Geri Dön

Comparison of intestinal, oral, skin and eye microbiomes in patients with Behçet's disease

Behçet hastalarinda atak anında ve remisyonda intestinal, oral, deri ve göz mikrobiyomunun karşılaştırılması

PDF İndir

  1. Tez No: 983207
  2. Yazar: ÖZGÜR CAN EREN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. FÜSUN CAN, PROF. DR. ARZU RUACAN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Allerji ve İmmünoloji, Mikrobiyoloji, Allergy and Immunology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Koç Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: İmmünoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Giriş Behçet Hastalığı pek çok sistemin etkilendiği multisistemik bir hastalıktır. Doğuştan gelen ve edinsel immün sistem aralarında olmak üzere çeşitli faktörler hastalığın patogenezini açıklamada ileri sürülmüştür. Bunun yanında, vücudun farklı bölgelerinde mikrobiyota değişiklikleri, Behçet Hastalığı dahil olmak üzere, kronik hastalıklarda bildirilmiştir. Bu çalışmanın amacı, bu doğrultuda, atak ve remisyonda Behçet Hastalığında görülen deri, fekal, oral ve göz mikrobiyom değişikliklerinin saptanmasıdır. Yöntem İki yıl longitudinal takiple, 20 adet Behçet hastası çalışmaya dahil edilmiştir. Hastalar atak ve remisyon periyotları boyunca takip edilmiş, demografik veriler ve klinik bulgular ayrıca kaydedilmiştir. Mikrobiyom analizi için örnekler antekubital ve popliteal fossalar (deri), gaita/dışkı, oral kavite ve konjonktival yüzeylerden (göz) elde edilmiştir. Tüm örnekler DNA ekstraksiyonu, V1-V9 primerleri aracılığıyla gen amplifikasyonu ve sekanslamaya tabii tutulmuştur. Mikrobiyal diversite analizi alfa çeşitliliği ve beta çeşitliliği (alpha/beta diversity) ile gerçekleştirilmiş, taksonomik kompozisyon ise relative abundance analizi (göreceli bolluk) ile irdelenmiştir. Bulgular Fekal örneklerde, Firmicutes/Bacteroidetes oranında istatiksel olarak anlamlı bir artış saptanmıştır. Atak vs kontrol Firmicutes için %77 vs %84, Bacteroidetes için %19 vs %4 bulunmuş olup gastrointestinal disbiyozu destekler niteliktedir. Species (tür) incelemesinde, Faecalibacterium prausnitzii'de —butirat üreten yararlı bir bakteri— atak örneklerinde azalma görülmüştür (%3 vs %14). Genus (cins) incelemesinde, Catenibacterium'un remisyon örneklerinde (%32 vs %23), Collinsella'nın ise atakta (%10 vs %7). daha çok olduğu izlenmiştir. Deri mikrobiyomu incelemesinde, hem atak hem remisyon örneklerinde genus düzeyinde en büyük grup Staphylococcus bulunmuştur; ancak relative abundance atak örneklerinde (%53.0), sağlıklı kontrollerden (%62.0) daha az saptanmıştır. Benzer şekilde, Cutibacterium atak örneklerinde (%2.1), sağlıklı kontrollere (%4.5) kıyasla azalmıştır. Buna karşın, Staphylococcus atak örneklerinde remisyondan fazla saptanmıştır (%45 vs %27). Oral mikrobiyotada baskın genera Streptococcus, Haemophilus ve Veillonella bulunmuştur. Atak örneklerine Haemophilus'ta belirgin bir azalma (%3 vs %12) saptanırken, Prevotella'nın remisyon örneklerinde yüksek olduğu görülmüştür. Göz örneklerinde, Staphylococcus (%9 vs %21) ve Corynebacterium'un (%12 vs %19) ataklarda daha az olduğu ortaya çıkmıştır. Buna karşılık, Pseudomonas atak örneklerinde belirgin olarak daha yüksektir (%69 vs %39). Species düzeyinde, Pseudomonas aeruginosa atak örneklerinde anlamlı ölçüde yüksektir. Staphylococcus epidermidis ataklarda azalmış (%5 vs %15), Cutibacterium acnes sabit kalmıştır (%8). Remisyonda, Pseudomonas aeruginosa azalmış (%60 vs %71), Staphylococcus capitis artmıştır (%6 vs %1). Sonuç Çalışmamız, Behçet hastalarında atak döneminde fekal örneklerde artmış Firmicutes/Bacteroidetes oranını ve olası bir disbiyozu ortaya koymuştur. Aktif hastalıkta kısa zincirli yag asidi üreten bakterilerin azaldığını, remisyonda ise yeniden arttığını göstermiştir. Deri miktobiyomunda görülen Staphylococcus değişimleri, kutanöz mikroçevrenin bozulduğuna işaret etmiştir. Benzer şekilde oral örneklerde, azalmış Haemophilus ve artmış Prevotella lokal mukozal disregülasyonu düşündürmüştür. Atak döneminde oküler mikrobiyomda görülen artmış Pseudomonas'ın oküler inflamasyonla ilgili olabileceği düşünülmüştür. Sonuç olarak çalışmamız Behçet hastalığı ilişkili spesifik mikrobiyom değişikliklerini aydınlatmış ve hastalık patofizyolojisinde mikrobiyomun sahip olabileceği rolü ortaya koymuştur.

