Identification and investigation of metastasis specific miRNAs in breast cancer cells for miRNA replacement therapy
Meme kanser hücrelerınde miRNA replasman tedavisinde kullanılabilecek metastaik spesifik miRNA'ların belirlenmesi ve araştırılması
- Tez No: 587888
- Danışmanlar: DOÇ. DR. EMEL ERGENE, DOÇ. DR. YEŞİM AYDIN SON
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Biyoloji, Tıbbi Biyoloji, Genetics, Biology, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: miRNA Mimik, Meme Kanseri, miRNA Transfeksiyonu, Western-Blot, miRNA Replasman Tedavi, Meta-Analiz, Metastaz, miRNA Mimic, Breast Cancer, miRNA Transfection, Western-Blot, miRNA Replacement Therapy, Meta-Analysis, Metastasis
- Yıl: 2019
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Eskişehir Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Son yıllardaki çalışmalar, miRNA'nın kanser ve metastatic süreçleri düzenleyebildiğini göstermiştir. Bu çalışmanın amacı, miRNA bazlı meme kanseri tedavisinde, terapötik hedef olarak kullanılabilecek özgül metastaz baskılayıcı miRNA'ların meta-analiz yöntemi ile belirlenmiştır. Ve bu Tespit edilen üç adet özgül miRNA'ların in-vitro miRNA replasman tedavi yöntemi ile, onların terapötik potansiyelleri sunulmuştur.“Hsa-miR-145-5p”,“hsa-miR-143-3p”ve“hsa-miR-99A-5p”mimikleri, MDA-MB-231 hücrelerine transfekt edildi, bu transfeksiyon etkisinin fonksiyonel analizi için, in vitro hücre göçü deneyi uygulanmıştır. Tek bir miRNA farklı sinyal yollarında işe karışan çok sayıda genin ifadesini düzenleyebildiğinden, transfekt edilen özgül miRNA'ların metastaz yolağın üzerinde etkisi ve diğer sinyal yolaklarındaki genlerin ifadelereindeki değişimi, mikrodizi yöntemi ile araştırılmıştır. Western blot, zimogram, ve mikrodizi sonuclarındaki, seçilen bazı gen ifadelerindeki değişimi, protein düzeyinde doğrulanmıştır. Sonuçlarımız, tespit edilen üç metastatik baskılayıcı miRNA'nın her birinin, tümörgenezdeki farklı biyolojik yolları etkilediğini ortaya koymaktadır. Ayrıca, meme kanserinde“hsa-miR-145-5p”,“hsa-miR-143-3p”ve“hsa-miR-99A-5p'nin”terapötik potansiyelleri gözlenmiştir ve tümör baskılayıcı işlevleri göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Recent studies have shown that miRNAs can regulate cancer and metastatic processes. The aim of this study was to identify specific metastasis suppressor miRNA through meta-analysis method, which can be used as a therapeutic target in miRNA-based breast cancer therapy to prevent or delay breast cancer metastasis. This study presented the therapeutic ability of the three identified metastasis suppressor miRNAs through in-vitro miRNA replacement therapy. The mimics of“hsa-miR-145-5p”,“hsa-miR-143-3p”, and“hsa-miR-99A-5p”were transfected into“MDA-MB-231”cell lines. In-vitro cell migration assay was completed for functional analysis of the effect of the replacement therapy. Additionally, since a single miRNA can regulate many genes involved in different signaling pathways, we analyzed the effect of the transfected miRNAs at the transcription level through microarray analysis. Differential expression of selected genes was validated at the protein level by western blot and zymogram. Our results suggest that each of the three metastatic suppressor miRNAs is affecting different biological pathways in tumorigenesis. Also, the therapeutic potentials of“hsa-miR-145-5p”,“hsa-miR-143-3p”, and“hsa-miR-99a-5p”in breast cancer are observed, showing the tumor-suppressive functionalities.
Benzer Tezler
- Investigation of medulloblastoma metabolism by tissue-specific genome-scale brain metabolic model and identification of therapeutic targets
Dokuya özgü genom ölçekli beyin metabolik modeli ile medulloblastom metabolizmasının incelenmesi ve terapötik hedeflerin belirlenmesi
İLKAY İREM ÖZBEK
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Kimya MühendisliğiBoğaziçi ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞEFİKA KUTLU ÜLGEN
- Investigation of NFİB function and regulation of its putative target genes in human neural stem cell and SH-SY5Y neuroblastoma cell lines
İnsan sinir kök hücre ve SH-SY5Y nöroblastom hücre hatlarında NFIB işlevinin ve potansiyel hedef genlerinin regülasyonunun incelenmesi
BETÜL ULUCA
Doktora
İngilizce
2023
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DR. ÖĞR. ÜYESİ ASLI KUMBASAR
- Identification and investigation of cell types and cell-to-cell communication in non-small cell lung cancer
Küçük hücre dışı akciğer kanserinde hücre tiplerinin ve hücre-hücre etkileşimlerinin belirlenmesi ve araştırılması
CEMAL YILDIZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
BiyomühendislikGebze Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ PINAR PİR
- Identification of novel Notch target genes that are mediators of Notch in inducing epithelial-mesenchymal transition and migration/invasion
Notch yolağının epitelyal-mezenkimal geçişte ve migrasyon/invazyon tetiklemede aracı olarak kullanıldığı yeni hedef genlerinin tanımlanması
CANSU KÜÇÜKKÖSE
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Genetikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ÖZDEN YALÇIN ÖZUYSAL
- İnvasiv duktal meme karsinoması ile ilişkili yanlış anlamlı mutasyonların olası yapısal ve fonksiyonel etkilerinin in silico tahmini ve değerlendirilmesi
In silico prediction and identification of possible structural and functional effects of i̇nvasive ductal breast carcinoma related missense mutations
MELDA ARSLANTAŞ GÜZEL
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyolojiHacettepe ÜniversitesiBiyoenformatik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ CEREN SUCULARLI