Geri Dön

Isolation, expression and characterization of an ?-L-arabinofuranosidase enzyme from thermophilic Geobacillus sp.

Thermophilic Geobacillus türünden ?-L-arabinofuranozidaz enziminin izole edilmesi, ifadelenmesi ve karakterize edilmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 299175
  2. Yazar: HÜSEYİN İLGÜ
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. GÜLŞAH ŞANLI MOHAMED
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyokimya, Biochemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2011
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Bu çalısmada, termofilik bir organizma olan Thermophilic Geobacillus türünden,moleküler klonlama teknikleri kullanılarak ?-L-arabinofuranozidaz (?-L-AbFase)enziminin izolasyonu ve sonrasında biyokimyasal yöntemlerle karakterizasyonuamaçlanmıstır.Karakterizasyon çalısmaları sırasında, enzimin pNP-?-L-arabinofuranozitsubstratına karsı en yüksek verimde çalıstığı optimum pH ve sıcaklığı değerleriniarastırdık. Buna ek olarak, çesitli metal iyonlarının, bazı özel kimyasallar ve yaygınkullanımı olan organik çözgenlerin enzim aktivitesi üzerine olan etkileri çalısıldı.Çalıstığımız enzimin ana olarak L-arabinoze içeren polisakkaritlerde ?-L-arabinofuranozilgruplarını parçalamasından dolayı pancar sekerinden elde edilmis olan arabinan susbtratolarak kullanılmıstır . Enzimimiz, 50?C sıcaklıkta genis bir pH aralığında; pH 3.0-10.0, veNa-asetat tamponu içinde iken 30 ile 90?C arasında aktivite göstermis olup, pNP-?-Larabinofuranozitsubstratına karsı optimum çalısma kosulları pH 5.0 ve 70?C olaraksaptanmıs, kinetik çalısmalar sonrasında enzimin bu substrata karsı Km ve Vmax değerlerisırasıyla 14.75 mM ve 1.6 Abs/dak/ml olarak, seker pancarından elde edilmis arabinanakarsı ise sırasıyla 1.35 mM ve 3.9 AAbs/dak/ml olarak hesaplanmıstır.

Özet (Çeviri)

In our study, we have aimed first to isolate an ?-L-arabinofuranosidase (ALAF)enzyme, 58.0 kDa, from a thermophilic organism; Thermophilic Geobacillus sp. by usingmolecular cloning techniques, then to characterize this enzyme via biochemical methods.Throughout the characterization studies, we have investigated the optimumconditions for the highest enzyme activity by means of pH and temperature by using pNP-?-L-arabinofuranoside as substrate. Also, effect of various metal ions, some specificchemicals and common organic solvents on enzyme activity was studied. Due to the factthat ?-L-arabinofuranosidases mainly hydrolyze ?-L-arabinofuranosyl residues of Larabinosecontaining polysaccharides, enzyme activity towards sugar beet arabinan wasalso studied. Our enzyme exhibited activity in a broad pH range between pH 3.0-10.0 at50?C and between 30-90?C in Na-acetate buffer pH 5.0. Optimum activity towards pNP-?-L-arabinofuranoside was obtained at pH 5.0 and at 70?C. Kinetic studies showed that ourenzyme has a Km value as 0.19 mM and Vmax as 18.6 AAbs/min/ml towards pNP-?-Larabinofuranosideand Km value as 0.1 mM and Vmax as 8.1 AAbs/min/ml towards sugarbeet arabinan.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    119478

    Cloning sequencing and expression of L-lactate dehydrogenase gene from Clostridium thermocellum and isolation, characterization and transformation of various cellulolytic, thermophilic, ethanol-producing bacteria

    Clostridium thermocellum'dan L-laktat dehidrogenaz geninin klonlanması ekspresyonu ve çeşitli sellülolitik, termofilik, etanol üreten bakterilerin izolasyonu, karakterizasyonu ve transformasyonu

    MELEK ÖZKAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2002

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLAY ÖZCENGİZ

    DOÇ. DR. ZÜMRÜT ÖGEL

  2. Tez No

    394619

    Isolation and characterization of a novel tyrosinase enzyme from native bacterial straine, production of the enzyme by cloning, characterization of the recombinant enzyme and analysis of its biotechnological applications such as production of l-dopa and melanin

    Doğal bakteri suşlarından tirozinaz enzim izolasyonu, karakterizasyonu, üretici genin klonlanması, rekombinant enzimin karakterizasyonu ve l-dopa ve melanin üretimi gibi biyoteknolojide kullanılabilirliği

    EBRAHİM VALİPOUR

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    MikrobiyolojiÇukurova Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BURHAN ARIKAN

  3. Tez No

    343866

    Isolation and characterization of the gene encoding d-lactate dehydrogenase enzyme from bacteroides fragilis that is known to be localized in colon cancer tissues

    Kolon kanseri dokularında yerleştiği bilinen bacteroıdes fragılıs in d-laktat dehidrogenaz enzimini kodlayan genin izolasyonu ve karakterizasyonu

    ZEYNEP BÜŞRA BOLAT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    BiyomühendislikYıldız Teknik Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DİLEK TURGUT BALIK

  4. Tez No

    315382

    Cloning of The Laccase cDNAs from Pycnoporus sanguineus MUCL 38531, Expression in Pichia pastoris and Characterization of Recombinant Laccases

    Pycnoporus sanguineus?tan Lakkaz cDNA?larının Klonlanması, Pichia pastoris?te Ekspresyonu ve Rekombinant Lakkazların Karakterizasyonu

    GÜNSELİ KURT GÜR

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2010

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYTEN YAZGAN KARATAŞ

  5. Tez No

    222812

    Detection and characterization of plant genes involved in various biotic and abiotic stress conditions using ddrt-pcr and isolation of interacting proteins

    Çeşitli biyotik ve abiyotik stres koşullarında bitkilerde rol alan genlerin farklılık gösterim yöntemiyle bulunması, fonksiyonlarının belirlenmesi ve ilişkide bulunan proteinlerin belirlenilmesi

    TURGAY ÜNVER

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2008

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Bölümü

    DOÇ. DR. CANDAN GÜRAKAN

    PROF. DR. MAHİNUR S. AKKAYA

Geri Dön