Sağ ve sol kolon tümörlerinde GALNT5 ve ZDHHC9 genlerinin ifade düzeylerinin araştırılması
Investigation of the expression levels of GALNT5 and ZDHHC9 genes in right and left colon tumors
- Tez No: 820579
- Danışmanlar: PROF. DR. ETEM AKBAŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Adenokarsinom, Gen ifadesi, Genler, Kolon hastalıkları, Kolon neoplazmları, Kolorektal neoplazmlar, Neoplazmlar, Adenocarcinoma, Gene expression, Genes, Colonic diseases, Colonic neoplasms, Colorectal neoplasms, Neoplasms
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Mersin Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kolorektal kanserler her iki cinsiyette görülme sıklığı bakımından üçüncü sırada yer almaktadır. Kolon kanserinde ilkin tümörün sağ ya da sol kolonda bulunmasına göre klinik, patolojik ve genetik farklılıklar meydana gelmektedir. Bu durum hastalığın seyrini ve uygulanacak olan tedavi yöntemini değiştirebilmektedir. Yaptığımız çalışmada sağ ve sol kolon yerleşimli tümöral dokularda ZDHHC9 ve GALNT5 genlerinin ekspresyonlarını inceledik. Örneklemimiz; Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi Patoloji Anabilim dalında 42'si sağ kolon, 47'si sol kolon olmak üzere 89 tümörlü doku örneği ve aynı bireylerin tümörlü dokuya komşu sağlıklı doku örneğinden oluşmuştur. Çalışmamız; kolorektal kanserin en yaygın türü olan adenokarsinomlu dokulardan hazırlanmış parafin bloğa gömülü arşiv materyallerinde gerçekleştirildi. Doku örneklerinden önce RNA izolasyonu arkasından cDNA sentezi gerçekleştirildi. ZDHHC9 ve GALNT5 genlerinin ekspresyonu Real Time PCR'de karşılaştırmalı CT (ΔΔCT) yöntemiyle analiz edildi. Bulguların istatistiksel değerlendirmesi Wilcoxon T-testi, Student T-testi ve Mann-Whitney U-testi ile yapıldı. Kolorektal kanser erkeklerde kadınlara göre daha sık görülmektedir (p<0,05). Sağ ve sol kolon tümörleri genel olarak ve ayrı ayrı değerlendirildiğinde: ZDHHC9 ve GALNT5 genlerinin her ikisinin de ekspresyon seviyelerinde artış söz konusudur (p<0,001). Bu artış her iki cinsiyette de benzer oranlarda olup farklılık göstermemektedir. Her iki genin sağ ve sol kolon tümörlerindeki ekspresyonunu karşılaştırdığımızda ise sol kolon GALNT5 geni ekspresyonu sağ kolona göre daha yüksektir (p<0,048). ZDHHC9 ve GALNT5 genleri ekspresyonlarının hem sağ hem sol kolon tümörlerinde daha yüksek olması kolon kanserine yakalanmada biyobelirteç olabileceklerini göstermektedir. Sol kolon GALNT5 geni ekspresyonunun sağ kolona göre daha yüksek olması ise sol kolon kanserlerinin sağ kolon kanserlerinden daha sık rastlandığı gerçeğini açıklamada önemli bir belirteç olabilir. Mersin örneklemi temelinde gerçekleştirdiğimiz bu çalışma ZDHHC9 ve GALNT5 genlerinin kolorektal kanserli doku ve kontrol grubundaki ekspresyon değerlerine dair ülkemizdeki ilk çalışma olma özelliği taşımaktadır.
Özet (Çeviri)
Colorectal cancers are in the third place in terms of incidence in both genders. In colon cancer, clinical, pathological and genetic differences occur depending on whether the tumor is located in the right or left colon. This situation can change the course of the disease and the treatment method to be applied. In our study, we examined the expressions of ZDHHC9 and GALNT5 genes in tumoral tissues located in the right and left colon. Our sample; It consisted of 89 tumor tissue samples, 42 of which were right colon and 47 left colon, and healthy tissue samples of the same individuals adjacent to the tumor tissue in Mersin University Faculty of Medicine, Department of Pathology. Our work; performed on archival materials embedded in a paraffin block prepared from tissues with adenocarcinoma, the most common type of colorectal cancer. Before the RNA isolation from the tissue samples, cDNA synthesis was performed. Expression of ZDHHC9 and GALNT5 genes was analyzed in Real Time PCR by comparative CT (ΔΔCT) method. Statistical evaluation of the results was done with Wilcoxon T-test, Student's T-test and Mann-Whitney U test. Colorectal cancer is more common in males than females (p<0.05). In general, when evaluated separately as right and left colon tumors: There is an increase in the expression levels of both ZDHHC9 and GALNT5 genes (p<0.001). When we compared the expression of both genes in right and left colon tumors, GALNT5 gene expression in the left colon was found to be higher than in the right colon (p<0.048). The fact that the expression of ZDHHC9 and GALNT5 genes is higher in both right and left colon tumors indicates that they may be risk factors for developing colon cancer. The fact that the left colon GALNT5 gene expression is higher than the right colon can be an important indicator in explaining the fact that left colon cancers are more common than right colon cancers. This study, which we conducted on the basis of Mersin sample, is the first study in our country on the expression values of ZDHHC9 and GALNT5 genes in colorectal cancer tissue and control groups.
Benzer Tezler
- Sağ ve sol kolon tümörlerinde cmtm3 ve sstr2 genlerinin ifade düzeylerinin araştırılması
Investigation of cmtm3 and sstr2 expression levels in right-sided and left-sided colon tumors
TUĞÇE BİNEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Tıbbi BiyolojiMersin ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. ETEM AKBAŞ
- Acile başvuran tıkayıcı sol kolon kitlelerine yaklaşımda anastomoz ve stoma açılmasının karşılaştırılması
Comparison of anastomosis and stoma in the approach to emergency presenting obstacle left colon masses
BERKAN ÇOLAKOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Genel CerrahiSağlık Bilimleri ÜniversitesiGenel Cerrahi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HASAN BEKTAŞ
- Kolorektal kanserlere bağlı gelişen akut sol kolon obstrüksiyonlarının retrospektif analizi
Retrospective analysis of acute left colon obstructions due to colorectal cancers
RAMAZAN TOPCU
Tıpta Uzmanlık
Almanca
2011
Genel CerrahiSağlık Bilimleri ÜniversitesiGenel Cerrahi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HÜSEYİN BERKEM
- Kolon kanseri tanılı hastalarda F-18 FDG PET/BT'den elde edilen volümetrik parametrelerin tümör lateralizasyonu ve TNM evresi ile ilişkisi
The relationship of F-18 FDG PET/CT volumetric parametres with tumor lateralization and TNM stage in patients with colon cancer
SERHAT AKTAŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Radyoloji ve Nükleer TıpManisa Celal Bayar ÜniversitesiNükleer Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FİKRİYE GÜL GÜMÜŞER
- Kolon kanserlerinde tümör depoziti varlığının onkolojik sonuçlar üzerine etkisi, tümör lokalizasyonu ve histopatolojisi ile ilişkisi
The effect of the tumor deposit on oncological results and its relationship with tumor localization and histopathology in colon cancers
GUNEL MAMMADOVA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Genel CerrahiMarmara ÜniversitesiGenel Cerrahi Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ALİ EMRE ATICI