Geri Dön

Real-time PCR as a molecular tool for the enumeration of probiotics in commercial products

Ticari ürünlerdeki probiyotiklerin sayımı için moleküler bir araç olarak gerçek zamanlı PCR

PDF İndir

  1. Tez No: 449136
  2. Yazar: ÖDÜL ÖZ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. AYŞE HANDAN BAYSAL, DOÇ. DR. ALPER ARSLANOĞLU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2016
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

16S rDNA'yı hedefleyen Kantitatif Real-Time PCR (qPCR) analizleri sırasıyla Bifidobacterium, Lactobacillus ve Bifidobacterium animalis subsp. lactis BB-12, Lactobacillus acidophilus LA-5 cins ve tür spesifik saptama aracı olarak geliştirilmiştir. Standart eğriler bu probiyotik bakterilerin sayısını ölçmek için oluşturuldu. Standart eğrilerin lineer regresyonu probiyotik kültür hücrelerinin log sayılarıyla Ct değerleri arasında yüksek korelasyon göstermektedir. Analiz yüksek verimlidir ve saptama limiti 1,54 ng DNA (104 hücreye karşılık gelen DNA miktarı) olarak tahmin edilmiştir. Sonuçlar qPCR yönteminin B. animalis subsp. lactis BB-12 ve L. acidophilus LA-5 probiyotik takviyelerinin saptanması ve miktarının belirlenmesi için hızlı, duyarlı ve spesifik bir araç olarak çok yararlı olabileceğini göstermektedir. FTIR spektroskopisi ticari probiyotik ürünlerdeki farklı mikroorganizmaların oranlarını belirlemek için ilk defa kullanılmıştır. FTIR analizi ayrıca B. animalis subsp lactis BB-12 ve L acidophilus LA-5 saf probiyotik kültürler için yapılmıştır. Bu çalışmada elde edilen sonuçlar, FTIR spektroskopisinin probiyotiklerin hücre bileşenleri ve bu bileşenlerin oranlarının belirlenmesinde ve ayrıca saptanması ve tanımlamasında hızlı bir yöntem olarak potansiyeli olduğunu göstermiştir.

Özet (Çeviri)

Quantitative Real-Time PCR (qPCR) assays targeting the 16S rDNA was developed as a genus and species specific detection tool for Bifidobacterium and Lactobacillus, and Bifidobacterium animalis subsp. lactis BB-12 and Lactobacillus acidophilus LA-5, respectively. Standard curves were established to quantify these probiotic bacteria. The linear regression of standard curves indicated high correlations between the log numbers of pure probiotic culture cells and the CT values. The assay had a high efficiency and the limit of detection was estimated to be 1.54 ng DNA (corresponding to 104 cells). Results show that qPCR method may be very useful as a rapid, sensitive and specific tool for detecting and quantifying B. animalis subsp. lactis BB-12 and L. acidophilus LA-5 in probiotic supplements. FTIR spectroscopy was used for the first time to determine the ratios of different microorganisms in commercial probiotic supplements. FTIR analysis was also performed for the pure probiotic cultures of B. animalis subsp. lactis BB-12 and L. acidophilus LA-5. Results obtained in this study showed that FTIR spectroscopy is potentially a rapid method for determining probiotic cell components and their ratios in the supplements and verification their detection and identification.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    961203

    Development of real-time PCR kit for Brucella abortus, Brucella melitensis and Brucella spp.

    Brucella abortus, Brucella melitensis ve Brucella spp. için gerçek zamanlı PCR kiti geliştirilmesi

    ÖZLEM AYDIN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2025

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ABDULHALİM KILIÇ

  2. Tez No

    1003757

    Cinsel yolla bulaşan hastalık patojenlerinin saptanmasında kullanılan real time multipleks PCR yöntemi ve konvansiyonel yöntemlerin karşılaştırılması

    Comparison of real-time multiplex PCR and conventional methodsin the detection of sexually transmitted disease pathogens

    FATİH DİLCE

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiVan Yüzüncü Yıl Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ŞABAN İNCECİK

  3. Tez No

    313693

    The development of molecular genetic tools for detection of Salmonella pathogen

    Salmonella patojeninin belirlenmesi için moleküler genetik metotların geliştirilmesi

    KURTULUŞ GÖKDUMAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2012

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. G. CANDAN GÜRAKAN

    DOÇ. DR. DURAN ÜSTEK

  4. Tez No

    338225

    Determination of the role of ammonia oxidizing archaea in wastewater treatment plants via molecular techniques

    Amonyağı oksitleyen arkelerin atık su arıtımındaki rolünün moleküler tekniklerle belirlenmesi

    HALİL KURT

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ALPER TUNGA AKARSUBAŞI

  5. Tez No

    335915

    Development of fast and economic QPCR-based method for meat species detection

    Hızlı ve ekonomik et tür tayini için QPCR tabanlı bir yöntem geliştirilmesi

    EDA ÇİFTÇİ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Genetikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Bölümü

    DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY

    DR. MUSTAFA KOLUKIRIK

Geri Dön