following ERG gene silencing, expression of EMT marker genes including E-cadherin, Vimentin, SNAIL1, SLUG and ZEB1 were determined on mRNA level using qRT-PCR. Consequently, ERG knockdown can upregulate the EMT markers such like Vimentin, SNAIL1, SLUG and ZEB transcription factors. These results proved that ERG might be an exclusive target for the development of new therapeutic approaches in lung cancer in the future.
Benzer Tezler
- The effect of silencing ERG transcription factor on EMT markers in H1944 lung cancer cell line
H1944 NSCLC akciğer kanser hücre hattında erg transkripsiyon faktörünün susturulmasının emd belirleyicileri üzerine etkisi
MOHAMMED OSMAN ABDELKARIM MOHAMMED MOHAMMED OSMAN ABDELKARIM MOHAMMED
Yüksek Lisans
İngilizce
2017
BiyomühendislikBahçeşehir ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜLAY BULUT
- The effect of virus induced gene silencing of fasassociated factor 1 in Blumeria graminis infected barley
Virüs ile susturulmuş FAF1 geninin Blumeria graminis ile enfekte olmuş arpadaki etkisi
BOZHANAJ KRESHNİK
Yüksek Lisans
İngilizce
2009
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MAHİNUR AKKAYA
- Genç kadınlarda kendini susturma ve toplumsal cinsiyet rollerinin kimlik işlevleri üzerindeki etkisi
Effect of self silencing and gender roles on functions of identity in young women
MEVA DEMİR KAYA
- Pankreas hücre hattında CRISPR/Cas9 Yöntemi ile collagen triple helix repeat containing 1 (CTHRC1) geninin susturulmasının matriks metalloproteinaz (MMP) protein ifadesi ve tümörün metastatik kapasitesi üzerine etkisinin incelenmesi
Investigation of the effect of silencing collagen triple helix repeat containing 1 (CTHRC1) gene by CRISPR/Cas9 Method on matrix metalloproteinase (MMP) protein expression and metastatic capacity of tumor in pancreatic cell line
GÜLHAN DEMİR
Doktora
Türkçe
2022
GenetikKocaeli ÜniversitesiTıbbi Genetik ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SEDA EREN KESKİN
- PANC-1 ve BXPC-3 hücre hatlarında CRISPR/Cas9 yöntemi ile NUSAP1 geninin susturulmasının pankreas kanserinde Epitelyal-Mezenkimal Transizyon (EMT) ve tümör progresyonu üzerine etkisinin araştırılması
Investigation of the effect of NUSAP1 gene silencing by CRISPR/Cas9 method in PANC-1 and BXPC-3 cell lines on Epithelial-Mesenchymal Transition (EMT) and tumor progression in pancreatic cancer
MERVE GÖKBAYRAK