Geri Dön

İnsan mutant aquaporın-2 (AQP2) proteinlerinin moleküler dinamik simülasyonları ile incelenmesi

Investigation of the human mutant aquaporin-2 (AQP2) proteins with molecular dynamics simulation

PDF İndir

  1. Tez No: 840958
  2. Yazar: EMİNE DENİZ TEKİN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. HATİCE MERGEN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Aquaporin-2 böbrek toplama kanalındaki hücrelerin apikal membranında yer alan, suyun geri emilimini ve idrar konsantrasyonunu düzenlemek için vazopressin tarafından aktive edilen bir kanal proteinidir. Aquaporin-2 proteini üzerindeki mutasyonlar, proteinin yapısını ve fonksiyonunu bozarak böbreklerde suyun geri emilimini etkileyebilir; bu da aşırı idrara çıkma ile karakterize“Nefrojenik Diabetes İnsipidus”isimli nadir böbrek hastalığına yol açabilir. Bu çalışmanın amacı,“Nefrojenik Diabetes İnsipidus”tanısı konmuş hastaların Aquaporin-2 geninde tanımlanmış ve fonksiyon analizleri yapılmış A45T, R85X ve A147T mutasyonlarının modellenerek, moleküler dinamik simülasyonlarının yapılması ve sonuçların deneysel veriler ve diğer simülasyon sonuçları ile karşılaştırılmasıdır. Yapılan moleküler dinamik simülasyonları yardımıyla, suyun hücre membranından geçişi moleküler düzeyde gösterilerek, yabanıl tip Aquaporin-2 ve mutantlarının kanal yapısı incelenmiştir. Sonuç olarak tez kapsamında modellenen mutant proteinlerin yabanıl tip Aquaporin-2'ye göre farklı oranlarda su moleküllerini geçirdiği, dolayısıyla farklı oranlarda fonksiyon değişiklikleri gösterdikleri bulunmuştur. Tez çalışmasından elde edilen bütün sonuçların su dengesi ile ilgili hastalıkların anlaşılarak, ilgili tedavi-ilaç yöntemlerinin bulunmasına katkı sağlayacağı düşünülmektedir.

Özet (Çeviri)

Aquaporin-2 is a channel protein located in the apical membrane of cells in the renal collecting duct, activated by vasopressin to regulate water reabsorption and urine concentration. Mutations on the Aquaporin-2 protein may affect the reabsorption of water in the kidneys disrupting the structure and function of the protein; leading to a rare kidney disease characterized by excessive urination known as Nephrogenic Diabetes Insipidus. This study aims to model and perform molecular dynamics simulations of the A45T, R85X, and A147T mutations identified and functionally analyzed in the Aquaporin-2 gene of patients diagnosed with Nephrogenic Diabetes Insipidus and to compare the results with experimental and other simulation results. Through the use of molecular dynamics simulations, the passage of water through the cell membrane has been demonstrated at the molecular level, and the channel structure of wild-type Aquaporin-2 and its mutants has been investigated. As a result, it has been observed that the modeled mutant proteins within the scope of the thesis allow the passage of water molecules at different rates compared to wild-type Aquaporin-2, and thus show varying degrees of functional changes. It is believed that all the results obtained from the thesis study will contribute to understanding the diseases related to water balance and the development of relevant treatment-drug methods.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    451098

    BRAF ve CDKN2A mutant insan A375 melanom hücre hattında Vemurafenib ve Palbosiklib kombinasyonunun sitotoksisite ve apoptozis üzerine etkisi

    The cytotoxic and apoptotic effects of Palbocyclib-Vemurafenib combination in BRAF and CDKN2A mutant human A375 melanoma cells

    AYŞENUR ARSLAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    OnkolojiEge Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ŞAZİYE BURÇAK KARACA

  2. Tez No

    178030

    İnsan karbonik anhidraz I (HCA I)geninin klonlanması, E.coli'de ekspresyonu ve Phe91Asn yönlendirilmiş mutageneziyle elde edilen mutant enzimin inhibitörlere karşı ilgisinin araştırılması

    Cloning and expression of human carbonic anhydrase I(HCA I)gene in E.coli and investigation of affinity of the mutant enzyme to the inhibitors which is obtained site directed mutagenesis of Phe91Asn

    MELTEM AYDIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    BiyolojiBalıkesir Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. FERAY KÖÇKAR

    PROF.DR. OKTAY ARSLAN

  3. Tez No

    470911

    İnsan karbonik anhidraz ıı enziminin (hCA II) klonlanması, E. coli'de ekspresyonu, karakterizasyonu, yönlendirilmiş mutagenez ile mutant hCA II genlerinin eldesi ve mutant proteinlerin inhibitörlere karşı ilgisinin araştırılması

    Cloning, expression in E. coli, characterization of human carbonic anhydrase ii (hCA II) enzyme, production of mutant hCA II genes by site directed mutagenesis and investigation of affinity of mutant proteins to inhibitors

    DERYANUR KILIÇ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    KimyaAtatürk Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÖMER İRFAN KÜFREVİOĞLU

  4. Tez No

    233776

    Insan b2-adrenerjık reseptöründe oluşturulan bazı mutasyonların reseptör-yeşil floresan protein füzyonu ile hücre içi dağılımının incelenmesi

    Visualing intracellular distribution of wild type and mutant b2-afrenergic receptor by means of green flourescent protein fusion

    OLGA ALTUNTAŞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    PROF.DR. HASAN ONGUN ONARAN

  5. Tez No

    543141

    Development of mutant human immunoreactive trypsinogen (IRT) for use in immunoassays

    İmmün test çalışmalarda kullanmak için mutant insan immünreaktif tripsinojen (IRT) geliştirilmesi

    MUSTAFA DİVYAPICIGİL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    GenetikGebze Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TAMER YAĞCI

    DR. ESİN AKÇAEL

Geri Dön