Fungal bir kütinaz enziminin klonlanması, ekspresyonu ve pet parçalama potansiyelinin belirlenmesi
Cloning, expression and determination of pet degradation potential of a fungal cutinase enzyme
- Tez No: 982599
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ UĞUR UZUNER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Karadeniz Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Çevresel plastik kirliliği küresel olarak endişe verici boyutlara ulaşmıştır. Günümüz mekanik ve kimyasal geri dönüşüm yöntemleri yetersiz kaldığından, yenilikçi ve sürdürülebilir çözümlerin geliştirilmesi hayati önem taşımaktadır. Polietilen tereftalat (PET) kirliliği, polimerin yaygın kullanımı, kristal yapısı ve biyolojik bozunmaya karşı doğal direnci nedeniyle önemli bir çevre sorunudur. Bazı doğal mikroorganizmalar PET'i hidrolize etme kabiliyeti gösterse de endüstriyel uygulanabilirlikleri sınırlıdır. PET polimerini parçalayabilen polietilen tereftalat hidrolaz (PETaz), esteraz, lipaz ve kütinaz gibi enzimler tanımlanmıştır. Ancak yüksek PET parçalama potansiyelli kütinaz ve PETaz enzimleri, endüstriyel uygulamalarda daha çok tercih edilmektedir. Bu tez çalışmasında, biyokontrol ajanı Trichoderma. harzianum CBS 226,95 kütinaz enziminin PET parçalama potansiyeli araştırılmıştır. Enzim karakterizasyon çalışmaları, E. coli ekspresyon sisteminde gerçekleştirilmesinin akabinde, optimum enzimatik koşullar; 10 mM pNPA varlığında, pH 6, sıcaklık 50 °C ve inkübasyon süresi 5 dakika olarak belirlenmiştir. Saf enzimin Km, Vmax ve spesifik aktivite parametreleri ise; sırasıyla 0,85 mM, 11,52 (µM/min) 11,52 µmol/min/mg olarak hesaplanmıştır. Mevcut bulgular, tarımsal uygulamalarda patojen kontrolü için kullanılan Trichoderma türlerinin, çevresel PET atıklarını parçalamada etkin enzimsel profile sahip olduklarını göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Environmental plastic pollution has reached alarming levels globally. As current mechanical and chemical recycling methods are inadequate, the development of innovative and sustainable solutions is vital. Polyethylene terephthalate (PET) pollution is a significant environmental problem due to the polymer's widespread use, crystalline structure, and natural resistance to biodegradation. While some natural microorganisms demonstrate the ability to hydrolyze PET, their industrial applicability is limited. Enzymes such as polyethylene terephthalate hydrolase (PETase), esterase, lipase, and cutinase have been identified that can degrade PET polymer. However, cutinase and PETase enzymes with high PET degradation potential are more preferred in industrial applications. In this thesis, the PET degradation potential of the biocontrol agent Trichoderma harzianum CBS 226.95 cutinase was investigated. Following enzyme characterization studies in an E. coli expression system, optimum enzymatic conditions were determined: In the presence of 10 mM pNPA, pH was 6.0, temperature was 50 °C, and incubation time was 5 minutes. The Km, Vmax, and specific activity parameters of the pure enzyme were calculated as 0.85 mM, 11.52 (µM/min), and 11.52 µmol/min/mg, respectively. The present findings demonstrate that Trichoderma species used for pathogen control in agricultural applications have an effective enzymatic profile for degrading environmental PET waste.
Benzer Tezler
- Cloning of chitinase a gene (chiA) from Serratia marcescens BN10 and its expression in coleoptera-specific Bacillus thuringiensis
Kitinaz a geninin (chiA) Serratia marcescens BN10'dan klonlaması ve coleoptera-spesifik Bacillus thuringiensiste ifade edilmesi
SEZER OKAY
Yüksek Lisans
İngilizce
2005
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. GÜLAY ÖZCENGİZ
Y.DOÇ.DR. MELEK ÖZKAN
- Yeni bir rekombinant fungal kitinazın heterolog ekspresyonu ve biyokimyasal karakterizasyonu
Heterologous expression and biochemical characterization of a novel recombinant fungal chitinase
ABDULSAMET ÖZDEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
BiyoteknolojiYıldız Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ GÜNSELİ KURT GÜR
- Recombinant production and characterization of chitinase enzyme from Pseudomonas mandelii KGI_MA19
Pseudomanas mandelii KGI_MA19 organızmasına ait kitinaz enziminin rekombinant üretimi ve karakterizasyonu
EMİNE TUĞÇE SARAÇ CEBECİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Mikrobiyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER
- Aydın ilinde çilek kök hastalıklarına karşı antagonist bakterilerle biyolojik savaş
Biological control of strawberry root diseases by rhizobacteria in Aydın province
ÜMİT ÖZYILMAZ
Doktora
Türkçe
2007
ZiraatAdnan Menderes ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KEMAL BENLİOĞLU
- Trichoderma atroviride'den elde edilen kitinazın kısmi saflaştırılması
Partial purification of chitinase from Trichoderma atroviride
ZEYNEP ÇAĞLAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
BiyokimyaYıldız Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İNCİ ARISAN ATAÇ