Klinik örneklerden izole edilen Acinetobacter baumannii izolatlarında plazmid aracılı kinolon direncinin ve biyofilm ilişkili genlerin belirlenmesi
Determination of plasmid-mediated quinolone resistance and biofilm-associated genes in Acinetobacter baumannii isolates from clinical samples
- Tez No: 1013148
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ CEREN BAŞKAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Moleküler Tıp, Mikrobiyoloji, Molecular Medicine, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Amasya Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Acinetobacter baumannii, nozokomiyal enfeksiyonlarda sık karşılaşılan, çoklu ilaca dirençli yapısı ve biyofilm oluşturması nedeniyle tedavisi zor ve mortalitesi yüksek olan Gram-negatif fırsatçı bir patojendir. Bu çalışmada, klinik örneklerden elde edilen A. baumannii izolatlarının antibiyotik direnç profilleri ile biyofilm oluşum özelliklerinin fenotipik ve genotipik yöntemlerle değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Bu kapsamda üç farklı hastaneden elde edilen 80 hastaya ait klinik örneklerden A. baumannii izole edilmiştir. İzolatların identifikasyonu fenotipik olarak VITEK-2 Compact ve BD Phoenix sistemleri kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Antibiyotik duyarlılık profilleri tigesiklin ve kolistin için mikrodilüsyon; diğer antibiyotikler için Kirby–Bauer disk difüzyon yöntemi ile belirlenmiştir. Biyofilm oluşumu fenotipik olarak mikrotitrasyon plağı ve Kongo kırmızısı agar yöntemleriyle değerlendirilmiştir. Plazmid aracılı kinolon direnç genleri (qnrA, qnrB, qnrS), biyofilm oluşumuyla ilişkili genler (bap, csuE, ompA), sınıf 1 integron (intI1) ve genişlemiş spektrumlu β-laktamaz (GSBL) genleri (blaTEM, blaSHV, blaCTX-M) polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile analiz edilmiştir. Karbapenemaz üretimi Modifiye Hodge testi ile belirlenmiştir. İzolatlar en sık %67,5 oranında yoğun bakım ünitelerinden ve %38,75 oranında trakeal aspirat örneklerinden elde edilmiştir. Antibiyotik duyarlılık testleri sonucunda seftazidime %100, imipenem, meropenem, gentamisin ve piperasilin-tazobaktama %93,75, siprofloksasin ve levofloksasine %92,5, trimetoprim-sülfametoksazole %88,75 ve tobramisine %77,5 oranında direnç belirlenmiştir. Kolistin direnci %10 olarak saptanırken, tigesiklin tüm izolatlara karşı %100 duyarlı bulunmuştur. Mikrotitrasyon yöntemiyle izolatların %47,5'inin biyofilm oluşturduğu saptanmıştır. Genotipik analizlerde biyofilm ilişkili genlerden ompA izolatların %93,75'inde, csuE %80'inde saptanırken, bap yalnızca %2,5 oranında tespit edilmiştir. Kinolon direnç genleri arasında qnrA %67,5 ile en sık görülürken, qnrS ve qnrB genleri sırasıyla %16,25 ve %6,25 oranlarında belirlenmiştir. İzolatların %60'ında intI1 geni pozitif bulunmuş, GSBL genlerinden blaSHV %40, blaCTX-M %35 ve blaTEM %7,5 oranında saptanmıştır. Modifiye Hodge testi ile izolatların %68,75'inde karbapenemaz üretimi belirlenmiştir. Sonuç olarak bu çalışma, A. baumannii izolatlarında çoklu antibiyotik direnci ve biyofilm oluşumunun önemli bir sorun olduğunu ortaya koymakta, bu durumun hastane enfeksiyonlarının kontrolü ve etkili antibiyotik stratejilerinin dikkate alınması gerektiğini göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Acinetobacter baumannii is a Gram-negative opportunistic pathogen that is frequently encountered in nosocomial infections and is associated with high mortality due to its multidrug-resistant nature and ability to form biofilms, making treatment difficult. In this study, it was aimed to evaluate the antibiotic resistance profiles and biofilm formation characteristics of A. baumannii isolates obtained from clinical specimens using phenotypic and genotypic methods. Within this scope, A. baumannii was isolated from clinical samples obtained from 80 different patients from three different hospitals. The identification of the isolates was performed phenotypically using the VITEK-2 Compact and BD Phoenix systems. Antibiotic