Detection of the homo-oligomerization of ADGRE2/EMR2 using BRET and FRET
ADGRE2/EMR2 reseptörünün homo-oligomerizasyonunun BRET ve FRET yöntemleri kullanılarak belirlenmesi
- Tez No: 808770
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ÇAĞDAŞ DEVRİM SON, DR. ORKUN CEVHEROĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
G proteine kenetli reseptörler (GPKR'ler), zara bağlı reseptörlerde en büyük ailedir ve çeşitli hücresel tepkileri düzenler. GPKR'lerin canlı hücrelerde homo- ve/veya hetero-oligomerik kompleksler oluşturduğu bilinmektedir. Bu kompleksler reseptörün olgunlaşmasını, trafiğini ve sinyalleşmeyi etkiler. Adhezyon G proteinine kenetli reseptörler (aGPKR'ler), memelilerde GPKR'lerin ikinci en büyük alt ailesidir. Doku ve organ gelişiminde rol oynayan hücre yüzeyindeki hücre dışı matriks proteinleri ve ligandlarla etkileşime girdikleri bilinmektedir. Bununla birlikte, aGPKR'lerin oligomerik yapı oluşturup oluşturmadığı tam olarak anlaşılamamıştır. Mevcut çalışmada, aGPKR'lerin bir üyesi olan ADGRE2/EMR2 ve bunun izoformlarından biri olan ADGRE2(125)/EMR2(125) reseptörleri, BRET ve FRET kullanılarak homo-oligomerizasyonu incelemek için floresan veya biyolüminesan proteinlerle işaretlendi. ADGRE2 çoğunlukla bağışıklık hücrelerinde eksprese edilir ve ekspresyonu, monosit/makrofaj farklılaşması sırasında yüksek oranda kontrol edilir. Ayrıca, ADGRE2, vibratuar ürtiker (titreşime bağlı kurdeşen) adı verilen otozomal dominant bir hastalık ile ilişkilidir. Hastalar mekanik uyaran nedeniyle ciltlerinde kızarıklık ve ödem yaşarlar. Bununla birlikte, bu reseptörün hücre içi işlevi tam olarak anlaşılamamıştır. Dimerizasyon ve oligomerizasyon, birçok GPKR'nin trafiği ve fonksiyonu için önemli olduğundan GPKR'lerin dimerize ya da oligomerize olup olmadığını anlamak, bilinmeyen fonksiyonlarını anlamamıza yardımcı olabilir. Bu çalışma, ADGRE2 ve ADGRE2(125) izoformlarının, plazma zarında farklı oligomerik durumda bulunma eğiliminde olduğunu göstermektedir. Bu nedenle, hücre dışında bulunan bölgenin ADGRE2/EMR2 homo-oligomerizasyonu üzerinde bir etkisi olabilir. Bu bulgular, reseptör oligomerizasyonunun fizyoloji üzerindeki etkisini daha fazla araştırmamıza yardımcı olacaktır.
Özet (Çeviri)
G protein-coupled receptors (GPCRs) mediate a large variety of cellular responses and are the largest family of membrane-bound receptors. GPCRs are known to form homo- and/or hetero- oligomeric complexes in live cells. These complexes affect receptor maturation, trafficking, and signaling. Adhesion G protein-coupled receptors (aGPCRs), is the second largest sub-family of GPCRs in mammals. It is known that they interact with extracellular matrix proteins and ligands on the cell surface that plays a role in tissue and organ development. Nevertheless, it is not fully understood whether aGPCRs form oligomeric structures. In the current study, a member of the aGPCRs, ADGRE2 / EMR2, and one of its isoforms ADGRE2(125) / EMR2(125) were tagged with fluorescent or bioluminescent proteins to study homo-oligomerization using BRET and FRET. ADGRE2 is mostly expressed in the immune cells, and its expression is highly controlled during monocyte/macrophage differentiation. Moreover, ADGRE2 is related to an autosomal dominant disease called vibratory urticaria. Patients suffer from erythema and edema on their skin because of mechanical stimuli. However, the function of this receptor is not well-understood. Since dimerization and oligomerization can be important in the trafficking of many GPCRs, understanding if these GPCRs oligomerize could help us study their unknown functions with ease. This study indicates that ADGRE2 and ADGRE2(125) isoforms tend to be found in different oligomeric states in the plasma membrane. Therefore, our findings are indications of the role of extracellular domains on ADGRE2/EMR2 homo-oligomerization. The results of this study will help us to investigate further the effect of receptor oligomerization on physiology.
Benzer Tezler
- Detection of homo/hetero-dimerizations between adenosine A2A, dopamine D2 and NMDA receptors by use of FRET and BiFC assays
Adenozin A2A, dopamin D2 ve NMDA reseptörleri arasındaki homo/hetero-dimer oluşumlarının BiFC ve FRET yöntemleri ile tespiti
SİNEM ÇELEBİÖVEN
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÇAĞDAŞ DEVRİM SON
- More than just a dimer: detection of g protein-coupled receptor oligomers using fluorescent protein reassembly of Ste2p, a yeast pheromone receptor
Dimerden fazlası: G proteine kenetli reseptör etkileşiminin, Ste2p maya feromon reseptörü'nde floresan protein birleşmesi ile gösterilmesi
ORKUN CEVHEROĞLU
Doktora
İngilizce
2015
BiyokimyaOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ÇAĞDAŞ DEVRİM SON
- A study on RNA and protein effectors of transcription factor activity and gene expression
Transkripsiyon faktörü aktivitesi ve gen ifadesinde RNA ve protein etkenleri üzerine bir çalışma
AYŞE DERYA CAVGA
Doktora
İngilizce
2019
BiyolojiKoç ÜniversitesiKimya ve Biyoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEHRA ÖZLEM KESKİN ÖZKAYA
PROF. DR. ATTİLA GÜRSOY
- The Role of retinoic acid on C-MYC gene expression and its effects on tumor progression in SCLC
Retinoik asitin C-MYS geni ve küçük hücreli akciğer kanserinin tümör oluşumu üzerine etkileri
MERAL GÜSEY
- Predicting the bandgap of hole-transport materials by deep learning
Derin öğrenme ile delik geçiş malzemelerinin bant aralığı tahmini
MİRAÇ AYDIN
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
Kimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiHesaplamalı Bilim ve Mühendislik Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. ADEM TEKİN