Rosaceae familyasindaki farklı bitki türlerinden elde edilen Erwinia amylovora (Burr.) Winslow et al.'nin biyokimyasal ve polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) testleriyle tanılanması
Identification of Erwinia amylovora (Burr.) Winslow et al. from the different plant species of Rosaceae family with biochemical and polymerase chain reaction (PCR) tests
- Tez No: 237499
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. KUBİLAY K. BAŞTAŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Botanik, Biyoteknoloji, Botany, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Ateş yanıklığı, Erwinia amylovora, pEA29, Rosaceae, Fire Blight, Erwinia amylovora, pEA29, Rosaceae
- Yıl: 2009
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Selçuk Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Erwinia amylovora (Burr.) Winslow et al.'ın sebep olduğu ateş yanıklığı hastalığı Rosaceae familyasına ait 39 genusta yer alan bitkilerin en ciddi ve tahripkar bakteriyel hastalığıdır. 2006 ve 2007 yıllarında, Konya ilinde Rosaceae familyasına ait farklı konukçulardan ve bu konukçuların farklı çeşitlerinden bakteriyel izolasyonlar yapılmıştır. E. amylovora' nın teşhisinde, 5% SNA, King B besiyerlerinde gelişim, oksidatif/fermentatif test, 36 °C'de gelişim, levan üretimi, sakkarozdan indirgenen bileşikler, asetoin üretimi, jelatinin sıvılaştırılması, nişasta, maltoz, inulin, gliserol ve mannitol, sorbitol 'den asit üretimi, ureaz aktivitesi, indol oluşumu, esculinin hidrolizi ve tütünde hipersensitif reaksiyon testleri esas alınmıştır. İzolatların moleküler karakterizasyonunda, plasmid pEA29'e göre sentezlenen oligonükleotit primerlerle yaklaşık 1 kb'lik fragment, PCR ile amplifiye edilmiştir. Patojenisite testlerinde, her izolat, elde edildiği konukçusunun fidanlarına ve ham armut meyvelerine 108 hücre/ml yoğunlukta bakteriyel süspansiyonun inokulasyonu ile gerçekleştirilmiştir. Çalışmada 213 adet bitki örneği toplanmış olup bunlardan 148 adet bakteri izole edilmiştir. Yapılan biyokimyasal, moleküler ve patojenisite testleri sonucunda 84 adedi Erwinia amylovora olarak tanılanmıştır. Elde edilen Erwinia amylovora izolatlarının 38 tanesi elma (Malus communis), 17 tanesi armut (Pyrus communis), 10 tanesi ayva (Cydonia vulgaris), 4 tanesi alıç (Crateagus sp.), 2 tanesi ateş dikeni (Pyracantha sp.), 3 tanesi dağ muşmulası (Cotoneaster salicifolius), 1 tanesi yayılıcı dağ muşmulası (Cotoneaster horizantalis), 9 tanesi de süs elması (Malus floribunda) olarak belirlenirken, İl genelinde farklı konukçulardaki etmenle bulaşıklılık durumları; Malus communis % 37.6, Pyrus communis % 39.5, Cydonia vulgaris % 47.6, Pyracantha sp. % 66.6, Cotoneaster sp. % 100, Crateagus sp. % 80 ve Malus floribunda % 27.2 olarak tespit edilmiştir.
Özet (Çeviri)
Fire blight caused by Erwinia amylovora (Burr.) Winslow et al., is the most serious and destructive bacterial disease in 39 genus of the family Rosaceae. It was made bacterial isolations from different hosts belonging to Rosaceae family and their varieties in Konya Provinces in 2006 and 2007 years. In the identification of E. amylovora, growth on 5% SNA, King?s B media, oxidative/fermentative test, growth at 36 °C, levan production, reducing substances from sucrose, acetoin production, gelatin liquefaction, acid production from lactose, maltose, starch, mannitol, sorbitol, glycerol and inositol, urease activity, indol test, esculin hydrolysis and hypersensitive reaction on tobacco tests were based. In molecular characterization of isolates, fragment of approximately 1 kb amplified by PCR and with oligonucleotide primers derived from plasmid pEa29. Each isolate of E. amylovora was inoculated bacterial suspension with 108 cfu/ml concentrations to seedlings of which obtained host and immature pear slices in pathogenicity tests. In the study, 148 bacteria are isolated from the 213 collected materials. 84 Erwinia amylovora isolates were identificated by biochemical, molecular and patogenicity tests. It contains 38 Malus communis isolates, 17 Pyrus communis isolates, 10 Cydonia vulgaris isolates, 4 Crateagus sp. isolates, 2 Pyracantha sp. isolates, 3 Cotoneaster salisifolius isolates, 1 Cotoneaster horizantalis isolates and 9 Malus floribunda isolates. In Konya province, percent of infection with fire blight pathogen of Erwinia amylovora was found ; % 37.6 for Malus communis, % 39.5 for Pyrus communis, % 47.6 for Cydonia vulgaris, % 66.6 for Pyracantha sp., %100 for Cotoneaster sp. ,% 80 for Crateagus sp.,% 27.2 for Malus floribunda.
Benzer Tezler
- Türkiye'deki Rosaceae familyasına mensup bazı cinslerin (Aria, Hedlundia, Sorbus ve Torminalis) morfolojik ve moleküler filogenetik yönden araştırılması
Morphological and molecular phylogenetic investigation of some genus of Rosaceae family (aria, hedlundia, Sorbus and Torminalis) in Turkey
HAYAL AKYILDIRIM BEĞEN
Doktora
Türkçe
2022
BotanikArtvin Çoruh ÜniversitesiOrman Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖZGÜR EMİNAĞAOĞLU
- DNA barcoding study of Turkish wild cherry (Prunus avium L.) populations belonging to Adapazari and Bolu forestry directorates
Adapazarı ve Bolu orman müdürlüklerine ait yabani kiraz (Prunus avium L.) populasyonlarının DNA barkodlama çalışması
SELİN GÜL ÜNSAL
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
GenetikGebze Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YELDA ÖZDEN ÇİFTÇİ
- Ankara ili Rosaceae familyası bitkilerinde bulunan zararlı ve faydalı akar türlerinin tespiti, tanımlanması ve dağılımları üzerinde çalışmalar
Determination and distribution of the harmful and beneficial mites on Rosaceae family in Ankara province
TUĞBA ERDOĞAN
- Endemik Centaurea kurdica ve Centaurea spectabilis türlerinin sitoprotektif, antimutajenik/antirekombinojenik, antioksidan ve antibakteriyel özelliklerinin in vivo ve in vitro değerlendirilmesi
Evaluation of cytoprotective, antimutagenic/antirecombinogenic, antioxidant and antibacterial properties of endemic Centaurea kurdica and Centaurea spectabilis species in vivo and in vitro
KARDELEN SEZGİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
MikrobiyolojiBalıkesir ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERAP DOĞAN
DR. ÖĞR. ÜYESİ BEGÜMHAN YILMAZ KARDAŞ
- Ordu ili çilek üretim alanlarında bitki zararlısı ve faydalı akar türlerinin tespiti ile Phytonemus pallidus fragariae Zimmermann (Trombidiformes: Tarsonemidae) ve phytoseiid predatörlerinin yaşam çizelgesi ve biyolojik mücadele olanaklarının araştırılması
Determination of harmful and beneficial mite species in strawberry fields in Ordu and investigation of life table and biological control possibilities of Phytonemus pallidus fragariae Zimmermann (Trombidiformes: Tarsonemidae) and its phytoseiid predators
METE SOYSAL