Özet (Çeviri)

Introduction Behçet disease (BD) is a chronic inflammatory disorder with multisystemic involvement. Various factors have been implicated in its pathogenesis, including dysregulation of both the innate and adaptive immune systems. Moreover, alterations in microbiota composition across different body sites have been associated with several chronic diseases, including BD. The aim of our study was to investigate microbiota changes in skin, fecal, oral, and ocular samples of BD patients during both attack and remission phases. Materials and Methods A total of 20 patients diagnosed with Behçet disease were included in this longitudinal follow-up study, conducted over a period of two years. Patients were monitored during both attack and remission periods. Demographic data and clinical findings were collected throughout the study. For microbiota analysis, samples were obtained from the antecubital and popliteal fossae (skin), feces, oral cavity, and conjunctival surfaces (eye). DNA was extracted from all samples, and 16S rRNA gene amplification was performed using V1–V9 primers, followed by sequencing. Microbial diversity was assessed using alpha and beta diversity indices, and taxonomic composition was evaluated through relative abundance analysis. Results In fecal samples, a statistically significant increase in the Firmicutes to Bacteroidetes ratio was observed during the attack phase (77% vs 84% for Firmicutes, and 19% vs 4% for Bacteroidetes), indicating gastrointestinal dysbiosis. At the species level, Faecalibacterium prausnitzii —a beneficial butyrate-producing bacterium—was reduced in attack samples (3% vs 14%). At the genus level, Catenibacterium was more abundant in remission samples (32% vs 23%), while Collinsella was relatively higher in attack (10% vs 7%). Regarding the skin microbiome, at the genus level, Staphylococcus was the most dominant taxon in both control and attack samples; however, its abundance was lower in the attack group (53.0%) compared to controls (62.0%). Similarly, Cutibacterium was reduced in the attack samples (2.1%) compared to controls (4.5%). In contrast, Staphylococcus was more abundant in attack samples than in remission (45% vs 27%). In the oral microbiota, dominant genera included Streptococcus, Haemophilus and Veillonella. A notable decrease in Haemophilus was found during attacks (3% vs 12%), while Prevotella was relatively increased in remission samples. In eye samples, Staphylococcus and Corynebacterium were less abundant in the attack group (9% vs 21% and 12% vs 19%, respectively). Conversely, Pseudomonas was markedly higher in the attack group (69% vs 39%). At the species level, Pseudomonas aeruginosa was significantly more abundant in attack samples. Staphylococcus epidermidis was reduced in attack (5% vs 15%), while Cutibacterium acnes remained stable (8% in both groups). In remission, Pseudomonas aeruginosa abundance decreased (60% vs 71%) and Staphylococcus capitis abundance increased (6% vs 1%). Conclusion Our study demonstrated that during the attack phase in BD patients, an increased Firmicutes to Bacteroidetes ratio in fecal samples might reflect intestinal dysbiosis. Short-chain fatty acid–producing bacteria were reduced during active disease and recovered in remission. In the skin microbiota, fluctuations in Staphylococcus suggested a disrupted cutaneous microenvironment during disease activity. In oral samples, decreased Haemophilus and increased Prevotella might reflect local mucosal dysregulation. Ocular microbiota of BD patients during attacks showed increased Pseudomonas and could be associated with ocular inflammation. Overall, our findings highlighted site-specific microbial shifts associated with disease state and suggested a potential role of microbiota in the pathophysiology of Behçet disease.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    718053

    Sıçan modelinde radyoterapiye bağlı oluşturulacak cilt hasarının tedavisinde pioglitazon ve yağ greftinin etkilerinin gösterilmesi ve karşılaştırılması

    Comparison of the effectiveness of pioglitazone and fat grafting in the treatment of radiation-induced skin injury in the rat model

    SÜLEYMAN ÇAKMAK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Plastik ve Rekonstrüktif CerrahiDokuz Eylül Üniversitesi

    Plastik Rekonstrüktif ve Estetik Cerrahi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HALUK VAYVADA

  2. Tez No

    503961

    HLA-B51 pozitif behçet hastalarında HLA-B*51 allellerinin araştırılması

    Başlık çevirisi yok

    SİNEM TOPÇU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Tıbbi Biyolojiİzmir Katip Çelebi Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TÜLAY KILIÇASLAN AYNA

  3. Tez No

    604206

    Jinekolojik cerrahi sonrası sakız çiğneme ve sıcak uygulamanın hastaların bağırsak fonksiyonlarına etkisinin karşılaştırılması

    Comparison of the effects of gum chewing and heat treatment on patients'intestinal functions after gynecologic surgery

    HATİCE AYDIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    HemşirelikUludağ Üniversitesi

    Hemşirelik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ NURSEL VATANSEVER

  4. Tez No

    919272

    Bağırsak hasar modellerinde kemik iliği mezenkimal kök hücre ve bağırsak mezenkimal kök hücrelerin rejeneratif ve immün modülatuvar etkilerinin karşılaştırılması

    Comparison of regenerative and immune modulatory effecets of bone marrow and intestinal mesenchymal stem cells i intestinal damage models

    BURCU PERVİN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2025

    BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Kök Hücre Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATİMA AERTS KAYA

  5. Tez No

    503975

    Crohn hastalığında aktif inflamasyonun değerlendirilmesinde mr enterografide difüzyon ağırlıklı ve kontrastlı görüntülemenin tanısal etkinliğinin karşılaştırılması

    Comparison of the diagnostic efficacy of diffusion weighted and contrast-enhanced imaging in mr enterography in assessment of active inflammation in crohn's disease

    SÜLEYMAN BEKİRÇAVUŞOĞLU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Radyoloji ve Nükleer TıpKaradeniz Teknik Üniversitesi

    Radyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYŞEGÜL CANSU

Geri Dön