Geri Dön

Epigenetik bir baskılayıcı olan RNF2 genini hedefleyen miRNA' ların belirlenmesi ve metastaz ve invazyona etkisinin araştırılması

Identification of miRNAs that target an epigenetic supressor RNF2 gene and its effect on metastasis and invasion

PDF İndir

  1. Tez No: 524152
  2. Yazar: CEYDA OKUDU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SİBEL OĞUZKAN BALCI
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Meme kanseri, metastaz, miRNA, polycomb, RNF2, Epigenez-genetik, Genler, Meme neoplazmları, Neoplazm metastazları, Neoplazmlar, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Breast cancer, metastasis, miRNA, polycomb, RNF2, Epigenesis-genetic, Genes, Breast neoplasms, Neoplasm metastasis, Neoplasms, Polymerase chain reaction
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Meme kanseri kadınlar arasında en sık görülen ve yüksek mortaliteye sahip bir kanser türüdür. Histopatolojik çeşitliliğinin yanı sıra karmaşık moleküler alt yapısı nedeniyle meme kanserinde tedavi hedefleri için moleküler çalışmalara ihtiyaç bulunmaktadır. RNF2, polycomb baskılayıcı kompleks içerisinde yer alan bağlandığı proteini ubikitinleyerek baskılayan bir proteindir. Embriyonik ve yetişkin evrede önemli rol oynayan RNF2' nin, bir çok metastatik kanser türünde ifadesinin artması ile beraber tümör baskılayıcı genleri susturması RNF2' ye onkojenik bir rol kazanmıştır. Bu çalışmada meme kanseri hücre hatlarında RNF2 gen ifade düzeyindeki değişimler ve bu genin miR-17-5p, miR-20a-5p ve miR-106b-5p tarafından baskılanıp baskılanmadığı analiz edilmiştir. Ayrıca bu miRNA' ların transfekte edilmesi ile metastaz ve invazyon üzerine etkisi incelenmiştir. Bunun için MCF-7, MDA-MB-231, SK-BR-3 ve ZR-75-1 meme kanseri hücre hatlarında miRNA transfeksiyonu öncesi ve sonrasında RNF2 gen ifade düzeyleri RT-PCR; protein ifade düzeyleri ise western blot ile analiz edilmiştir. Metastaz ve invazyon üzerine etkisi ise yara iyileşme ve boyden chamber yöntemleri kullanılarak saptanmıştır. RNF2' nin, MDA-MB-231 ve SK-BR-3 hücre hatlarında sırasıyla 4,1 ve 7,1 kat ifadesinin arttığı tespit edildi (sırasıyla p=0,048 ve 0,045). miR-17-5p ve miR-20a-5p miRNA transfeksiyonu sonrasında MDA-MB-231 hücre hattında RNF2 gen ifade düzeyinde anlamlı bir azalış saptandı (sırasıyla 3,5 ve 7,3 kat) (sırasıyla p= 0,045 ve 0,039). Protein düzeyinde ise MDA-MB-231 hücre hattında her üç miRNA' nın da RNF2 proteinini azalttığı saptandı. Ayrıca miR-17-5p ve miR-20a-5p metastaz ve invazyonu baskılarken miR-106b-5p' nin baskılamadığı saptandı. Sonuç olarak, metastatik yeteneği fazla olan meme kanseri hücrelerinde RNF2' nin ifadesi artmıştır. miR-17-5p ve miR-20a-5p, RNF2 aracılığı ile metastaz ve invazyonu baskılamaktadır. RNF2 meme kanseri için prognostik bir belirteç olmaya aday bir gen olarak değerlendirilebilir.

