Geri Dön

Mass spectrometric identification and quantification of the glial brain tumor metabolome

Glial beyin tümör metabolomunun kütle spektrometri yöntemi kullanılarak tanımlanması ve ölçümü

PDF İndir

  1. Tez No: 856284
  2. Yazar: CANSU AKIN LEVİ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ÖZGE CAN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyokimya, Biyoteknoloji, Biochemistry, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Medikal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

İzositrat dehidrojenaz (IDH) mutasyonu, gliomanın prognozunu öngörmede önemli bir faktördür. Mutant IDH'li gliomalar, beyin dokusundaki 2-hidroksiglutarat (2HG) ve glutamin (Gln) gibi bazı metabolitlerin seviyelerinin değişmesine yol açar. Sıvı kromatografi-kütle spektrometrisi (LC-MS/MS) mutlak metabolit konsantrasyonlarını belirlemek için hassas bir in vitro tekniktir, bununla birlikte proton MR spektroskopisi (1H-MRS) bu metabolitlerin in vivo tespitine izin verir. Bu çalışma, gliomalardaki metabolik konsantrasyonlar arasındaki ilişkinin 1HMRS ve LC-MS/MS analizlerine dayalı olarak tanımlanmasını ayrıca IDH mutasyonlarını tanımlamayı amaçlar. Hasta kohortuna 178 adet glioma hastası (111 E/67 K,100 IDH-mut, 78 IDH-wt) dahil edilmiştir. Ameliyattan önce hastalar, 3T MR tarayıcı kullanılarak görüntülenmiştir. 1H-MRS, nokta çözümlemeli spektroskopi (PRESS) sekansı (TR/TE=2000/30ms) kullanılarak görüntüler elde edilmiş, on dokuz metabolitin miktarı LC Model yazılımı kullanılarak ölçülmüştür. Aynı hastalardan alınan biyopsi örneklerinde, kreatin (Cr), kolin (Cho), glutamat (Glu), gama-aminobütirik asit (GABA), N-asetil aspartat (NAA), miyo-inositol (mIns), Gln, 2HG ve laktat (Lac) gibi metabolitlerin mutlak konsantrasyonlarını belirlemek için LC-MS/MS analizleri yapılmıştır. LC-MS/MS ve 1H-MRS ile belirlenen metabolit konsantrasyonları arasındaki ilişki Spearman korelasyon katsayıları belirlenerek hesaplanmıştır. Sonuç olarak, LC-MS/MS analizinde IDH-mut gliomalarda GABA, Cr, 2HG, M-Ins ve NAA metabolitleri IDH-wt'a göre anlamlı derecede yüksek bulunmuştur. Ayrıca 2HG (p=0,036), Cr (p=0,009), mIns (p<0,001), Lac (p=0,007) ve NAA (p=0,004) için istatistiksel olarak anlamlı ilişkiler göstermiştir. Sonuç olarak, 1H-MRS ve LC-MS/MS ile ölçülen metabolik yoğunluklar arasında güçlü bir korelasyon vardır ve bu yöntemler gliomalarda IDH mutasyonlarının tespitinde etkilidir.

Özet (Çeviri)

The mutation in isocitrate dehydrogenase (IDH) is an important factor in the prognosis of glioma. Gliomas with mutant IDH lead to altered levels of certain metabolites in the brain, such as 2-hydroxyglutarate (2HG) and glutamine (Gln). Liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) is a sensitive in vitro technique to determine absolute metabolite concentrations, while proton MR spectroscopy (1H-MRS) allows for the in vivo detection of these metabolites. This thesis aims to investigate the relationship between metabolic concentrations in gliomas. We determined these concentrations by employing 1H-MRS and LC-MS/MS to relate IDH. A total of 178 glioma patients were included in the patient cohort (111M/67F, 100 IDH-mut, 78 IDH-wt). Before surgery, these patients were scanned using a 3T MR scanner. 1H-MRS was acquired using a point-resolved spectroscopy (PRESS) sequence (TR/TE=2000/30ms), the quantification of nineteen metabolites was measured using LC model software. The biopsy specimens from the same patients were analyzed with LC-MS/MS to determine the quantities of creatine (Cr), choline (Cho), glutamate (Glu), gamma-aminobutyric acid (GABA), N-acetyl aspartate (NAA), myoinositol (mIns), Gln, 2HG, and lactate (Lac). The Spearman correlation coefficients were calculated between the metabolite concentrations from 1H-MRS and LC-MS/MS. Overall, the levels of GABA, Cr, 2HG, M-Ins, and NAA in IDH-mut gliomas were recorded to be higher than the ones in IDH-wt gliomas. Furthermore, 2HG (p=0.036), Cr (p=0.009), M-Ins (p<0.001), Lac (p=0.007), and NAA (p=0.004) showed statistically significant relationships. To sum up, there was a strong correlation between the metabolic intensities measured by 1H-MRS and LC-MS/MS, and these methods are efficient in detecting IDH mutations in gliomas.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    989798

    HPGe dedektörlü gama spektrometrik analiz ile çimento malzemelerinde doğal radyoaktivitenin belirlenmesi ve öz soğurma düzeltmesinin uygulanması

    Determination of natural radioactivity in cement materials by HPGe gamma-ray spectrometry with self attenuation correction

    BURAK ORUÇ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    Nükleer Mühendislikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Nükleer Araştırmalar Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYŞE NUR ESEN

  2. Tez No

    925976

    SWATH-MS Based Phophoproteomics

    SWATH-MS Tabanlı Fosfoproteomik Çalışmaları

    UMUT TOPRAK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2012

    BiyokimyaEıdgenossısche Technısche Hochschule Zurıch (eth)

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. RUEDİ AEBERSOLD

    PROF. DR. PAOLA PİCOTTİ

  3. Tez No

    836784

    Development of a method for the extraction of microplastics for their identification and quantification in soil

    Mikroplastiklerin toprakta tanımlanması ve miktarının belirlenmesi için çıkarılmasına yönelik bir yöntemin geliştirilmesi

    İREM ORUÇ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Jeoloji MühendisliğiMuğla Sıtkı Koçman Üniversitesi

    Jeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BEDRİ KURTULUŞ

    DR. LAURENT LEMEE

  4. Tez No

    326332

    Fentanil ve metaboliti norfentanilin idrardan sıvı kromatografi - tandem kütle spektrometresi(LC-MS/MS) sistemi ile yan yana tayini

    Simultaneous identification and quantitation of fentanyl and its metabolite norfentanyl in urine by liquid chromatography and tandem mass spectrometry

    FATMA ÇAVUŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Adli Tıpİstanbul Üniversitesi

    Fen Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MÜNEVVER AÇIKKOL

  5. Tez No

    447121

    Design and synthesis of boron-dipyrromethene (BODIPY) based fluorescent and colorimetric sensors for the detection of gold and mercury ions

    Altın ve cıva iyonlarının tayini için bor-dipirometen (BODIPY) bazlı floresan ve kolorimetrik sensörlerin tasarımı ve sentezi

    MUHAMMED ÜÇÜNCÜ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    Kimyaİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Kimya Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUSTAFA EMRULLAHOĞLU

Geri Dön