Meme kanserinin moleküler alt tiplerinde DNA hasarı onarımında tıp60 proteininin rolünün incelenmesi
Examining the role of tip60 protein in repair of DNA damage in molecular subtypes of breast cancer
- Tez No: 526345
- Danışmanlar: PROF. DR. SEVGİ AKAYDIN, PROF. DR. SEMRA DEMOKAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Meme kanseri, ATM, p53, CHK2, BRCA1, H2AX, Tip60, Biyobelirteçler-tümör, DNA, DNA hasarı, Gen ifadesi, Genler-P53, Meme neoplazmları, Neoplazmlar, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Breast Cancer, ATM, p53, CHK2, BRCA1, H2AX, Tip60, Biomarkers-tumor, DNA, DNA damage, Gene expression, Genes-P53, Breast neoplasms, Neoplasms, Polymerase chain reaction
- Yıl: 2018
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kanser, kardiyovasküler hastalıklardan sonra ikinci sırada yer alan ölüm nedenidir. Dünyada kadınlarda görülen kanser türlerinin içinde akciğer kanserinden sonra ikinci sırada yer alan meme kanseri, ülkemizde ilk sırada yer almaktadır. Son yıllarda yapılan çalışmalarda, birçok tümör hücresinin DNA hasar yanıt mekanizmasını bozan mutasyonlar taşıdığı giderek daha fazla kabul görmeye başlamıştır. Bu nedenle, DNA hasarı onarım mekanizması bozuk hücrelerde, kanser tedavilerinin tasarlanmasına büyük önem verilmiştir. Çalışmamızda, meme kanserinin moleküler alt tiplerinde Tip60, ATM, p53, CHK2, BRCA1 ve H2AX mRNA ekspresyon seviyelerinin qRT-PCR ile ve protein ekspresyon seviyelerinin Western Blot metodu ile ölçülerek elde edilen sonuçları arasındaki ilişkinin tespiti amaçlanmıştır. Bu amaçla meme kanseri tanısı konan 58 hastadan doku örnekleri alınmıştır. Kontrol olarak, meme küçültme ameliyatı için kliniğe başvuran 8 sağlıklı kişi çalışmaya dahil edilmiştir. Çalışma sonuçlarına göre, Tip60 ekspresyonu hastaların % 55'inde, ATM % 59'unda, BRCA1 % 57'sinde, H2AX % 48'inde, CHK2 % 66'sında ve p53 % 43'ünde eşlenik normal dokuya oranla tümör dokuda azalmıştır. Moleküler alt tiplere göre değerlendirildiğinde, özellikle Luminal B ve Her2 ile zenginleştirilmiş Luminal B gruplarında yolağa ait bütün genlerin ekspresyonlarının normal dokularda tümör dokulara göre belirgin derecede yüksek bulunmuştur. Protein ekspresyonları incelendiğinde, total hasta grubunda ve Luminal A grubunda Tip60 ve H2AX düzeyleri tümör dokularda daha yüksek bulunurken, CHK2 düzeylerinin normal dokularda yüksek olduğu tespit edilmiştir. Tüm genlerin gerek normal doku gerekse tümör doku mRNA ekspresyonları arasında istatistiksel olarak anlamlı pozitif korelasyonlar gözlenmiştir (p<0.05). Genlerin mRNA ve protein ekspresyonları arasında belirgin bir korelasyon gözlenmemiştir. Sonuç olarak, Tip60 mRNA ekspresyonlarının kanserli hastalarda diğer genlere göre daha düşük olduğu ve hastaların çoğunda H2AX ve p53 hariç diğer genlerin normal dokularda tümör dokulara göre daha yüksek olduğu görülmektedir. Protein ekspresyonları ile mRNA ekspresyonları arasında korelasyon gözlenmemesinin, proteinlerin aktif olan fosforile şekillerinin ölçülmemesinden kaynaklandığını düşünmekteyiz.
