Hemolitik anemide COP II yolağı genlerinin fonksiyonel analizleri
COP II pathway genes' functional analyses in hemolytic anaemia
- Tez No: 973829
- Danışmanlar: PROF. DR. MÜGE SAYİTOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Hematoloji, Genetik, Hematology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
COPII kompleksi, ER'den Golgi'ye proteinlerin taşınmasını sağlayan, evrimsel olarak korunmuş bir vezikül kaplama sistemidir. Beş ana proteinden oluşur: sitozolik protein kompleksleri Sec23–Sec24, Sec13–Sec31 ve Sar1. COPII'nin yapısal veya fonksiyonel kusurları, özellikle yüksek düzeyde protein sentezi ve salgısı gerektiren dokularda hücresel homeostazı bozarak patolojik fenotiplere yol açabilmektedir. Protein taşınımı tüm hücrelerde gerçekleşse de, COPII bileşenlerindeki kusurlar hücre tipine özgü fenotiplere neden olur; en belirgin etkilenim ise belirli kargoları yüksek miktarda salgılayan hücrelerde ortaya çıkar. ER taşıma mekanizmasındaki bozuklukların, koagülasyon faktörleri V ve VIII'in kombine eksikliği (F5F8D) ve konjenital diseritropoietik anemi tip II (KDAII) ile ilişkili olduğu bildirilmiştir. Bu tez çalışmasında, ayırıcı tanısı yapılamamış ve KHA şüphesi ile takip edilen bir olguda ekzom dizileme ile saptanan COPII yolak genlerinden SEC31A ve MCFD2'nin eritropoez sürecindeki rolleri ve KHA patogenezine olası katkılarının araştırılması amaçlanmıştır. Bu kapsamda, söz konusu genlerin fonksiyonlarını incelemek üzere in siliko araştımalar ve iki farklı hücre modeli geliştirilmesi için çalışmalar yapılmışıtr. Hedef genler/varyantlar için öncelikle in-silico araçlarla enformatik analizler gerçekleştirilmiştir. SEC31A ve MCFD2'nin hematopoetik dokularda yüksek düzeyde ifade edildiği görülmüştür. Primer hasta örneğinde (ANE-3) SEC31A gen anlatımının belirgin şekilde azaldığı görüşürken, MCFD2 gen anlatımında anlamlı bir farklılık saptanmamıştır. SEC31A ve MCFD2 gen varyasyonların modellenmesi amacıyla hedefe yönelik mutagenez yapılmış ve MCFD2 geninde heterozigot ve homozigot mutasyonlar elde edilmiştir. shRNA uygulamalarında her bir gen için üç farklı bölgeden baskılama yapabilecek oligolar kombine olarak verilmiş ancak hücrelerin proliferasyonunun baskılandığı görülmüştür. Elde edilen bulgular ve geliştirilen modellerin, eritropoez mekanizmalarının daha iyi anlaşılmasına katkı sağlaması ve ilerleyen çalışmalarda bozulmuş eritropoeze bağlı KHA fenotipinin aydınlatılmasına olanak vermesi beklenmektedir.
Özet (Çeviri)
The COPII complex is an evolutionarily conserved vesicle-coating system that mediates protein transport from the endoplasmic reticulum (ER) to the Golgi apparatus. It consists of five core proteins: the cytosolic complexes Sec23–Sec24, Sec13–Sec31, and the small GTPase Sar1. Structural or functional defects in COPII disrupt cellular homeostasis, particularly in tissues with high protein synthesis and secretion demands, thereby leading to pathological phenotypes. Although protein transport occurs in all cells, defects in COPII components give rise to cell type–specific phenotypes; the most pronounced effects are observed in cells that secrete large amounts of specific cargos. Defects in ER transport machinery have been reported to be associated with combined deficiency of coagulation factors V and VIII (F5F8D) as well as congenital dyserythropoietic anemia type II (CDAII). In this context, in silico studies were conducted to investigate the functions of the genes in question and two different cell models were developed. Computational analyses were first performed on the target genes/variants using in silico tools. SEC31A and MCFD2 were found to be highly expressed in haematopoietic tissues. In the primary patient sample (ANE-3), a significant decrease in SEC31A gene expression was observed, whereas no significant difference in MCFD2 gene expression was detected. Targeted mutagenesis was then performed to model SEC31A and MCFD2 gene variations. This resulted in the generation of both heterozygous and homozygous mutations in the MCFD2 gene. In shRNA applications, oligonucleotides capable of suppressing three different regions for each gene were administered in combination; however, cell proliferation was suppressed. The findings obtained and the models developed in this study are expected to contribute to a better understanding of the mechanisms of erythropoiesis and, through future studies, provide insights into the HHA phenotype resulting from defective erythropoiesis.
Benzer Tezler
- Anemide serum ferritin düzeyleri ve hematolojik parametrelerle ilişkisi
Başlık çevirisi yok
HAYAL ÖZKILIÇ
- Sistemik lupus eritematozus tanılı hastalarda sitopeni gruplandırılması ve immün hemolitik anemi sıklığının belirlenmesi
Classification of cytopenia and determination of the frequency of immune hemolytic anemia in patients with systemic lupus erythematosus
TUĞBA ALTUNKAYA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
HematolojiSağlık Bilimleri Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. OSMAN YOKUŞ
- Herediter sferositoz hastalarında bozulmuş kemik metabolizması
Disordered bone metabolism in hereditary spherocytosis patients
MAHMUT CESUR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATİH TEMİZ
- Glukoz 6 fosfat dehidrogenaz enzim eksikliği olan çocuk hastaların klinik ve laboratuvar özellikleri
Clinical and laboratory features of pediatric patients with glucose-6-phosphate dehydrogenase enzyme deficiency
BİLGE TAŞLICA YILMAZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıManisa Celal Bayar ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞEN TÜREDİ YILDIRIM
- Otoimmün hemolitik anemi ve idyopatik trombositopenik purpuralı hastalarda periferik kan T regulatuar hücre ve B lenfosit alt grup değişiklikleri
The change of peripheral blood T regulatory cell and B lymphocyte subgroups in patients with autoimmune hemolytic anemia and idiopathic thrombocytopenic purpura
SEMİHA AYHAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
HematolojiKaradeniz Teknik Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA YILMAZ