Geri Dön

miRNA expression analysis in breast cancer

Meme kanserinde miRNA ekspresyon analizi

PDF İndir

  1. Tez No: 877456
  2. Yazar: BODOUR ALASSIL
  3. Danışmanlar: PROF. DR. FİLİZ ÖZBAŞ GERÇEKER
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Meme kanserinde mikroRNA'ların (miRNA) rolüne dikkat çeken bu çalışma, özellikle miR-551a, miR-1238, miR-4534, ve miR-1294'ün rollerini araştırmıştır. 41 hastadan alınan 82 örnek (41 tümör ve 41 normal doku) üzerinde gerçek zamanlı PCR ile miRNA ifade seviyeleri değerlendirilmiş ve miRDB, TargetScan araçlar ile topGO ve EnrichR veritabanları kullanılarak hedef genler ve yolları belirlenmiştir. Elde edilen sonuçlar, miR-1294 ve miR-551a'nın tümör dokularında normal dokulara kıyasla anlamlı derecede düşük olduğunu (p<0.05), miR-4534'ün ise tümör dokularda normal dokulara göre aşırı ifade edildiğini göstermiştir (p<0.05). MiR-1238 seviyelerinde tümör ve normal dokular arasında anlamlı bir fark bulunmadığı için sonraki analizlerden çıkarılmıştır. miR-1294 tümör baskılayıcı olarak Hippo ve p53 sinyal yollarında yer alan BRCC3, MYCL, YOD1 genlerini hedeflemekte, miR-551a da tümör baskılayıcı olarak sfingolipid metabolizması, Notch, MAPK, ve ErbB sinyal yolarında etkili olan ERbB4, MEF2C, CRB2, TMPRSS2 gibi genleri hedeflemektedir. Buna karşılık, miR-4534'ün onkojenik işlev gösterdiği ve iyon taşınımı, glutamaterjik ve kolinergik sinaps sinyal yollarında yer alan SOX6, ADCY1, ESRRG, ZNF142 gibi genleri hedeflediği düşünülmektedir. Sonuç olarak, miR-551a ve miR-1294'ün tümör baskılayıcı fonksiyonlarıyla terapötik uygulamalar için uygun olduğu, miR-4534'ün ise meme kanseri ilerlemesinde onkojenik bir rol oynayarak tanı biyomarkerı olarak daha fazla incelenmeye değer olduğu ortaya çıkmıştır

Özet (Çeviri)

The role of microRNAs (miRNAs) in breast cancer has gained significant attention. This study explores the role of specific miRNAs (miR-551a, miR-1238, miR-4534, miR-1294) in breast cancer, evaluating their expression levels in 82 samples from 41 patients (41 tumor and 41 normal tissues) using real-time PCR and identifying their target genes and pathways through bioinformatics, using tools like miRDB and TargetScan, and databases like topGO and EnrichR. Results showed that miR-1294 and miR-551a were lower in tumor tissues than in normal (p<0.05), while miR-4534 was overexpressed in tumors (p<0.05). No significant difference was observed in miR-1238 levels, excluding it from further analysis. MiR-1294, acting as a tumor suppressor, potentially targets BRCC3, MYCL, YOD1 genes in Hippo and p53 signaling pathways. MiR-551a, also a tumor suppressor, targets ERbB4, MEF2C, CRB2, TMPRSS2 in pathways like sphingolipid metabolism, Notch, MAPK, and ErbB signaling. Conversely, miR-4534, with oncogenic function, targets SOX6, ADCY1, ESRRG, ZNF142 in ion transport, and glutamatergic and cholinergic synapse signaling. In conclusion, miR-551a and miR-1294 are potential tumor suppressors suitable for therapeutic applications, while miR-4534, an oncogene in breast cancer, merits further study as a diagnostic biomarker.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    911487

    Meme kanserinde hsa_circ_0001546 ve hsa_circ_0025244'ün ekspresyon analizi ve circrna/mirna/gen aksislerinin in silico yöntemler ile araştırılması

    Expression analysis of hsa_circ_0001546 and hsa_circ_0025244 in breast cancer and investigation of circrna/mirna/gene axes via in silico methods

    FAHRÜNNİSA ABANOZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. ŞÜKRÜ ÖZTÜRK

    DOÇ. DR. İLKNUR SUER

  2. Tez No

    540785

    Meme kanseri yeni nesil dizileme verilerinde gen ifadesi ile mikroRNA ifadesi arasındaki karşılıklı etkileşimin analizi

    Analysis of interplay between gene expression and miRNA expression in breast cancer next generation sequencing data

    SELCEN ARI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyolojiYıldız Teknik Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ALPER YILMAZ

  3. Tez No

    416559

    Characterization of molecular-level changes due to MicroRNA-125b expression in breast cancer cells by spectroscopic and chemometric analysis techniques

    Meme kanseri hücrelerinde MikroRNA-125b ifadesinin moleküler düzeyde neden olduğu değişimlerin spektroskopik ve kemometrik analiz teknikleri ile karakterizasyonu

    NİHAL ŞİMŞEK ÖZEK

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FERİDE SEVERCAN

    DOÇ. DR. AYŞE ELİF ERSON BENSAN

  4. Tez No

    1000483

    Üçlü negatif meme kanserinde axl hedeflenmesi: Amuvatinib'in etkileri ve miRNA-3142 ile miRNA-5687 ifadelenmesi

    AXL targeting in triple-negative breast cancer: Effects of Amuvatinib and expression of miRNA-3142 and miRNA-5687

    EREN SON

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    Eczacılık ve FarmakolojiEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Tıbbi Farmakoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMRA YİĞİTASLAN

  5. Tez No

    587888

    Identification and investigation of metastasis specific miRNAs in breast cancer cells for miRNA replacement therapy

    Meme kanser hücrelerınde miRNA replasman tedavisinde kullanılabilecek metastaik spesifik miRNA'ların belirlenmesi ve araştırılması

    EMİLİA EKENEL

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    GenetikEskişehir Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EMEL ERGENE

    DOÇ. DR. YEŞİM AYDIN SON

Geri Dön