Geri Dön

Hipermukoviskoz Klebsiella pneumoniae klinik izolatlarının, virülans ve karbapenem direnç genlerinin, antibiyotik direnç paterninin, epidemiyolojik özelliklerinin ve risk faktörlerinin araştırılması

Investigation of virulence and carbapenem resistance genes, antibiotic resistance pattern, epidemiological characteristics and risk factors of hypermucoviscous Klebsiella pneumoniae clinical isolates

PDF İndir

  1. Tez No: 1001206
  2. Yazar: ENİS TOPCU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. GÜLÇİN BAYRAMOĞLU
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji, Microbiology, Infectious Diseases and Clinical Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Amaç: Çeşitli klinik örneklerden izole edilen hipermukoviskoz Klebsiella pneumoniae (HmKp) klinik izolatlarının, virülans ve karbapenem direnç genlerinin, antibiyotik direnç paterninin, epidemiyolojik özelliklerinin ve risk faktörlerinin araştırılması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Çalışmamızda Karadeniz Teknik Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı'nda Nisan 2023-Nisan 2025 tarihleri arasında izole edilen 136 K. pneumoniae suşu incelenmiştir. İzolatların hipermukoviskozitesi string test ile, antibiyotik duyarlılıkları disk difüzyon testi ve BD Phoenix M50™ (Becton Dickinson Diagnostic Instrument Systems, Sparks, Md, ABD) otomatize sistemi ile, virülans ve karbapenemaz genleri polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile, moleküler epidemiyolojisi multilokus dizi tiplendirme (MLST) yöntemiyle araştırılmıştır. HmKp suşlarından iucA geni pozitif olan suşlar hipervirülan Klebsiella pneumoniae (HvKp) kabul edilmiştir. Bulgular: Çalışmamızda 68 hipermukoviskoz ve 68 non-hipermukoviskoz suş tanımlanmıştır. 68 hipermukoviskoz suştan 16'sında iucA geni saptanarak HvKp olarak kabul edilmiştir. Hipermukoviskoz suşlar antibiyotiklere genel olarak daha duyarlı olsalar da sefiderokol için direnç oranı daha yüksek bulunmuştur. En sık görülen karbapenemaz türü KPC olmuştur. Suşların 12'si blaKPC, 9'u blaOXA-48 1'i blaNDM pozitif bulunmuştur. HvKp suşlarının, 6'sının (%37,5) karbapenem dirençli HvKp (KD-HvKp) olduğu tespit edilmiştir. KD-HvKp suşlarının 3'ü blaKPC, 2'si blaOXA-48, 1'i blaNDM pozitif saptanmıştır. rmpA, rmpA2, iucA, iroB virülans genleri ve K2 geni hipermukoviskozite ile ilişkili bulunmuştur. 11 HmKp suşuna sekans tiplendirmesi yapılmıştır. ST307, ST2096 gibi yüksek riskli tipler tespit edilmiştir. Diyabet, invaziv hastalık gibi bazı risk faktörlerinin hipermukoviskozite ve hipervirülansla ilişkili olduğu tespit edilmiştir. Sonuç: Çalışmamız bölgemizde dünyadaki yüksek riskli klonlarla ilişkili ve karbapenemaz genleri saptanan HvKp izolatlarının varlığını göstermiştir. Özellikle, karbapenemaz genleri saptanan ve sefiderokole dirençli HvKp suşlarının saptanması endişe vericidir. Bu bulgular, HvKp'nin epidemiyolojik özelliklerinin ve tedavisinin belirlenmesi açısından büyük önem taşımakta; önleme ve kontrol stratejilerinin oluşturulması için temel veri sağlamaktadır. Bazı risk faktörlerinin HmKp ve HvKp enfeksiyonlarıyla ilişkili olması, bu tür enfeksiyonların ön görülmesinde fayda sağlayabileceğini göstermektedir.

