Evaluating the interactions between neurofilament promoters and the ETS transcription factor PEA3 by using different cell lines
Nörofilament promoterları ve bir ETS transkripsiyon faktörü olan PEA3 ilişkisinin farklı hücre dizileri kullanılarak değerlendirilmesi
- Tez No: 305871
- Danışmanlar: DOÇ. DR. IŞIL AKSAN KURNAZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Nöroloji, Biotechnology, Neurology
- Anahtar Kelimeler: Nöronlar, Orta filament proteinleri, Neurons, Intermediate filament proteins
- Yıl: 2010
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Ets transkripsiyon faktörü ailesinin bir üyesi olan PEA3 proliferasyon, farklılaşma, apoptoz ve transformasyon gibi pek çok hücresel olayda rol oynamaktadır. Ailenin diğer üyelerinden farklı olarak, PEA3 ile yapılan çalışmaların çoğu bu proteinin karsinojenezdeki görevlerine odaklanmaktadır. Nörofilamentler, sinir hücresi iskeletinin kurulmasında yer alırlar ve üç farklı boyuttaki alt ünitelerden (hafif NF-L, orta NF-M ve ağır NF-H) oluşurlar. Bu tezde, NF-L ve NF-M alt unite promoterlarında mPEA3 transkripsiyon faktörünün transaktivitesine göre oluşacak anlatım farklılıkları ile mPEA3'nin varsayılan fosforilasyon bölgeleri üzerinde çalışmalar yapılmıştır. Bunun için, nörofilament promoterları üzerindeki varsayılan mPEA3 bağlanma motiflerinde ve MAPK yolağının fosforile ettiği düşünülen mPEA3 kısımlarında mutasyonlar oluşturulmuştur. Yabani türler ile mutant formlar arasındaki farklılığı ölçmek için yönlendirilmiş mutasyon, lusiferaz assay, kromatin immünopresipitasyon (ChIP) ve Western blot yöntemleri kullanılmıştır. NF-L promoter aktivitesi için ikincil ets bağlanma motifi önemliyken, NF-M promoter aktivitesi için varolan tek ets bağlanma motifinin Pea3 ile ilişkide etkili olduğu görülmüştür. Sonuçlar farklı yöntemlerle desteklenip genişletilmelidir.
Özet (Çeviri)
PEA3, a member of the widely-known Ets transcription factor family, takes role in many of the cellular processes including proliferation, differentiation, apoptosis and transformation. Apart from other members of the family, the studies on PEA3 are usually focused on its function in carcinogenesis. Neurofilaments are well-known for taking part in constitution of neuronal cytoskeleton and are made up of three subunits that different in size, namely light (NF-L), medium (NF-M) and heavy (NF-H) subunits. In this thesis, the relationship between expression of NF-L and NF-M subunit promoters and transactivity of mPEA3 transcription factor were assessed together with investigating the putative phosphorylation sites for mPEA3. For this, mutations were created at putative binding motifs for mPEA3 on neurofilament promoters and at putative sites for mPEA3 phosphorylation by MAPK. Site directed mutagenesis (SDM), luciferase assay, chromatin immunoprecipitation (ChIP) and Western blot were used for measuring differences in transactivation wild type and mutant promoter or transcription factors on NF-L and NF-M promoters in SH-SY5Y and HEK 293 cell lines. For NF-L promoter activity the secondary ets binding motif was crucial while for NF-M promoter activity the mere ets binding motif was found to be in interaction with Pea3. The results have to be further proved and expanded with other methods.
Benzer Tezler
- Koroner arter baypas cerrahisi sonrası atriyal fibrilasyon gelişmiş hastalarda operasyon öncesi ve sonrası kullanılan ilaçların olası ilaç etkileşmeleri açısından değerlendirilmesi
Evaluating the possible interactions between preoperative and postoperative drugs of new onset atrial fibrillation after coronary artery bypass grafting surgery patients
DİLŞAH EZGİ KÜÇÜK
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Eczacılık ve FarmakolojiMersin ÜniversitesiEczacılık Farmakoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. AYŞE NİHAL SARI
- Evaluating TAU-neutrino energy and direction from its shower observables to estimate the number of events by the proposed array
Gözlemlenen duş ürünlerinden TAU-nötrinosunun enerji ve yönünün bulunarak önerilen dizilim aracılığıyla olay sayılarının belirlenmesi
ŞEYMA ATİK YILMAZ
Doktora
İngilizce
2019
Fizik ve Fizik MühendisliğiBolu Abant İzzet Baysal ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALUK DENİZLİ
- Evaluating the determinants of the level of central bank's international reserves: The case of Turkey
Merkez bankasının uluslararası rezerv düzeyinin belirleyicilerinin değerlendirilmesi: Türkiye örneği
SHAHRIYAR HUSEYNLI
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Ekonomiİstanbul Üniversitesiİktisat Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUHİTTİN KAPLAN
- Evaluating the antioxidant potential and in vitro bioavailability of di̇fferent phenolics in model systems
Model sistemlerde farklı fenolik bileşiklerinin antioksidan potansiyali ve biyoyararlılığının değerlendirilmesi
AYNUR ÇETİN
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. DİLARA ERDİL
- Öğretmenlerin çocuklarla kurdukları ilişkiyi algılama biçimleri ile çocukların sosyal becerileri arasındaki ilişkinin incelenmesi
The study of the relationship between teachers' ways of perceiving the relationships they form with children and children' social skills
HATİCE ALTINTAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Eğitim ve ÖğretimAkdeniz Üniversitesiİlköğretim Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA ÜNAL