CD24/CD44 tiplemesi yapılan pankreatik adenokarsinom hücrelerinde kemoterapötik ajan maruziyeti sonrası hedef biyobelirteç analizi
Bi̇omarker analysis following chemotherapeutic agent exposure in pancreatic adenocarcinoma cells characterized by CD24/CD44 typing
- Tez No: 970197
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ MEHVEŞ PODA
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Pankreas duktal adenokarsinom, Gemsitabin, SRSF1, ULBP1, Biyobelirteç, Pancreatic ductal adenocarcinoma, Gemcitabine, SRSF1, ULBP1, Biomarker
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Gökgöz A. CD24/CD44 tiplemesi yapılan pankreatik adenokarsinom hücrelerinde kemoterapötik ajan maruziyeti sonrası hedef biyobelirteç analizi. İstanbul Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Genetik. Doktora Tezi. İstanbul. 2025 Pankreas duktal adenokarsinom (PDAC) kanser ilişkili ölümler arasında üst sıralarda yer alır. Hastaların genellikle ileri evrede tanı alması ve güncel tedavi yöntemlerinin sınırlı kalması nedeniyle PDAC vakalarında sağkalım oranı oldukça düşüktür ve çok sık şekilde kemoterapi direnci de gelişmektedir. Bunun sebeplerinden biri, standart tedavi ajanlarının (gemsitabin gibi) uygulamalarının hastalarda kısmı yanıt oluşturmasıdır. Bu nedenle, PDAC'da kemoterapi etkinliğini değerlendirmeye yönelik yeni biyobelirteçlerin tanımlanması oldukça önemli hale gelmiştir. Bu tez çalışmasında, gemsitabin (GEM) uygulanan PANC-1 hücre soyunda SRSF1 ile ULBP1 gen ekpresyon düzeylerinde meydana gelen değişimler incelenmiştir. Çalışma GEM-, GEM+ ve CD24⁺/CD44⁺ hücre alt popülasyonlarında gerçekleştirilerek analizler için qRT-PCR yöntemi kullanılmıştır. Çalışma sonuçları değerlendirildiğinde GEM+ uygulanan hücre grubunda SRSF1 gen ekspresyon düzeyinde ortalama 12 kat artış gözlenmiştir. Fakat bu artış istatistiksel açıdan anlamlı bulunmamıştır (p=0,10). Bireysel örnekler arasındaki geniş varyasyon, SRSF1 gen ekspresyonunun hücresel düzeydeki farklı mekanizmalara bağlı olarak değişkenlik gösterebileceğini düşündürmektedir. ULBP1 gen ekspresyonunda ise yaklaşık 6 kat artış belirlenmiştir. Ancak bu değişim de istatistiksel olarak anlamlı bulunmamıştır (p=0,20). Benzer şekilde her iki gen içinde CD24⁺/CD44⁺ hücre alt popülasyonlarında heterojen dağılım gözlenmiştir. Sonuç olarak, çalışmadan elde edilen bulgular her iki gen içinde istatistiksel olarak anlamlı olmamasına rağmen SRSF1 ve ULBP1 genlerinin PDAC için biyolojik olarak potansiyel biyobelirteç olabileceği düşünülmektedir. Bu genlerin ilaç direnci, immün yanıt ve tümör gelişimi ile ilişkilerinin daha iyi anlaşılabilmesi için geniş örneklem sayıları ve farklı deneysel koşullar ile yapılacak araştırmalar gerekmektedir.
Özet (Çeviri)
Gökgöz A. Bı̇ omarker Analysis Following Chemotherapeutic Agent Exposure in Pancreatic Adenocarcinoma Cells Characterized by CD24/CD44 Typing. Istanbul University, Institute of Health Sciences, Department of Genetics. Doctoral Thesis Istanbul,2025. Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) ranks among the leading causes of cancer-related deaths. Due to the fact that most patients are diagnosed at an advanced stage and current treatment methods remain limited, the survival rate in PDAC is significantly low. Chemoresistance is frequently observed in PDAC cases. One of the underlying reasons is that gemcitabine (GEM), a standard chemotherapeutic agent, often elicits only a partial response in patients. Therefore, identifying novel biomarkers to evaluate chemotherapy effectiveness in PDAC has become increasingly important. In this thesis study, the changes in expression levels of the SRSF1 and ULBP1 genes were examined in the PANC-1 cell line following gemcitabine (GEM) exposure. The study was conducted across GEM-, GEM+, and CD24⁺/CD44⁺ subpopulations, and all gene-expression analyses were performed using one-step qRT-PCR. According to the results, an average 12-fold increase in SRSF1 gene expression was observed in the GEM+ cell group. However, this increase was not found to be statistically significant (p = 0.10). The broad variation among individual samples suggests that SRSF1 expression may vary depending on different intracellular mechanisms. For ULBP1 gene expression, approximately a 6-fold increase was identified, but this change was also not statistically significant (p = 0.20). Similarly, a heterogeneous distribution was observed in both genes within the CD24⁺/CD44⁺ subpopulations. In conclusion, although the findings were not statistically significant for either genes, the results suggest that SRSF1 and ULBP1 may be biologically relevant potential biomarkers for PDAC. Further studies involving larger sample sizes and various experimental conditions are required to better understand the roles of these genes in drug resistance, immune response, and tumor development.
Benzer Tezler
- ALDH pozitif CD44 pozitif CD24 negatif MCF-7 meme kanseri hücrelerinin proliferasyonunda rol oynayan genlerin siRNA ile susturulması
Sirna silencing of the genes playing role in the proliferation of ALDH positive CD44 positive CD24 negative MCF-7 breast cancer cells
GAMZE ÖNECEK
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
BiyoteknolojiSelçuk ÜniversitesiNanoteknoloji ve İleri Malzemeler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAMDİ ŞÜKÜR KILIÇ
- Meme kanseri olgularında CD44+/CD24- kanser kök hücre dağılımı ve prognostik faktörler ile ilişkisi
The percantage of CD44+/CD24- breast cancer stem cell in breast cancer and correlation between the prognostic factors and the percantage
EYLEM YETİMOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
OnkolojiKocaeli Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KAZIM UYGUN
- Epitelyal over kanserlerinde cd24 ve cd44'ün immunohistokimyasal olarak karşılaştırılması ve prognostik değeri
Immunohistochemical comparison of cd-24 and cd-44 in epithelial ovarian cancer and prognostic values
NAHİT ATA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
OnkolojiSağlık BakanlığıKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUZAFFER SANCI
DOÇ. DR. VİSSUN SEVİNÇ İNAN
- Meme infiltratif duktal karsinomlarında CD24, CD44, galektin-1 ekspresyonlarının tümör diferansiasyonu ve lenf nodu metastaz potansiyeli ile ilişkisi
Correlation of cd24, cd44, galectin-1 expressions with tumor differentiation and lymph node metastasis potential in infiltrating ductal carcinoma of the breast
SACİDE ÇOLAK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
PatolojiZonguldak Karaelmas ÜniversitesiPatoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞÜKRÜ OĞUZ ÖZDAMAR
- Meme kanseri subtiplerinde tümör kök hücre belirteçlerinden cd44, CD24 ve ALDH1'in ekspresyon durumunun belirlenmesi ve prognostik faktörler ile ilişkisinin immünhistokimyasal yöntemle araştırılması
tumor stem cells in breast cancer subtypes signs of CD44 , CD24 and the ALDH1 and determination of expression conditions prognostic factors of relationship investigation by immunohistochemistry
EMRE KARAKÖK