Özet (Çeviri)
Cancer rows the second leading causes of death following cardiovascular diseases. Breast cancer which is the most common cancer after lung cancer in women worldwide is the first rank in our country. In recent years studies have begun to become accepted that many tumor cells carry mutations that disrupt the DNA damage response mechanism. Therefore, great importance for the design of cancer treatments in cells which with damaged DNA repair mechanism. In our study, it was aimed to determine the relationship between the mRNA expression levels of Tip60, ATM, p53, CHK2, BRCA1 and H2AX mRNA in molecular subtypes of breast cancer by qRT-PCR and the results obtained by Western blotting of protein expression levels. For that purpose, tissue and serum samples were taken from 58 patients diagnosed with breast cancer. As controls, 8 healthy persons admitted to the clinic for breast reduction surgery were also included to the study. According to the study results, tumor tissue decreased in 55% in Tip60, 59 % in ATM, 57 % in BRCA, 48 % in H2AX, 66 % in CHK2 and 43 % in p53 of patients compared to the equivalent normal tissue. When evaluated according to molecular subtypes, expression of all genes in the pathway was found significantly higher in normal tissues than in tumor tissues especially in Luminal B groups and Luminal B enriched with Her2. When protein expressions are examined, the levels of Tip60 and H2AX were higher in tumor tissues and CHK2 levels were higher in normal tissues in total and Luminal A groups. Statistically significant positive correlations were observed between tumor tissue mRNA expressions of both normal and normal tissues (p <0.05)08. There was no significant correlation between the mRNA and protein expressions of the genes. As a result, the expression of Tip60 mRNA is lower in cancer patients than in other genes. In the majority of patients, other genes except H2AX and p53 are found to be higher in normal tissues than tumor tissues. No correlation was observed between protein expressions and mRNA expression and we think, it is due to the fact that the active forms of the phosphorylated proteins are not measured.
Benzer Tezler
- Effect of doxorubicin and microrna-140-3p on pd-L1 expression in colon cancer
Kolon kanserinde doxorubıcın ve mıcrorna-140-3p'nin pd-L1 ifadesine olan etkisi
NOEL MOPOUGUINI NABA
Doktora
İngilizce
2020
Allerji ve İmmünolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
Assoc. Prof. Dr. AYÇA SAYI YAZGAN
- Targeting circulating breast cancer stem cells via mTOR and WNT inhibitors after bone metastasis
Sirküle meme kanseri kök hücrelerinin kemik metastazı sonrası mTOR ve WNT inhibitörleri ile hedeflenmesi̇
ÖZLEM ALTUNDAĞ ERDOĞAN
Doktora
İngilizce
2025
BiyokimyaHacettepe ÜniversitesiKök Hücre Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BETÜL ÇELEBİ SALTIK
- Effects of cholinergic receptor nicotinic alpha 5 (CHRNA5) RNAi on apoptosis, DNA damage response, drug sensitivity, and hsa-miR-495-3p overexpression in breast cancer
Kolinerjik reseptör nikotinik alfa 5 (CHRNA5) RNAi uygulamasının, meme kanserinde apoptoz, DNA hasarı yanıtı, ilaç duyarlılığı ve hsa-miR-495-3p'nin yüksek ifadesine etkisi
ŞAHİKA CINGIR KÖKER
Doktora
İngilizce
2018
Genetikİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÖZLEN KONU KARAKAYALI
- Triple negatif meme kanserinde elimusertib ATR inhibitörünün anti-kanser etkisinin belirlenmesi
Determination of anti-cancer effect of elimusertib ATR inhibitor on triple-negative breast cancer
AYTEN HACIEFENDİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Tıbbi BiyolojiSakarya ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GAMZE GÜNEY ESKİLER
- Meme kanserinde ekstraselüler genomik materyallerin HMGB1 üzerindeki etkisinin incelenmesi
Investigating the effect of extracellular genomic materials on HMGB1 in breast cancer
GÜLŞAH TUNA
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Genetikİstanbul ÜniversitesiGenetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SELÇUK SÖZER TOKDEMİR