Geri Dön

Investigation of the interaction of the molecular structure of compound C24H24N6OS2 with DNA bases by DFT

C24H24N6OS2 bileşiğinin moleküler yapısının DNA bazları ile etkileşiminin DFT ile araştırılması

PDF İndir

  1. Tez No: 816797
  2. Yazar: ZAINULABDEEN MOHAMMED JALIL JALIL
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ÇİĞDEM YÜKSEKTEPE ATAOL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyofizik, Biophysics
  6. Anahtar Kelimeler: Sıklık, Density
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Fizik Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Tetrazol, tiyazol, siklobütan, asetamid ve fenil halkalarından oluşan bir kimyasal bileşiğin moleküler yapısı hesaplamalı kimya yöntemlerinden biri olan Yoğunluk Fonksiyonel Teorisi (YFT) kullanılarak araştırılmıştır. Hesaplamalarda hibrit fonksiyonlardan B3LYP baz fonksiyonu ile 6-311G ve 6-311G(d, p) sırasıyla split valans ve polarize split valans baz setleri kullanılmıştır. Kapalı formülü C24H24N6OS2 olan bileşiğin moleküler yapısı hem etanol hem de su ortamlarında optimize edilerek bağ parametreleri elde edilmiştir. Optimize edilmiş moleküler yapılar kullanılarak taban durumda su ve etanol ortamlarında tek nokta enerji hesabı yaptırılmıştır. Moleküler yapının en düşük enerjiye karşılık gelen en kararlı yapısı elde edildikten sonra moleküler elektrostatik potansiyel haritası elde edilmiş, doğal popülasyon analiz yüklerinden Fukui fonksiyonları hesaplatılmış ve moleküler orbital enerji değerleri elde edilmiştir. Moleküler orbital enerji değerlerinden moleküler yapının reaktivite parametreleri oluşturulmuş ve yük transfer parametreleri türetilerek adenin, guanin, sitozin ve timin gibi DNA bazları ile moleküler yapı arasındaki etkileşim araştırılmıştır.

Özet (Çeviri)

The molecular structure of a chemical compound consisting of tetrazole, thiazole, cyclobutane, acetamide, and phenyl rings was investigated using Density Functional Theory (DFT), one of the computational chemistry methods. In the calculations, the B3LYP basis function and the split valence and polarized split valence basis sets of 6-311G and 6-311G(d, p), respectively, were used. The molecular structure of the compound with the closed formula C24H24N6OS2 was optimized in both ethanol and water environments, and bond parameters were obtained. By using optimized molecular structures, a single-point energy calculation was made in the ground state in water and ethanol environments. After obtaining the most stable structure of the molecular structure corresponding to the lowest energy, the molecular electrostatic potential map was obtained, the Fukui functions were calculated from the natural population analysis charges, and the molecular orbital energy values were obtained. The reactivity parameters of the molecular structure were formed from the molecular orbital energy values and the charge transfer parameters were derived, and the interaction between DNA bases such as adenine, guanine, cytosine, and thymine and the molecular structure was investigated.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    502233

    Investigation of the molecular level interactions between mucins and food protein: Spectroscopic, tribological and rheological studies

    Başlık çevirisi yok

    HİLAL YILMAZ ÇELEBİOĞLU

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    Gıda MühendisliğiTechnıcal Unıversıty Of Denmark

    Dr. IOANNIS S. CHRONAKIS

  2. Tez No

    112221

    Investigation of the general properties of some polyelectrolyte complexes

    Bazı polielektrolit komplekslerin genel özelliklerinin incelenmesi

    NERMİN ACAR VURAL

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2001

    Kimyaİstanbul Teknik Üniversitesi

    PROF. DR. TÜLAY TULUN

  3. Tez No

    846448

    Bazı 1,3-benzazol-2(3h)-on halka sistemine sahip bileşiklerin sentezi ve biyolojik etkinliklerinin araştırılması

    Investigation of the synthesis and biological activities of some 1,3-benzazol-2(3h)-one ring system compounds

    GÜLNUR ARSLAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Eczacılık ve FarmakolojiGazi Üniversitesi

    Farmasötik Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AZİME BERNA ÖZÇELİK

  4. Tez No

    150147

    3-mesitil-2-hidroksi propil metakrilat ile glisidil metakrilat ve N-vinil pirrolidon kopolimerlerinin fiziksel ve termodinamik özelliklerinin araştırılması

    The investigation of the thermodynamic and physicalproperties of copolymers of N-vinyl pyrrolidone and glycidyl methacrylate with 3-mesitylene, 2-hydroxy propyl methacrylate

    ÜLKÜ SEZEK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    KimyaFırat Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. ASLIŞAH AÇIKSES

  5. Tez No

    754791

    Yeni sentezlenmiş katyonik stiril boyanın biyomoleküllerle etkileşiminin spektroskopik ve moleküler kenetlenme metotları ile incelenmesi

    Investigation of interaction of A novel cationic STYRYl dye wi̇th biomolecules by spectroscopic and molecular docking methods

    BENSU DOYURAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    KimyaHacettepe Üniversitesi

    Analitik Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ELMAS GÖKOĞLU

Geri Dön