Geobacillus kaustophilus'ta biyofilm oluşumuna çevresel koşulların etkisi
Biofilm formation by Geobacillus kaustophilus under different environmental conditions
- Tez No: 315073
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. F. İNCİ ÖZDEMİR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Biyofilmler, Biofilms
- Yıl: 2012
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bacilluslar pek çok çevrede çok yaygın olarak bulunan ve spor oluşturanmikroorganizmalardır. Bu mikroorganizmaların gıda endüstrisi, ısıtma sistemleri,arıtma sistemleri gibi pek çok sistemin önemli kontaminantları oldukları ve busistemler içinde biyofilm tabakaları oluşturdukları bilinmektedir. Bu bakterilerinbüyük çoğunluğu hem gıda sektöründe önemli indikatörler olduklarından, hem depek çok endüstriyel sistemde enerji kaybına sebep olduklarından oluşturduklarıbiyBacilluslar pek çok çevrede çok yaygın olarak bulunan ve spor oluşturanmikroorganizmalardır. Bu mikroorganizmaların gıda endüstrisi, ısıtma sistemleri,arıtma sistemleri gibi pek çok sistemin önemli kontaminantları oldukları ve busistemler içinde biyofilm tabakaları oluşturdukları bilinmektedir. Bu bakterilerinbüyük çoğunluğu hem gıda sektöründe önemli indikatörler olduklarından, hem depek çok endüstriyel sistemde enerji kaybına sebep olduklarından oluşturduklarıofilm yapılarıyla mücadele son derece önem taşımaktadır.Bu tez çalışmasında termofilik bir mikroorganizma olan Geobacilluskaustophilus'un polistiren yüzey üzerinde biyofilm oluşumuna çeşitli çevreselfaktörlerin etkisi araştırılmıştır. Geobacillus kaustophilus polistiren yüzey üzerindebiyofilm oluşturmuş ve en iyi tutunmayı 168. saatte gerçekleştirmiştir. Geobacilluskaustophilus biyofilm oluşumu için optimum sıcaklığın optimum büyüme sıcaklığıolan 55?C olduğu tespit edilmiştir. Tutunma ortamına %5 glukoz ya da %3 tuzeklendiğinde biyofilm oluşumunda artış meydana gelmiştir. Glukoz ve NaCl'ninbirlikte en etkin olduğu konsantrasyonlar ise sırasıyla %3 ve %1.5`tur. Isı şoku veUV uygulanan hücrelerde tutunma gözlenmemiştir. SDS ve lizozim gibi hücreduvarını denatüre edici ajanların varlığı vejetatif hücrelerde biyofilm oluşumunuazaltmış/engellemiştir ve lizozim muamelesinin SDS'ye oranla biyofilm oluşumundadaha etkili olduğu saptanmıştır. Vejetatif hücrelerle karşılaştırıldığında Geobacilluskaustophilus spor yapıları polistiren yüzeylere daha güçlü tutunma göstermiştir. Sporyapıları lizozim muamelesine direnç gösterirken SDS muamelesi sonucu polistirenyüzeye tutunmada azalma meydana gelmiştir.
Özet (Çeviri)
The bacilli are a group of spore forming bacteria that are a common flora ofmultitude of area. These bacteria are important contaminants of the food industry,heating and waste treatment systems and they have found to form biofilm structuresin these systems. Because most of these bacteria are both indicators of poor hygienein food industry and the reason of loss of energy in many industrial systems it isessential to cope with biofilm structures that these bacteria form.In this thesis, biofilm formation by Geobacillus kaustophilus on polystyrenesurface under some environmental conditions was studied. Geobacillus kaustophilusvegetative cells were found to adhere to polystyrene surface and biyofilm formationafter 168- hour- incubation was considerably greater when compared to each testedincubation periods. The optimum temperature for biofilm formation by Geobacilluskaustophilus was 55?C which is the optimum growth temperature of this bacterium.Addition of 5% of glucose or 3% of NaCl increased biofilm formation. Thecombined presence of NaCl and glucose enhanced biofilm formation and theoptimum concentrations of NaCl and glucose for biofilm formation were 3% and 1%respectively. Heat shock and UV treatments inhibited biofilm formation formed byvegetative cells. Destroying surface layer of vegetative cells by using SDS orlysozyme applied significant reduction/complete inhibition on biofilm formation andthe effect of lysozyme on attachment of vegetative cells was greater than effect ofSDS. When compared to vegetative cells, Geobacillus kaustophilus spores werefound to attach polystyrene surfaces more efficiently. Treatment with SDS appearedto be more effective for reducing spore attachment compared with lysozymetreatment.
Benzer Tezler
- Cloning, expression and purification of the recombinant DNA polymerase I from the hyperthermophilic bacteria Geobacillus anatolicus
Hipertermofilik Geobacillus anatolicus bakterilerinde rekombinant DNA polimeraz I'in klonlanması, ekspresyonu ve saflaştırılması
MELİKE ÇAĞLAYAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2005
Tıbbi BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. NEŞE BİLGİN
- Meyve suyu üretiminde kullanım amaçlı, pektin liyaz üreten yeni mikroorganizmaların aranması ve bulunan türlerde enzimin saflaştırılıp karakterize edilmesi
In order to use in fruit juice industry, investigation of new microorganizms producing pectin lyase enzyme and purification and characterization of these enzymes
SAFİNUR YILDIRIM ÇELİK
- Cloning, expression and purification of recombinant elongation factor ts from hyperthermophilic bacteria geobacillus anatolicus
Hipertermofilik geobacillus anatolicus bakterilerinden rekombinant elongasyon faktörü Ts'nin klonlanması, ekspresyonu ve saflaştırılması
TOROS ŞAHİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2006
BiyomühendislikBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEŞE BİLGİN
- Cloning, expression and purification of recombinant elongation factor tu from hyperthermophilic bacteria geobacillus anatolicus
Hipertermofilik geobacillus anatolicus bakterilerinden rekombinant elongasyon faktörü tu'nun klonlanması, ekspresyonu ve saflaştırılması
BARIŞ AKALIN
Yüksek Lisans
İngilizce
2006
BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEŞE BİLGİN
- Sıcak su kaynaklarından termofilik bakteri izolasyonu ve identifikasyonu
Isolation and identification of thermophilic bacteria species from hot springs
SEDA ERCAN AKKAYA
