Kolorektal kanserlere epigenetik yaklaşım; APC tümör supresör gen fonksiyon analizleri
Epigenetic approach to colorectal cancer; the functional analysis of tumor supressor gene APC
- Tez No: 385261
- Danışmanlar: PROF. DR. ÖZTÜRK ÖZDEMİR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Onkoloji, Genetics, Oncology
- Anahtar Kelimeler: Adenokarsinom, DNA, Gastrointestinal neoplazmlar, Genler, Genler-tümör baskılayıcı, Kolorektal neoplazmlar, Metilasyon, Metiltransferaz, Neoplazmlar, Adenocarcinoma, DNA, Gastrointestinal neoplasms, Genes, Genes-suppressor-tumor, Colorectal neoplasms, Methylation, Methyltransferase, Neoplasms
- Yıl: 2014
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kolorektal karsinogenez (KRK), normal hücrenin kanser hücresine dönüşümünde genetik ve epigenetik değişikliklerin rol aldığı çok basamaklı bir süreçtir ve moleküler genetiği tüm insan kanserleri arasında en iyi anlaşılmış olanıdır. Günümüzde gelişen teknoloji sayesinde ve epigenetik faktörlerin kanserdeki rollerinin anlaşılmasıyla bu alanda yoğun çalışmalar yapılmaya başlanmıştır. Tümör supresör genlerin promotor bölgelerinde CpG adacıklarının anormal metillenmesi, genlerin aktivitelerini bozabilir ve susturulmasına yol açar. Bu sessizlik hücre bölünmesi boyunca kalıtılır ve metilasyon inhibitörleri ile muamele haricinde geri dönüşümsüz olduğu kabul edilir. Çalışmamızda kolorektal kanser tanısı alan farklı tümör evresi ve farklı yaş gruplarından 20 birey yer almıştır. Öncelikli olarak tümör supresör APC geni, bunun yanında tümör supresör TP53, MGMT (191 nt), MGMT (346 nt), MSH6, BRCA1 ve BRCA2 genlerine ait promotor bölge metilasyon profilleri araştırılmıştır. Metod olarak, metil spesifik MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) yöntemi kullanılmıştır. Analizi amaçlanan gen bölgelerinin metilasyon paternleri SALSA MS-MLPA ME002-C1 tumor suppressor-2 probemix kiti kullanılarak incelenmiştir. Analizleri sonucunda APC geni %100 (20/20), TP53 geni %60 (12/20), MGMT (191 nt) geni %10 (2/20), MGMT (346 nt) geni %10 (2/20), MSH6 geni %60 (12/20) oranında metilasyon saptanmıştır. BRCA1 ve BRCA2 genlerinde metilasyon saptanmamıştır. Elde edilen epigenetik analizler, kanser vakalarında hem tümörlü dokuya özgü tedavi yöntemlerin geliştirilmesinde hem de sağkalım oranlarının artmasında oldukça yararlı olacaktır.
Özet (Çeviri)
Colorectal carcinogenesis is a multistep process that occured genetic and epigenetic changes in the transformation of normal cells into malignant cells and colorectal cancers, all of the molecular genetics of human cancer is the most well understood. Today, thanks to advanced technologies and understanding of the role of epigenetic factors in cancer, intensive studies have been started in this area. Abnormal methylation of CpG islands that tumor suppressor genes of the promoter regions, genes activity can disrupt and leads to silencing. This silence is inherited through cell division and except treatment with methylation inhibitors are considered to be irreversible. In our study involved in nineteen individuals have diagnosis of colorectal cancer who has been different tumor stage and different age groups. Firstly, the APC tumor suppressor gene, besides the tumor suppressor TP53, MGMT (191 nt), MGMT (346 nt), MSH6, BRCA1 and BRCA2 genes belonging to the promoter region methylation analysis was performed. In the method, methyl specific MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) method was used. Analysis of the methylation pattern of gene regions was examined using SALSA MS-MLPA ME002-C1-2 tumor suppressor kit probemix. As a result of analysis APC gene 100% (20/20), TP53 gene, 60% (12/20), MGMT (191 nt) gene is 10% (2/20), MGMT (346 nt) gene 10% (2/20), MSH6 genes is 60% (12/20) methylation ratio was determined. The obtained epigenetic analyzes, in the cancer cases both specific to tumor tissue development of treatment methods and in increasing of survival rate will be quite useful.
Benzer Tezler
- Kolorektal kanserde epigenetik bir çalışma: lıne-1 retrotranspozonunda 5' UTR metilasyon değişimlerinin araştırılması
An epigenetic research in colorectal cancer: investigation of 5' UTR methylation changes at line-1 retrotransposon
FATIMATÜZZEHRA ŞİPŞAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
Tıbbi BiyolojiRecep Tayyip Erdoğan ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ İRFAN GÜZEL
DR. ÖĞR. ÜYESİ TUBA DİNÇER
- Meme kanseri hastalarında TWIST, RARß2 ve ESR1 genlerinin metilasyon durumlarının Metilasyon Spesifik HRM (MS-HRM) yöntemiyle incelenmesi
Investigation of the methylation status of TWIST, RARß2 and ESR1 genes in breast cancer patients by Methylation Specific HRM (MS-HRM) technique
ONUR EROĞLU
Doktora
Türkçe
2011
GenetikEskişehir Osmangazi ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. BEYHAN DURAK ARAS
- Sporadik kolorektal kanserlerde epigenomik ve transkriptomik profilin entegrasyonu
Integration of epigenomics and transcriptomics profiles in colorectal cancer
EDİBE ECE ABACI
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HİLAL ÖZDAĞ
- Genom metilasyon profilinin kolorektal kanser etyolojisindeki rolü
Başlık çevirisi yok
ESRA ŞÜKRAN ÇAKAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2007
GenetikCumhuriyet ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İLHAN SEZGİN
- Kolorektal kanserli hücre hattında TCEAL7 geninin wnt/β-katenin yolağındaki etkisinin araştırılması
Investigation of the effect of TCEAL7 gene on WNT/β-catenin pathway in colorectal cancer cell line
AYŞEGÜL SOYSAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Tıbbi Biyolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE NUR BUYRU