Geri Dön

Genotype-phenotype correlation in cystic fibrosis and gene localization in seckel syndrome and pectus carinatum

Sistik fibrozis hastalığında, genotip-fenotip bağlantısının kurulması ve sekel sendromu ve pektus karinatum için gen bölgelerinin belirlenmesi

  1. Tez No: 112121
  2. Yazar: M. OKYAY KILINÇ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ASLI TOLUN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Genetik, Kistik fibroz, Mutasyon, Pektus karinatum, Sekel sendromu, Genetics, Cystic fibrosis, Mutation, Pectus carinatum, Seckel syndrome
  7. Yıl: 2001
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

VI ÖZET SİSTİK FİBROZİS HASTALIĞINDA, GENOTİP-FENOTİP BAĞLANTISININ KURULMASI VE SEKEL SENDROMU VE PEKTUS KARİNATUM İÇİN GEN BÖLGELERİNİN BELİRLENMESİ Gen mutasyonların saptanması hastalığın patogenetiğinin anlaşılması ve genotip ile phenotip arasında bağlantı kurulmasına yardım eder. Türk toplumunda Sistik fibrozise (CF) yol açan mutasyonların belirlenmesi amacı ile 166 farklı CF kromozomunda genin kullanım bölgesi ile ekson-intron sınırlan taranarak 126'sında 37 farklı mutasyon saptandı ve 8 yeni mutasyon bulundu. Bunlardan 5 tanesi missens mutasyonu (K68E, Q493P, E608G, VI 1471 and D891G), ikisi ekson-intron bağlantı bölgesi mutasyonu, (406-3T->C and 3849+5G-+A), bir tanesi de büyük bir delesyondur (CFTRdelel7b,18). Bu bulgular CFTR bölgesinde bugüne kadar kaydedilen en yüksek genetik heterojenliğin Türk toplumunda olduğunu ortaya koymaktadır. Toplumumuzda çok sık görülen akraba evliliği gözönüne alındığında, hastaların çoğunun heterozigot olması beklenmedik bir durumdur. CF sadece Avrupa kökenli toplumlara özgü bir hastalık olarak düşünüldüğünden, bu durum öngörülenden fazla bir taşıyıcı sıklığı olasılığım düşündürtmektedir. Mutasyonların ne tür farklı klinik bulgulara yol açacağı toplumumuzda ilk kez yapılan genotip-fenotip bağlantı analizi ile değerlendirilmiştir. Nadir bir hastalıktan sorumlu genin ilk yerinin, sonra da kendisinin belirlenmesi bağlantı analizi yöntemi ile o hastalığın moleküler temelini aydınlatmaya yardımcı olur. Homozigotluk haritalaması akraba evliliği yapmış geniş ailelerde nadir otozomal çekinik hastalık genlerinin yerlerinin saptanması için güçlü bir yöntemdir. Bu yöntem kullanılarak iki nadir hastalığın, Sekel sendromu ve pektus karinatumun genlerinin yerleri belirlenmiştir. Buna karşın azospermiye yol açan etkileyici bir genin yerini arama çalışmasında olumlu sonuç alınamamıştır.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT GENOTYPE-PHENOTYPE CORRELATION IN CYSTIC FIBROSIS AND GENE LOCALIZATION IN SECKEL SYNDROME AND PECTUS CARINATUM Identification of gene mutations is essential for understanding the pathogenesis of the disease and assessment of correlation between genotype and phenotype. In order to determine the spectrum of cystic fibrosis (CF) mutations in the Turkish population, 166 unrelated Turkish CF chromosomes were analysed in the entire coding sequence and the exon-intron boundaries. Thirty-seven different mutations were detected in 126 (75%) of them. Eight novel mutations were identified: five missense (K68E, Q493P, E608G, VI 1471 and D891G), two splice-site (406-3T-»C and 3849+5G-*A), and one a large deletion (CFTRdelel7b,18). The data revealed that among the populations the Turkish population had the highest genetic heterogeneity at the CFTR locus, studied so far. The observation that most of the patients were compound heterozygotes was unexpected, considering the high rate of consanguinity. Hence, the results point out to a much higher carrier frequency in our population than had been expected, since the disease is believed to be common only in the populations of European descent. The extent to which various mutations contributed to clinical variation in CF was evaluated by a genotype-phenotype correlation for the first time in our population. Linkage analysis and subsequent identification of a gene responsible for a rare disorder will facilitate understanding the molecular basis of the disease. Homozygosity mapping has proven to be a powerful tool for the localization of rare autosomal recessive disorders in large consanguineous families. Using this approach, genes responsible for two rare disorders, Seckel syndrome and pectus carinatum, were localized. However, no result was obtained from the search for a modifier gene for azoospermia.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    90321

    Kistik fibroz hastalarında büyüme gelişme serum IGF 1 IGFBP 3 düzeyleri

    Growth monitorization of Turkish cystic fibrosis patients and their serum IGF 1 IGFBP 3 levels

    METEHAN ÖZEN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2000

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HALUK ÇOKUĞRAŞ

  2. Tez No

    142496

    Doğu Anadolu Bölgesindeki ailevi akdeniz ateşli hastalarda genotipik/fenotipik korelasyonların araştırılması

    Investigation of genotype-phenotype correlation in the patients with familial mediterranean fever in the East Anotolia Region

    FATİH ALBAYRAK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    RomatolojiAtatürk Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YILMAZ SELÇUK

  3. Tez No

    108247

    Ailevi Akdeniz Ateşi (FMF) ile ilişkili nokta mutasyonlarının (MEFV) sekonder amiloidoz ve FMF amiloidozu ile ilişkisi

    The association of familial Mediterranean Fever (FMF) associated point mutations (MEFV) with secondary and FMF amiloidosis

    MEHMET PAMİR ATAGÜNDÜZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2001

    RomatolojiMarmara Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. RAFİ HANER DİRESKENELİ

  4. Tez No

    86455

    Çölyak hastalığında HLA-DQA1B1(*0501;*02) allel sıklığının ve genotip-fenotip ilişkisinin araştırılması

    Investigation of the HLA-DQA1B1(*0501;*02) alleles frequency and the correlation between genotype and fenotype in celiac disease

    BEYHAN TÜYSÜZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    Gastroenterolojiİstanbul Üniversitesi

    Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TURGUT ULUTİN

    PROF. DR. ASIM CENANİ

  5. Tez No

    192561

    Türk hiperfenilalaninemi hastalarında fenilalanin hidroksilaz gen mutasyonlarının taranması, mini haplotiplerin oluşturulması ve genotip-fenotip ilişikisinin kurulması

    Phenylalanine hydroxylase gene mutations, associated minihaplotypes and genotpye-phenotype corelation in turkish hyperphenylalaninemia patients

    BANU TÜREL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Tıbbi BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. ENGİN YILMAZ

Geri Dön