susceptibility profiles were determined by the microdilution method for tigecycline and colistin, and by the Kirby–Bauer disk diffusion method for other antibiotics. Biofilm formation was phenotypically evaluated using the microtiter plate and Congo red agar methods. Plasmid-mediated quinolone resistance genes (qnrA, qnrB, qnrS), biofilm-associated genes (bap, csuE, ompA), class 1 integron (intI1), and extended-spectrum β-lactamase (ESBL) genes (blaTEM, blaSHV, blaCTX-M) were analyzed by polymerase chain reaction (PCR). Carbapenemase production was determined by the Modified Hodge test. The isolates were most frequently obtained from intensive care units (67.5%) and from tracheal aspirate samples (38.75%). Antibiotic susceptibility testing revealed resistance rates of 100% to ceftazidime; 93.75% to imipenem, meropenem, gentamicin, and piperacillin–tazobactam; 92.5% to ciprofloxacin and levofloxacin; 88.75% to trimethoprim–sulfamethoxazole; and 77.5% to tobramycin. Colistin resistance was detected at a rate of 10%, while tigecycline showed 100% susceptibility against all isolates. Biofilm formation was detected in 47.5% of the isolates by the microtiter plate method. In genotypic analyses, among biofilm-associated genes, ompA was detected in 93.75% of the isolates and csuE in 80%, whereas bap was detected at a low rate of 2.5%. Among quinolone resistance genes, qnrA was the most frequently detected gene (67.5%), followed by qnrS (16.25%) and qnrB (6.25%). The intI1 gene was found to be positive in 60% of the isolates, while ESBL genes blaSHV, blaCTX-M, and blaTEM were detected at rates of 40%, 35%, and 7.5%, respectively. Carbapenemase production was identified in 68.75% of the isolates by the Modified Hodge test. In conclusion, this study demonstrates that multidrug resistance and biofilm formation constitute a significant problem in A. baumannii isolates, indicating that this issue should be taken into consideration in the control of hospital infections and the development of effective antibiotic treatment strategies.
Benzer Tezler
- Acinetobacter izolatlarında plazmid aracılı kinolon direnç genlerinin araştırılması
Investigation of plasmid-mediated quinolone resistance genes in acinetobacter isolates
NQOBILE MZULWINI
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
MikrobiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YELİZ TANRIVERDİ ÇAYCI
- Acinetobacter baumannii izolatlarında plazmit aracılı pAMC vebeta-laktamaz direnç genlerinin belirlenmesi
Detection of plasmid mediated pAMC and beta- lactamase resistance genes in Acinetobacter baumannii isolates
RAND KAMIL MAJEED JAWAHERI
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
MikrobiyolojiKırşehir Ahi Evran ÜniversitesiMoleküler Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YUSUF KENAN DAĞLIOĞLU
- Acinetobacter baumannii klinik suşlarının fenotipik ve genotipik özelliklerinin araştırılması
Investigation of phenotypic and genotypic characteristics of acinetobacter baumannii clinical isolates
NEZAHAT KOŞAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiHitit ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞE SEMRA GÜRESER
- Klinik örneklerden izole edilen karbapenem dirençli acinetobacter baumannii izolatlarında karbapenemazların moleküler yöntemlerle incelenmesi
Investigation of carbapenemases by molecular methods in carbapenem-resistant acinetobacter baumannii isolates isolated from clinical specimens
NURSEDA BÜRKÜK
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
MikrobiyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ORHAN BAYLAN
- KLİNİK ÖRNEKLERDEN İZOLE EDİLEN ÇOKLU İLACA DİRENÇLİ ACİNETOBACTER BAUMANNİİ İZOLATLARINDA ÇEŞİTLİ ANTİBİYOTİK KOMBİNASYONLARININ İN VİTRO SİNERJİSTİK ETKİSİNİN ARAŞTIRILMASI
Investigation of the In Vitro Synergistic Effects of Various Antibiotic Combinations in Multidrug-Resistant Acinetobacter baumannii Isolates Obtained from Clinical Specimens
GIULKHANIM YUSIFLI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA KÖKSAL ÇAKIRLAR