Gıda kaynaklı escherichia coli kökenlerinde toksin genlerinin multiplex PCR yöntemiyle araştırılması
Investigation of the toxin genes in food-borne escherichia coli strains by multiplex PCR technique
- Tez No: 340719
- Danışmanlar: DOÇ. DR. NİZAMİ DURAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: E.coli O157:H7, stx1, stx2, hly-A, PCR, Besinler, Escherichia coli, Hemoliz, Hemolizin proteinleri, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Toksinler, E.coli O157:H7, stx1, stx2, hly-A, PCR, Foods, Escherichia coli, Hemolysis, Hemolysin proteins, Polymerase chain reaction, Toxins
- Yıl: 2013
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Mustafa Kemal Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Escherichia coli (E. coli) O157:H7 önemli bir insan patojenidir. Shiga toksin (stx1 ve stx2) ve enterohemolizin (hlyA) üreten E.coli hayvansal kaynaklı gıdaların kontaminasyonu ile ortaya çıkan önemli bir halk sağlığı sorunu haline gelmiştir. Bu çalışmada Hatay?da faaliyet gösteren lokantalardan alınan salata örneklerinde E.coli O157:H7 frekansı ile bu suşlarda stx1 ve stx2 toksin varlığının multipleks PCR yöntemiyle araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya 327 salata örneği dahil edildi. Mikrobiyolojik değerlendirme Türk Gıda kodeksi Mikrobiyolojik Kriterlerine uygun olarak yapıldı. Sınır değerin üzerinde E.coli izolasyonu yapılan örneklerde DNA izolasyonu yapıldı. Çalışmada 150 E.coli izolatında ait karakteristik virulans genlerinin (stx1, stx2, hlyA) varlığı multipleks PCR yöntemiyle araştırıldı. Ayrıca E.coli O157:H7 olarak tespit edilen tüm izolatlarda eritromisin, ampisilin, gentamisin, sefuroksim, streptomisin, tetrasiklin, sefoperazon, siprofloksasin ve streptomisin duyarlılıkları CLSI kriterleri doğrultusunda disk difüzyon yöntemiyle araştırıldı. Çalışmaya dahil edilen 327 salata örneğinde 150 (%45.8)?sinde E. coli izolatı saptanmıştır. Bu 150 izolatın32 (%21.3)'sinde multipleks PCR yöntemi ile hly-A geni varlığı tespit edilmiştir. Bu 32 hly-A pozitif izolattan 5 (%15.6)?inin stx2, 2 (%6.3)?sinin stx1 ve 1 (%3.1) izolatın ise hem stx1 hem de stx2 geni açısından pozitif olduğu tespit edilmiştir. Otuz iki E.coli O157:H7 suşunun tamamının eritromisine dirençli olduğu tespit edilmiştir. Eritromisin dışında en yüksek direncin ampisiline karşı (%68.8; 22/32) görüldüğü tespit edilirken, sefuroksim, siprofloksasin ve sefaperazonda antimikrobiyal direnç tespit edilememiştir.Tüm kökenlerin bu üç antibiyotiğe (sefuroksim, siprofloksasin ve sefaperazon) karşı duyarlı oldukları saptanmıştır. Bunlar dışında streptomisin gentamisine ve tetrasiklinlere karşı antimikrobiyal direncin sırasıyla %15.6 (5/32), %6.3 (2/32) ve %3.1 (1/32) olduğu tespit edilmiştir. Sonuçlarımız ilimizdeki lokantalardan alınan salata örneklerinden izole edilen E.coli suşlarının stx1, stx2 ve hlyA gibi önemli virulans genlerine sahip olduğunu göstermiştir. Restoranlarda tüketilen salataların sağlık açısından potansiyel bir tehlike oluşturabileceği görülmektedir. Gıda kaynaklı E.coli O157:H7 enfeksiyonlarının önüne geçmek için salatalık malzemelerinin yıkanması ve hazırlanması hususunda yıkanma ve hijyen kurallarına uyulması önem arz etmektedir.