Özet (Çeviri)

Breast cancer is the most common type of cancer among women and has a high mortality rate. In addition to its histopathological diversity, new molecular and molecular investigations are needed in the treatment of breast cancer due to its complex molecular background. RNF2 is a protein that is repressed by ubiquitin binding of the protein bound in the polycomb repressor complex. RNF2, which plays an important role in a number of biological processes in embryonic development and adult stage, has acquired an oncogenic role due to overexpression in several types of metastatic cancers, as well as silencing tumor suppressor genes. In this study, changes in the level of RNF2 gene expression in breast cancer cell lines were analyzed and whether this gene was suppressed by miR-17-5p, miR-20a-5p and miR-106b-5p. Furthermore, the effect of transfection of these miRNAs on metastasis and invasion has been investigated. For this reason, RNF2 gene expression levels before and after miRNA transfection in MCF-7, MDA-MB-231, SK-BR-3 and ZR-75-1 breast cancer cell lines were analyzed by qRT-PCR and western blot analysis of protein expression levels. The effect on metastasis and invasion was observed using wound healing and dyed chamber methods. RNF2 was overexpressed 4.1 and 7.1fold in the MDA-MB-231 and SK-BR-3 cell lines, respectively (p=0,048 ve 0,045 respectively). A significant decrease in gene expression after miRNA transfection was observed in miR-17-5p and miR-20a-5p (3.5 and 7.3 fold, respectively) (p= 0,045 ve 0,039 respectively) at MDA-MB-231 cell line. At the protein level, it was observed that all three miRNAs decreased RNF2 protein at MDA-MB-231 cell line. It was also observed that miR-17-5p and miR-20a-5p suppressed metastasis and invasion and miR-106b-5p could not suppress it. As a result, RNF2 is overexpressed in breast cancer cells with more metastatic ability. miR-17-5p and miR-20a-5p suppress RNF2 targeting and suppress metastasis and invasion in this direction. RNF2 may be considered as a candidate gene to be a prognostic marker for breast cancer.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    434207

    Identification of a novel experimental model to reveal mechanisms leading to epigenetic changes and subsequent activation of cancer testis genes in cancer

    Kanserde epigenetik değişimlere ve sonrasında kanser testis genlerinin aktivasyonuna sebep olan mekanizmaların ortaya çıkarılması için yeni deneysel modellerin tanımlanması

    BARIŞ KÜÇÜKKARADUMAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    Tıbbi Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ALİ OSMAY GÜRE

  2. Tez No

    775102

    Using Logistic Regression for analyzing epigenetic changes across some Tumor Supressor Genes for Liver Cancer

    Karaciğer kanseri için gerçek veri seti üzerinde bazı tümör baskılayıcı genlerdeki epigenetik değişikliklerin analizi için lojistik regresyon kullanımı ve örnek havuzlamanın etkileri

    HATİCE TÜL KÜBRA AKDUR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2011

    BiyoistatistikWashıngton State Unıversıty

    İstatistik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NAIRANJANA DASGUPTA

  3. Tez No

    763429

    Mide kanserinin erken tanı ve takibinde yeni bir hedef olarak gankyrin ve CDO genleri promoter metilasyon değişikliklerinin değerlendirilmesi

    Evaluation of gankyrin and CDO genes promoter methylation changes AS A NEW target for early diagnosis and follow-up of gastric cancer

    SELİN KANKAYA

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Biyokimyaİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YILDIZ DİNÇER

  4. Tez No

    310097

    Meme kanserli olgularda her2 ve top2a gen düzensizlikleri ve kanserle ilişkili diğer genlerin epigenetik durumu ile ilişkilendirilmesi

    Association of her2/neu and top2a gene alterations with epigenetic status for other cancer related genes in breast cancer patients

    AYŞE FEYDA NURSAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    GenetikEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. OĞUZ ÇİLİNGİR

  5. Tez No

    791223

    Prostat kanserli bireylerde tümör baskılayıcı (GSTP1, PTEN ve NKX3.1) genlerin ekspresyonu ile beslenme ve yaşam tarzı belirleyicilerinin ilişkisinin değerlendirilmesi

    Evaluation of the association between expression of tumor suppressor (GSTP1, PTEN and NKX3.1) genes and nutrition and lifestyle determinants in individuals with prostate cancer

    TEVFİK KOÇAK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Beslenme ve DiyetetikGazi Üniversitesi

    Beslenme ve Diyetetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NİLÜFER TEK

Geri Dön