Geri Dön

Ailesel hiperkolesterolemili hastalarda LDL reseptör geninin 3 numaralı ekzonundaki mutasyonların SSCP yöntemiyle taranması

Screening of patients with familial hypercholesterolemia for mutations in exon 3 of the low density lipoprotein receptor gene by single strand

  1. Tez No: 107601
  2. Yazar: NEVRAH NAL
  3. Danışmanlar: PROF.DR. GÜVEN LÜLECİ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Ailesel hiperkolesterolemi, moleküler genetik, SSCP, Familial hypercholesterolemia, molecular genetics, SSCP
  7. Yıl: 2000
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

ÖZET Ailesel hiperkolesterolemi (Familial Hypercholesterolemia, FH), otozomal dominant kalıtım gösteren, heterozigot bireylerde 1/500, homozigot bireylerde 1/1000000 sıklıkla görülen yaygın genetik hastalıklardan biridir. Düşük yoğunluklu lipoprotein (LDL) tarafından taşınan plazma kolesterolünün yükselmesiyle karakterizedir. Plazma LDL- kolesterol seviyesinin artması sonucu kolesterolün aşın depolanmasından kaynaklanan ciltte ve tendonlarda ksantoma oluşumu ve prematüre aterosklerozis gerçekleşmektedir. Genel hastalık belirtilerinin şiddetinde, mutant allelin heterozigot ya da homozigot durumda oluşuna bağlı olarak farklılık görülür. Kolesterol metabolizmasında hayati rol oynayan LDLR (low density lipoprotein receptor) geninde meydana gelen mutasyonlar ailesel hiperkolesterolemiye neden olmaktadır. LDLR geni 19 numaralı kromozomun pl3. 1-13.3 bölgesinde lokalizedir.18 ekzon 17 intron içeren 45kb.lik bu gen 839 aminoasitten oluşan olgun bir protein kodlar. Moleküler tarama yöntemlerinden SSCP, HA, DGGE, RFLP ve DNA dizi analizi teknikleri kullanılarak bugüne kadar bu gen üzerinde 500'den fazla insersiyon, delesyon, anlamsız ve yanlış anlamlı mutasyon saptanmıştır. Çalışmamızda, laboratuvar ve klinik bulguları ailesel hiperkolesterolemi ile uyum gösteren 32 hastanın DNA'sı izole edildikten sonra LDLR geninin 3 numaralı ekzonuna özgü primerler kullanılarak PCR ve nonradyoaktif SSCP teknikleriyle mutasyon taraması yapılmıştır. Sonuçta 10 ve 15 numaralı olgularda hafif, 18 ve 19 numaralı olgularda ise bariz band kayması gözlenmiş kesin sonuç için dizi analizi yapılması kararlaştırılmış, diğer olgular ise normal bulunmuştur. Çalışmamızda, SSCP tekniğinin bu hastalık için standardizasyonu yapıldığından aynı hastalarda diğer ekzonlarda mutasyon taramasına devam edilecektir.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT Familial hypercholesterolemia (FH) is a common autosomal dominant disease, heterozygous form of which affects 1 in 500 people in population, while the incidence of its homozygous form is given as 1/1.000.000. It is characterized by elevated levels of plasma cholesterol carried by low density lipoprotein(LDL). As a result of excess storage of cholesterol due to the elevation of plasma LDL-cholesterol level, xanthoma appears on skin and tendons and premature atherosclerosis is observed. The severity of the disease in general differs depending on the mutant allele being homozygous or heterozygous. Mutations in the LDLR (low density lipoprotein receptor) gene, which plays a crucial role in cholesterol metabolism, lead to familial hypercholesterolemia. LDLR gene is localized on chromosome 19pl3.1- 13.3 and consists of 18 exons and 17 introns spanning 45 kb., coding for a mature protein consisting of 839 amino acids. More than 500 insertions, deletions, nonsense and missense mutations have been detected on this gene by SSCP, HA, DGGE, RFLP and DNA sequence analysis to date. In our investigation, DNA isolation was performed from patients whose laboratory and clinical findings were in accordance with FH and mutation screening by PCR and nonradioactive SSCP analysis was done using primers specific for exon 3 of LDLR gene. As a result, mild band shift in patients 10 and 15 and prominent band shift in patients 18 and 19 was observed and sequence analysis was decided to be performed. Other patients were detected to be normal. As we have performed the standardization of SSCP technique in our study, extensive mutation screening in other exons in the some patients will follow.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    197209

    Türkiye'deki hiperkolesterolemi ve propiyonik asidemi hastalıklarına neden olan genetik patolojilerin belirlenmesi ve özgül mutasyon çeşitlerinin gen ifadelerinin araştırılması

    Identification of genetic pathologies which cause hyper cholesterolaemia and propionic acidemia diseases in Turkey and investigation of gene expressions of spesific mutation types

    MUSTAFA MERT SÖZEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. CİHAN ÖNER

  2. Tez No

    79451

    Ailesel meme ve meme-over kanserli Türk hastalarda BRCA1 ve BRCA2 genlerindeki mutasyonların, konformasyona duyarlı jel elektroforezi (CSGE), protein truncation test (PTT) ve DNA dizi analizi ile belirlen

    Mutation analysis of BRCA1 and BRCA2 Turkish breast and breast-ovarian cancer families by conformation sensitive gel electrophoresis protein truncation test and DNA sequencing

    AYŞE BALCI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    Tıbbi BiyolojiGazi Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ABDULLAH EKMEKÇİ

  3. Tez No

    86462

    Ailesel Akdeniz ateşli çocuklarda büyümenin değerlendirilmesi ve IGF-1 düzeyleri

    Evaluation of grwoth and IGF-1 levels in children with FMF

    ERAY SAVGAN GÜROL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEZER HATEMİ

    PROF. DR. NİL ARISOY

  4. Tez No

    86742

    Ailesel Akdeniz ateşinde renal tübüler göstergeler ve mikroalbuminüri

    Renal tubular markers and microalbuminuria in familial Mediterranean fever

    SEMRA AKKUŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NİL ARISOY

  5. Tez No

    91761

    Ailesel Akdeniz Ateşi hastaları ve heterozigot akrabalarında atak ve atak dışı dönemde interlökin-6 ve soluble interlökin-6 reseptör düzeyleri

    Levels of interleukin-6 and its soluble receptor in familial mediterranean fever patients during acute attack and attack free period and their first degree relatives

    SELDA ÖKTEM

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2000

    RomatolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET TUNCA

Geri Dön