Farklı peynir çeşitlerinden bakteriyosin (Enterosin) üreticisi enterokok suşlarının izolasyonu ve üretilen bakteriyosinlerin polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile tanısı
Isolation of bacteriocin (Enterocin) producer enterococci strains from different type cheese and identification of bacteriocins by polymerase chain reaction (PCR)
- Tez No: 414036
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. BANU ÖZDEN TUNCER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Gıda Mühendisliği, Food Engineering
- Anahtar Kelimeler: Peynir, Enterokok, Enterosin, polimeraz zincir reaksiyonu (PZR), Bakteriyosinler, Enterococcus, Peynirler, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Cheese, Enterococci, enterocin, polymerase chain reaction (PCR), Bacteriocins, Enterococcus, Cheeses, Polymerase chain reaction
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Süleyman Demirel Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu tez çalışmasının amacı, farklı peynir çeşitlerinden bakteriyosin üretim yeteneğine sahip Enterococcus suşlarının izolasyonu ve moleküler düzeyde tanımlanması, antimikrobiyel aktivite spektrumlarının belirlenmesi ve bakteriyosin yapısal genlerinin polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile tespitidir. Çalışma kapsamında 33 adet peynir örneğinden 100 adet muhtemel enterokok suşu izole edilmiştir. Fenotipik olarak Enterococcus cinsi üyesi olarak tanımlanan 100 adet izolattan 11 adedinin antimikrobiyel aktivite denemelerinde farklı aktivite spektrumu gösterdiği belirlenmiş ve çalışmaya bu izolatlar ile devam edilmiştir. Proteolitik enzim uygulaması, bu izolatlar tarafından üretilen antimikrobiyel maddenin protein yapısında olduğunu göstermiştir. 16S rDNA analizine göre 6 adet izolat Enterococcus faecium ve 5 adet izolat Enterococcus faecalis olarak tanımlanmıştır. Enterococcus suşlarının ürettiği bakteriyosinlerin moleküler düzeyde tanımlanması amacı ile yürütülen PZR uygulamaları sonucunda E. faecalis MBE29-1 ve E. faecalis MBE29-3 suşları sadece entX yapısal genine sahip iken; E. faecium MBE16-5 ve E. faecalis MBE31-4 suşları entA ve entX yapısal genlerine; E. faecium MBE15-2 ve E. faecium MBE 27-3 suşları entA, entB ve entX yapısal genlerine; E. faecium MBE12-3 suşu entA ve entB yapısal genlerine; E. faecium MBE22-2 suşu entA, entP, ve entX yapısal genlerine sahip bulunmuştur. E. faecium MBE27-2 suşu ise 4 adet yapısal enterosin geni (entA, entB, entP ve entX) içeren tek üretici suş olarak tanımlanmıştır. E. faecalis MBE1-9 ve E. faecalis MBE20-5 suşları tarafından üretilen enterosinler ise tez kapsamında kullandığımız primerler ile PZR ürünü vermemiştir.
Özet (Çeviri)
The aim of the thesis is isolation of Enterococcus strains from different kind of cheeses capable of producing bacteriocin, and identification at molecular level, determination of antimicrobial activity spectrum and determination of structural genes of bacteriocin by Polymerase Chain Raection of these bacteria (PCR). The scope of work ,100 presumptive Enterococcus strains were isolated from 33 different cheese samples. 11 isolates among the 100 isolates phenotypically defined as members of the genus Enterococcus determined that showed different activity spectrum that in the trial antimicrobial activity and study has continued with these isolates. Proteolytic enzyme study showed that antimicrobial substances produced by these isolates are protein structure. 6 isolates were identified as Enterococcus faecium and 5 isolates were identified as Enterococcus faecalis by 16S rDNA analysis. PCR treatments for molecular identification bacteriocins produced by Enterococcus strains showed that E. faecalis MBE29-1 and E. faecalis MBE29-3 has only entX, while E. faecium MBE16-5 and E. faecalis MBE31-4 has entA and entX; E. faecium MBE15-2 and E. faecium MBE 27-3 entA, entB and entX; E. faecium MBE12-3 has entA and entB; E. faecium MBE22-2 has entA, entP, and entX structural genes. E. faecium MBE27-2 strain identified as the only one producing strain that has 4 structural enterocin genes (entA, entB, entP and entX). Enterocins produced by E. faecalis MBE1-9 and E. faecalis MBE20-5 strains did not give PCR amplificiation products by the primers used in this study.
Benzer Tezler
- Farklı ambalajlama tekniği ile inek ve manda sütü kullanılarak üretilen probiyotik katkılı İzmir tulum peynirlerinin depolanma süresindeki değişimlerinin araştırılması
Investigation of the changes during the storage period of probiotic added Izmir tulum cheese produced using cow and buffalo milk with different packaging techniques
HÜLYA VATANSEVER
Doktora
Türkçe
2024
Gıda MühendisliğiAfyon Kocatepe ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÖKHAN AKARCA
- Süperkritik karbondioksit ekstraksiyon yöntemi ile konsantre çedar ve küflü peynir aroması eldesi
Production of concentrated cheddar and moulded cheese aroma by using supercritical carbon dioxide extraction method
MELİSA YALÇIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Gıda MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ TOPCU
- Ege bölgesinde tüketilen bazı geleneksel peynirlerde aflatoksin M1 düzeylerinin belirlenmesi
Determination of aflatoxin M1 levels on some traditional cheese consumed in aegean region
ALİ EROĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
Gıda MühendisliğiCelal Bayar ÜniversitesiGıda Mühendisliği Bölümü
YRD. DOÇ. A. KEMAL SEÇKİN
- Divle tulum peynirinin kimyasal ve mikrobiyolojik özellikleri
Chemical and microbiological properties of divle tulum cheese
FATİH MORUL
Yüksek Lisans
Türkçe
2011
Besin Hijyeni ve TeknolojisiYüzüncü Yıl ÜniversitesiBesin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ÖZGÜR İŞLEYİCİ