Özet (Çeviri)
Escherichia coli (E. coli) O157:H7 is important pathogen for human health. Shiga toxin (stx1 and stx2 genes) and enterohemolysin (hlyA gene) producing E.coli have emerged as human pathogens and contamination of foods of animal origin has been a major public health concern. It was aimed to determine the frequency of E. coli O157:H7 and the stx1 and stx2 gene in salad samples taken from various restaurant which is located in Hatay province. A total of 327 salad samples were included to the study. Microbiological evaluation was performed according tothe Turkish Food Codex, Microbiological kriteria. If the number of isolated bacteria were higher than the limit in the Turkish Food Codex and Codex Alimentarius, nükleic acid isolation was made. The presence of the virulence genes (stx1, stx2, hlyA) in a total of 150 E.coli isolates were searched by multiplex PCR methods. Antibiotic susceptibility to erythromycin, ampicillin, gentamicin, cefuroxime, streptomycin, tetracycline, cefoperazone, ciprofloxacin, and streptomycin was determined via disk diffusion tests with antibiotic-containingdisks on Mueller-Hinton agar plate. The results were expressed as susceptible or resistant according to criteri are commended by the Clinical and Laboratory Standards Institute. A total of 327 salad samples were analyzed. E. coli O157:H7 was detected in150 (45.8 %) out of 500 analyzed samples.Of these 150 isolates, the presence of hly-A gene has been detected in 32(21.3%) samples by multiplex PCR technique. A total of five (15.6%) isolates in this 32 hly-A-positive isolates had stx2 gene, two(6.3%) of them had stx1 gene and one(3.1%) of the isolates were found to be positive for both stx1 and stx2 genes. It was found that all E. coliO157:H7 isolates were resistant to erythromycin. While the highest rates of antibiotic resistance were observed for ampicillin (68.8%, 22/32) after erythromycin, any antibiotic resistance against to cefuroxime, ciprofloxacin, and cephaperasone has not been identified. All isolates were found to be susceptible to these three antibiotics (cefuroxime, ciprofloxacin and cefoperazone). Other than this, antimicrobial resistance to streptomycin, gentamicin, and tetracycline were determined 15.6% (5/32), 6.3% (2/32) and3.1% (1/32), respectively. The results obtained in our province showed that E.coli strains isolated from salad samples were found to have important virulence genes such as stx1, stx2, and hlyA. Salads are consumed in restaurants could be found a potential threat to health. The results obtained in our provice and food joints salad isolated from E.coli O157: H7 strains of different stx, stx2, and just as important virulence genes were found to have hly-A. To prevent food-related E. coli O157:H7 infections, washing and food hygiene rules should be followed during the preparing the salad components.
Benzer Tezler
- Morus nigra L. meyve özütünün Escherichia coli ve Klebsiella pneumoniae kökenlerinin virülans faktörlerine etkileri
Effects of Morus nigra L. fruit extract on virulence factors of Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae strains
SELMA SEZGİN
Doktora
Türkçe
2026
MikrobiyolojiEge ÜniversitesiFarmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BAYRI ERAÇ
- Gıda kaynaklı escherichia coli 0157:H7 üzerine bir araştırma
A Research on the foodborne pathogen escherichia coli 0157:h7
MALİHE RAHATİ NOVİER
Doktora
Türkçe
1998
Gıda MühendisliğiAnkara ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. A. KADİR HALKMAN
- Investigation of the occurrence of siderophore genes in E. coli isolated from foodborne and clinical samples and identification of genotypic relationship of Escherichia coli by using PFGE method
Gıda kaynaklı ve klinik örneklerden izole edilen E. coli'de siderofor genlerinin oluşumunun araştırılması ve PFGE yöntemi ile Escherichia coli genotipik ilişkisinin belirlenmesi
OSMAN ALBARRI
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. IŞIL VAR ÖNGEL
PROF. DR. FATİH KÖKSAL
- Investigation of occurence of autotransporter genes in Escherichia coli isolated from clinical and food sources and identification of phylogenetic relationship of E.coli strains by using pfge method
Gıda kaynaklı ve klinik örneklerden izole edilen Escherichia coli suşlarında ototransporter proteinlerın oluşumunun araştırılması ve filogenetik ilişkilerinin PFGE ile tespiti
MARIAM HASSAN MOHAMMED
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
BiyoteknolojiÇukurova ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. IŞIL VAR ÖNGEL
PROF. DR. FATİH KÖKSAL
- Salmonella spp. ve Escherichia coli'ye etkili bakteriyofajların karakterizasyonu ve gıda uygulamaları
Characterization and food application of phages effective against Salmonella spp. and Escherichia coli
ESRA EKİZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
MikrobiyolojiHacettepe ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İSMAİL HAKKI BOYACI