The effect of silencing ERG transcription factor on EMT markers in H1944 lung cancer cell line
H1944 NSCLC akciğer kanser hücre hattında erg transkripsiyon faktörünün susturulmasının emd belirleyicileri üzerine etkisi
- Tez No: 453767
- Danışmanlar: DOÇ. DR. GÜLAY BULUT
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: NSCLC, ERG, EMD, siRNA transfeksiyonu, H1944, NSCLC, ERG, EMT, siRNA transfection, H1944
- Yıl: 2017
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Bahçeşehir Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Akciğer kanseri, en yaygın kanser tiplerinden biridir. Aynı zamanda,dünya çapında kanser sebepli ölümlerin en başında yer almaktadır. NSCLC hastaları, akciğer kanserli hastaların yüzde seksen'ine karşılık gelmektedir. Epitel mezenkimal dönüşüm (EMD) yöntemi, ilaca karşı direnç ve zayıf prognoz ile ilişkili olan metastatik ve invaziv bulguların elde edilmesinde hayati önem taşımaktadır. ETS-ilişkili gen olan ERG, farklı kanser tiplerinde EMD'yi başlatan gendir. Akciğer kanserinde EMD oluşumu üzerinde ERG etkisini incelemek amacıyla, H1944 NSCLC hücre hattında ERG ifadesi siRNA kullanılarak mRNA düzeyinde susturulmuştur. ERG geninin susturulmasını takiben EMD belirteçleri olan E-cadherin, Vimentin, SNAIL1, SLUG ve ZEB1 ifade düzeyleri belirlen miştir. Sonuç olarak, ERG'nin saf dışı bırakılması, SNAIL1, SLUG ve ZEB1 transkripsiyon faktörlerini down regüle ederek EMD'yi tersine çevirebileceği gözlemlenmiştir. Bu veriler, yeni akciğer kanseri ilaçlarının geliştirilebilmesi için ERG'nin önemli bir hedef olabileceğini göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Lung cancer is one of the most common types of cancer. It is also the first cause of cancer deaths worldwide. NSCLC patients account for more than 80 percent of lung cancer patients. Epithelial mesenchymal transition (EMT) is vital for cancer to acquire metastatic and invasive abilities, which have been correlated with drug resistance and poor prognosis. ERG, an ETS-related gene, was found to promote EMT in different types of cancer. In order to assess the effects of ERG on EMT in lung cancer, ERG gene was knocked down in the mRNA level using ERG siRNA in H1944 NSCLC cell line. The effects of ERG silencing were evaluated on expression of EMT markers, E-cadherin, Vimentin, SNAIL1, SLUG and ZEB1 in the mRNA level. The results showed that ERG knock down can reverse EMT through downregulating SNAIL1, SLUG and ZEB1 transcription factors. These data suggest that ERG could be an important target for the development of novel lung cancer drugs.
Benzer Tezler
- Effect of silencing ERG transcription factor on epithelial and mesenchymal transition markers in H596 lung cancer cell line
H596 NSCLC akciğer kanser hücre hattında ERG transkripsiyon faktörünün susturulmasının EMD belirleycileri üzerine etkisi
MEHMET KERİM AYDIN
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
BiyomühendislikBahçeşehir ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜLAY BULUT
- The effect of virus induced gene silencing of fasassociated factor 1 in Blumeria graminis infected barley
Virüs ile susturulmuş FAF1 geninin Blumeria graminis ile enfekte olmuş arpadaki etkisi
BOZHANAJ KRESHNİK
Yüksek Lisans
İngilizce
2009
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MAHİNUR AKKAYA
- Pankreas hücre hattında CRISPR/Cas9 Yöntemi ile collagen triple helix repeat containing 1 (CTHRC1) geninin susturulmasının matriks metalloproteinaz (MMP) protein ifadesi ve tümörün metastatik kapasitesi üzerine etkisinin incelenmesi
Investigation of the effect of silencing collagen triple helix repeat containing 1 (CTHRC1) gene by CRISPR/Cas9 Method on matrix metalloproteinase (MMP) protein expression and metastatic capacity of tumor in pancreatic cell line
GÜLHAN DEMİR
Doktora
Türkçe
2022
GenetikKocaeli ÜniversitesiTıbbi Genetik ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SEDA EREN KESKİN
- PANC-1 ve BXPC-3 hücre hatlarında CRISPR/Cas9 yöntemi ile NUSAP1 geninin susturulmasının pankreas kanserinde Epitelyal-Mezenkimal Transizyon (EMT) ve tümör progresyonu üzerine etkisinin araştırılması
Investigation of the effect of NUSAP1 gene silencing by CRISPR/Cas9 method in PANC-1 and BXPC-3 cell lines on Epithelial-Mesenchymal Transition (EMT) and tumor progression in pancreatic cancer
MERVE GÖKBAYRAK
- LRP5 susturma işleminin glioblastom hücrelerindeki anti-kanser etkinliğinin tanımlanması
Identification of the anti-cancer effect of silencing of LRP5 in glioblastoma cells
ASLIHAN KÜÇÜK
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
GenetikErzurum Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HASAN ONUR ÇAĞLAR