Gen transferinde diyot lazer cihazının kullanım potansiyelinin araştırılması
Investigation of usage potential of diode laser device in the process of gene transfer
- Tez No: 486873
- Danışmanlar: PROF. DR. GÖKHAN CORAL
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoteknoloji, Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Biology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2017
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Mersin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada, laboratuvar ölçeğinde tasarlanmış Diyot lazer cihazı ile gen transferi amaçlanmıştır. Lazer enerji dozu 0,4-0,8-1,6-3,2 ve 6,4 mW olarak belirlenirken; her doz 200, 400, 800, 1600, 3200 ms sürelerinde çalışılmıştır. Gen transfer çalışmaları iki ayrı hücre grubunda denenmiştir. Prokaryotik hücre olarak E. coli JM109 suşu seçilirken, ökaryotik hücre olarak insan periferal kan lenfositleri seçilmiştir. Diyot lazer cihazının transfer edilecek hücrelere olası etkilerini belirlemek için mutant S. typhimurium TA98-100 suşları ile gerçekleştirilen AMES mutajenite testi yapılmıştır. Ayrıca insan periferal kan lenfositlerinde genotoksisite çalışmaları gerçekleştirilmiştir. Bu kapsamda Kardeş Kromotid Değişimi, Mikroçekirdek ve Komet analizleri yapılmıştır. Bununla beraber sitotoksisite çalışmaları da yapılmıştır. Enerji yoğunluğunun 3,2 ve 6,4 mW olduğu maruziyetler insan periferal kan lenfositlerinde genotoksik etkiyi indüklemiştir. 0,4 ve 0,8 mW enerji dozları lenfositlerde mitotik indeksin artmasını sağlarken, diğer dozlar mitotik indeks ve proliferasyon indeksinin düşmesine sebep olmuştur. Ames testinin sonuçlarına göre, 6,4 mW enerji dozunun mutant S. typhimurium TA98-100 hücreleri üzerine öldürücü etki yaptığı belirlenmiştir. Doz ve sürenin artmasıyla hücrelerin olumsuz etkilendiği tespit edilmiştir. Yabani bakteri suşlarıyla yapılan uygulamada ise negatif kontrole göre lazerin tüm doz ve sürelerinin hücre çoğalmasını indüklediği belirlenmiştir. Bakterilerdeki transformasyon çalışmaları 0,4 ve 0,8 mW enerji yoğunluğunda ve 400 ve 800 ms sürelerinde başarılı sonuçlanmıştır. Transformasyon verimi en yüksek 0,8 mW ve 400 ms'de( 2.5x104) gerçekleşmiştir. Lenfositlerde ise en yüksek trasnformasyon frekansı 0,4 mW ve 800 ms'de gerçekleşmiştir. Transformasyonun gerçekleştiği dozların ve sürelerin hücreler üzerinde olumsuz etki göstermemesi bu tekniğin uygulanabilir bir yöntem olduğunu göstermektedir.
Özet (Çeviri)
In this study, it is aimed to carry out gene transfer studies with the Diode laser device designed manually at the laboratory scale. While laser energy dose is determined as 0,4-0,8-1,6-3,2 and 6,4 mW and, each dose was operated at 200, 400, 800, 1600, 3200 ms. Gene transfer studies were tested in two different cell groups. While E. coli strain JM109 was selected as prokaryotic cell, human peripheral blood lymphocytes were selected as eukaryotic cells. The AMES mutagenicity test was performed with the S. typhimurium TA98-100 strains to determine the possible effects of the diode laser device on the cells to be transferred. Additionally, genotoxicity studies have been performed in human peripheral blood lymphocytes. For this purpose, Sister Chromotid Exchange, Micronucleus and Komet analyzes were performed and in addition to this, cytotoxicity studies have also been carried out. Exposure times of energy absence 3.2 and 6.4 mW, induced genotoxicity effect in human peripheral blood lymphocytes. While 0.4 and 0.8 mW energy doses resulted in increased mitotic index in lymphocytes, other doses caused a decrease in mitotic index and proliferation index. According to the results of the Ames test, it was determined that the 6.4 mW energy dose had a lethal effect on the mutant S. typhimurium TA98-100 cells. It has been found that the cells are adversely affected by increasing dose and exposure time. In the application with wild-type strains, it was determined that all doses and durations of the laser induced proliferation compared to the negative control. Bacterial transformation studies resulted in successful outcome at 0.4 and 0.8 mW energy density for 400 and 800 ms, respectively. Transformation efficiency was highest at 0.8 mW and 400 ms (2.5x104). Whereas in lymphocytes, the highest transformation frequency was at 0.4 mW and 800 ms. The fact that dosages and durations of transformation don't adversely affect the cells proves that, this technique is applicable.
Benzer Tezler
- The synthesis, SLIC based labeling, and characterization of microbial rhodopsins by using custom build spectroscopic methods
Mikrobiyal rodopsin membran proteinlerin sentezi, SLIC yöntemiyle etiketlenmesi, ve spektroskopik yöntemlerle karazterizasyonu
CANSU ÇAVDAR
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DOÇ. DR. HALİL BAYRAKTAR
- 4-iyodo-piridin-2-karboksilik asit içeren Mn(II) kompleksinin yapısal, spektroskopik ve doğrusal olmayan optik özelliklerinin incelenmesi
Investigation of the structural, spectroscopic and nonlinear optical properties of the 4-iodo-pyridine-2-carboxylic acid-containing Mn(II) complex
OSMAN KURT
Yüksek Lisans
Türkçe
2026
Fizik ve Fizik MühendisliğiSakarya ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖMER TAMER
- Gen transferi için uyarı-cevap özellikli polimerik taşıyıcıların tasarımı, hücre kültüründe transfeksiyon ve bu polimerlerin kan elementleriyle etkileşimi
Designing of stimuli-responsive polymeric carriers for gene transfer, transfection on cell culture and interactions of these polymers with blood components
TÜLİN İBŞİRLİOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2003
BiyomühendislikHacettepe ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERHAN BİŞKİN
- Gen tedavisi amaçlı nanotaşıyıcı platformların geliştirilmesi
Development of nanocarrier platforms for gene therapy
HAZAL PEKASIL
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Eczacılık ve FarmakolojiAnkara ÜniversitesiFarmasötik Teknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ASUMAN BOZKIR
- Buğdayda (Triticum aestivum l.) gen transferi ile herbisite (Dalapon) dayanıklı bitkilerin elde edilmesi
Başlık çevirisi yok
HATİCE YÜCE