Özet (Çeviri)

Objective: The objective of this study is to investigate the virulence and carbapenem resistance genes, antibiotic resistance patterns, epidemiological characteristics, and risk factors of hypermucoviscous K. pneumoniae (HmKp) clinical isolates obtained from various clinical specimens. Material and Methods: In this study, 136 K. pneumoniae strains isolated at the Medical Microbiology Laboratory of Karadeniz Technical University Faculty of Medicine between April 2023 and April 2025 were examined. Hypermucoviscosity of the isolates was assessed using the string test, antibiotic susceptibilities were determined by disk diffusion test and BD Phoenix M50™ (Becton Dickinson Diagnostic Instrument Systems, Sparks, Md, ABD) automated system, virulence and carbapenemase genes were investigated by polymerase chain reaction (PCR), and molecular epidemiology was analyzed using the multilocus sequence typing (MLST) method. Among the HmKp strains, iucA gene positive strains were accepted as hypervirulent Klebsiella pneumoniae (HvKp). Results: In our study, 68 hypermucoviscous and 68 non-hypermucoviscous strains were identified. Of the 68 hypermucoviscous strains, 16 were identified as having the iucA gene and were accepted as HvKp. Although the hypermucoviscous strains were generally more susceptible to antibiotics, a higher resistance rate was observed for cefiderocol. The most common carbapenemase type identified was KPC. 12 of the strains were blaKPC, 9 were blaOXA-48 and 1 was blaNDM positive. Of the HvKp strains, 6 (37.5%) were carbapenem resistant HvKp (KD-HvKp). Among the KD-HvKp strains, 3 were blaKPC, 2 were blaOXA-48 and 1 was blaNDM positive. The virulence genes rmpA, rmpA2, iucA, iroB as well as the K2 gene, were found to be associated with hypermucoviscosity. Sequence typing was performed for 11 HmKp strains. High-risk types such as ST307 and ST2096 were identified. Certain risk factors such as diabetes, invasive disease were found to be associated with hypermucoviscosity and hypervirulence. Conclusion: Our study has demonstrated the presence of HvKp isolates in our region that are associated with high-risk clones worldwide and harbor carbapenemase genes. Especially, the detection of HvKp strains that carry carbapenemase genes and are resistant to cefiderocol is alarming. These findings are of great importance for defining the epidemiological characteristics and treatment of HvKp, and provide fundamental data for developing prevention and control strategies. The association of certain risk factors with HmKp and HvKp infections suggests that these factors may be useful in predicting such infections.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    804966

    Hastane kaynaklı kan dolaşım enfeksiyon etkeni klebsiella pneumoniae virülans genlerinin tüm genom dizileme yöntemi ile değerlendirilmesi

    Evaluation of virulence genes of klebsiella pneumoniae causing hospital-acquired bloodstream infection by whole genome sequencing method

    ŞEYDA ŞİLAN OKALİN YAMAÇ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İBRAHİM MEHMET ALİ ÖKTEM

  2. Tez No

    778067

    NDM-1 karbapenemaz üreten klinik Klebsiella pneumoniae izolatlarında antibiyotik direncinin ve virülans genlerin karakterizasyonu

    Characterization of antibiotic resistance and virulance genes in clinical Klebsiella pneumoniae isolates producing NDM-1 carbapenemase

    ÖMER KARAKAMIŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiKırşehir Ahi Evran Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ELİF SEVİM

  3. Tez No

    851786

    Prevalence and immune modulator role of the peg344 gene among hypervirulent Klebsiella pneumoniae

    Peg344 geninin hipervirülan Klebsiella pneumoniae'deki yaygınlığı ve immün modülatör rolü

    GÜZ EKİNCİ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    MikrobiyolojiKoç Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FÜSUN CAN

  4. Tez No

    779613

    Molecular determination of the ure a gene in Klebsiella pneumonia with hypermucoviscos resistant to multipleadents isolated from hospital patients

    Hastane hastalarından izole edilen multipleadentlere dirençli hipermukoviskoz olan Klebsiella pnömonilerinde üre a geninin moleküler tayini

    JAAFAR JAMEEL KADHIM AL-MAMOORI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ YAŞAR KEMAL YAZGAN

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MARWA HAMEED ALKHAFAJI

Geri Dön