Feline coronavirusun (FCoV) moleküler tekniklerle karşılaştırmalı analizi
Comparative analysis of feline coronavirus (FCoV) by molecular techniques
- Tez No: 969313
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ SİBEL HASIRCIOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Tanı kitleri, Diagnostic kits
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Burdur Mehmet Akif Ersoy Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Veterinerlik Viroloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Veterinerlik Virolojisi Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Feline coronavirus (FCoV) enfeksiyonu, kedilerde Feline Enfeksiyöz Peritonit (FIP) gibi ölümcül bir hastalığa yol açabilmesi nedeniyle kedi sağlığını tehdit eden önemli bir viral hastalıktır. Bu çalışmada, FIP şüpheli kedilerde FCoV'un tespiti için, özgün olarak tasarlanan bir Ters Transkriptaz Döngü Aracılı İzotermal Amplifikasyon (RT-LAMP) yönteminin tanısal performansının, standart bir nested PCR (nPCR) yöntemiyle karşılaştırmalı olarak değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla, FIP şüpheli 50 adet kediden alınan asites sıvısı (n=25), kan (n=17) ve rektal sürüntü (n=8) örnekleri kullanıldı. Tüm örnekler, referans yöntem olarak kabul edilen nested PCR (nPCR) ve çalışmamızda FCoV S2 gen bölgesini hedef alacak şekilde geliştirilen florimetrik ve kolorimetrik RT-LAMP yöntemleri ile FCoV RNA varlığı yönünden analiz edildi. Analiz edilen 50 örneğin 15'i (%30) nPCR ile pozitif olarak saptanırken, geliştirilen RT-LAMP yöntemiyle 23'ü (%46) pozitif olarak bulundu. RT-LAMP testinin, nPCR ile pozitif bulunan tüm örnekleri tespit etmesinin yanı sıra, nPCR ile negatif bulunan 8 örnekte daha pozitif sonuç verdiği gözlemlendi. Her iki testte de en yüksek pozitiflik oranı asites sıvısı örneklerinde saptandı. Ayrıca, kolorimetrik ve florimetrik RT-LAMP sonuçları arasında tam bir uyum (%100) olduğu gözlemlendi. Bu araştırma sonucunda, geliştirilen RT-LAMP yönteminin, FIP şüpheli örneklerde FCoV RNA'sının saptanmasında standart nPCR yöntemine göre daha yüksek bir saptama oranına sahip olduğu ortaya konulmuştur. Ayrıca, kolorimetrik LAMP'ın pratikliği ve güvenilirliği, bu testin özellikle klinik koşullarda hızlı tanı için önemli bir potansiyel taşıdığını göstermiştir.
Özet (Çeviri)
Feline coronavirus (FCoV) infection is an important viral problem threatening feline health as it can lead to the fatal disease Feline Infectious Peritonitis (FIP). In this study, we aimed to evaluate the diagnostic performance of a uniquely designed Reverse Transcriptase Loop-mediated Isothermal Amplification (RT-LAMP) method for the detection of FCoV in cats with suspected FIP in comparison with a standard nested PCR (nPCR) method. For this purpose, ascites fluid (n=25), blood (n=17) and rectal swab (n=8) samples from 50 cats with suspected FIP were used. All samples were analyzed for the presence of FCoV RNA by nested PCR (nPCR), which is accepted as the reference method, and fluorimetric and colorimetric RT-LAMP methods developed to target the FCoV S2 gene region in our study. Of the 50 samples analyzed, 15 (30%) were positive by nPCR, while 23 (46%) were positive by the RT-LAMP method. In addition to detecting all samples found positive by nPCR, the RT-LAMP test gave positive results in 8 more samples found negative by nPCR. The highest positivity rate in both tests was found in ascites fluid samples. Furthermore, there was complete agreement (100%) between colorimetric and fluorimetric RT-LAMP results. As a result of this study, it was demonstrated that the developed RT-LAMP method has a higher detection rate than the standard nPCR method in detecting FCoV RNA in FIP suspected samples. Furthermore, the practicality and reliability of colorimetric LAMP demonstrated that this assay has significant potential for rapid diagnosis, especially in clinical settings.
Benzer Tezler
- Türkiye'de evcil kedilerde feline coronavirus enfeksiyonlarının epidemiyolojisi ve moleküler karakterizasyonu
Feline coronavirus epidemiology and molecular characterization among domestic cats in Turkey
HÜMAY AKIN İLERİ
- Balıkesir ve İzmir illerindeki kedilerin retrovirus (Feline immunodeficiency virus (FIV), feline leukaemia virus (FeLV) ve coronavirus (feline corona virus (FCOV) enfeksiyonlarının prevalanslarının belirlenmesi
Determination of prevalence of retrovirus (feline immunodeficiency virus (FIV), feline leukaemia virus (FeLV) and coronavirus (feline corona virus (FCOV) infections in Balikesir and Izmir provinces
NAZLI AKDENİZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Veteriner HekimliğiBalıkesir ÜniversitesiVeterinerlik İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ERSOY BAYDAR
- Feline enfeksiyöz peritonitisli kedilerde midkine düzeylerinin değerlendirilmesi
Evaluation of midkine levels in cats with feline infectious peritonitis
BUĞRA ÇAĞRI SANLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Veteriner HekimliğiKırıkkale Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ YASİN PARLATIR
- Feline infeksiyöz peritonitisli kedilerde böbrek hasarının araştırılması
Investigations of kidney damage in cats with feline infectious peritonitis
GÜNNUR ÇELEBİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Veteriner HekimliğiBurdur Mehmet Akif Ersoy ÜniversitesiVeterinerlik İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALİL İBRAHİM GÖKCE
- Kedilerde feline coronavirus (FCOV) enfeksiyonu'nun kalsiyum metabolizması ve adenozin deaminaz (ADA) enzimi üzerine etkisi
The effect of feline coronavirus (FCOV) infection of cats on calcium metabolism and adenosine deaminase (ADA) enzyme
HASAN BARIŞ CENGİZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Veteriner HekimliğiBurdur Mehmet Akif Ersoy ÜniversitesiVeterinerlik İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALİL İBRAHİM GÖKCE