Bazı maya türlerinde trehaloz ve glikojen metabolizmasına etki eden faktörlerin analizi
Analysis of factors affecting metabolism of trehalose and glycogen metabolisms in some yeast species
- Tez No: 315527
- Danışmanlar: PROF. DR. MERİH KIVANÇ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Maya, stres, trehaloz, glikojen, RT-PZR, dizi analizi, DNA analizi, Mayalar, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Yeast, stress, trehalose, glycogen, RT-PCR, sequencing analysis, DNA analysis, Yeasts, Polymerase chain reaction
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Anadolu Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Trehaloz ve glikojen bakteri, maya, bitki ve böceklerin bulunduğu yaygın organizma gruplarında yer alan depo karbonhidratlarıdır. Bu glikoz depoları glikolitik akışın kontrolünde de düzenleyici olarak rol oynamaktadırlar. Aslında trehaloz ve glikojen çeşitli çevresel stres şartlarına cevapta, hücresel içeriği korumak amaçlı biriktirilmektedirler.Bu çalışmada, C. albicans, C. rugosa, M. fructicola, P. stipitis, Y. lipolytica, Z. bailii, Z. rouxii ve S.cerevisiae gibi maya suşlarının trehaloz ve glikojen içerikleri besinsel stres, oksidatif stres, sıcak şok ve metal stresi gibi farklı stres koşulları altında incelenmiştir. Bu maya suşlarının stres koşullarına cevap olarak, trehaloz ve glikojen içerikleri ile ilgili benzerlikler ve farklılıklar belirlenmiştir. Özellikle sıcaklık stresinde mayalarda trehaloz ve glikojenin önemli derecede biriktiği gözlenmiştir. Tüm stres koşullarında C. rugosa'nın yüksek seviyede glikojen biriktirdiği bulunmuştur. C. rugosa, C. albicans, S. cerevisiae'nın TPS1 ve GSY1 gen anlatım profilleri RT-PZR yöntemi ile belirlenmiştir. Enzimatik yöntem ile belirlenen trehaloz ve glikojen birikimi, moleküler teknikle karşılaştırılmıştır. C. albicans'ın GSY1 gen anlatımının kadmiyum stresinde stressiz koşula göre 78,13 kat fazla olduğu gösterilmiştir. Araştırmada kullanılan maya türlerinde pseudohifsel gelişim ile depo karbonhidratları olan trehaloz ve glikojen metabolizması arasında bir metabolik bağlantı olup olmadığı biyokimyasal yöntemle incelenmiştir. Pseudohifsel gelişim zaman aralıklı olarak mikroskobik yöntem ile izlenmiştir. Bu çalışmada aynı zamanda vajenden izole edilen izolatlar C. glabrata olarak dizi analizi yöntemi ile belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Trehalose and glycogen are common carbohydrates in many organisms including bacteria, yeasts, plants and invertebrates. These glucose stores also have a regulatory role in the control of glycolytic flux. Infact, trehalose and glycogen accumulate in response to various environmental stress conditions to protect cellular components.In this study, the trehalose and glycogen contents of C. albicans, C. rugosa, M. fructicola, P. stipitis, Y. lipolytica, Z. bailii, Z. rouxii and S. cerevisiae were investigated in response to different stress condition such as nutritional stress, oxidative stress, heat shock and metal stress. There were similarities and differences between these yeast species in response to stress conditions regarding their trehalose and glycogen contents. It is found that the heat shock results in a significant level of glycogen and trehalose accumulation in these yeasts. Moreover, high levels of glycogen accumulations were detected in C. rugosa in response to all stress conditions. It is determined expression of TPS1 and GSY1 in C. rugosa, C. albicans, S. cerevisiae with RT-PZR. Accumulation of trehalose and glycogen, which was determined by enzymatic methods was compared with that determined by molecular techniques. C. albicans GSY1 is induced (78,13) by cadmium stress according to stress-free condition. In this research, possible metabolic connections between pseudohypeal development and reserve carbohydrate metabolism are investigated by biochemical methods in yeasts used in this research. Pseudohypeal development was followed microscopically in different time intervals. In addition, we have also identified the species at yeast samples obtained from vagina as C.glabrata with sequencing analysis.
Benzer Tezler
- Molecular and physiological characterization of iron resistant Saccharomyces cerevisiae
Demire dirençli Saccharomyces cerevisiae'nın moleküler ve fizyolojik karakterizasyonu
BERRAK GÜLÇİN BALABAN
Doktora
İngilizce
2016
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
- Farklı maya türlerinde invertaz aktivitesinin karşılaştırmalı analizi
Comparative analysis of invertase activities in different yeast species
NÜKHET KAYAKENT
- Characterization of genes that play role in manganese tolerance in different yeast species
Farklı maya türlerinde mangan toleransında rol oynayan genlerin karakterizasyonu
EZGİ KARAGÖZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
Genetikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HÜSEYİN ÇAĞLAR KARAKAYA
- Bazı fermente ürünlerde triptofan aminoasidi yolağıyla ilgili metabolitlerin tayini
Determination of tryptophan pathway metabolites in some fermented products
DİDEM MELDA YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyokimyaTrakya ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞEBNEM SELEN İŞBİLİR
- Dumanlanmış kadife balığı (Tinca tinca l., 1758)'nın farklı paketlerde buzdolabı koşullarında muhafazası sırasında meydana gelen bazı kimyasal ve mikrobiyolojik değişimler
Some microbial and chemical changes on smoked tench (Tinca tinca l., 1758) during conservation in the fridge conditions
SÜLEYMAN OĞUZ KORKUT
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
Gıda MühendisliğiAfyon Kocatepe ÜniversitesiGıda Mühendisliği Bölümü
PROF. RAMAZAN ŞEVİK