Phenotypic and genotypic biofilm formation characteristic of acinetobacter baumannii isolated from intensive care units
Yoğun bakim ünitelerinden izole edilen acinetobacter baumannii izolatlarinin fenotipik ve genotipik biofilm formasyon özellikleri
- Tez No: 803813
- Danışmanlar: DOÇ. DR. AYLİN ÜSKÜDAR GÜÇLÜ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji, Mikrobiyoloji, Infectious Diseases and Clinical Microbiology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Acinetobacter baumannii, Biyofilmler, Yoğun bakım üniteleri, İlaçlara direnç-çoklu, Acinetobacter baumannii, Biofilms, Intensive care units, Drug resistance-multiple
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Başkent Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Acinetobacter baumannii, nozokomiyal enfeksiyonlarla yaygın olarak ilişkili önemli bir patojendir. Biyofilm oluşturma yeteneği, hastane ortamlarında hayatta kalmasını sağlar ve yok edilmesi için zorluklar yaratır. Bu çalışmada, yoğun bakım ünitelerinden (YBÜ) izole edilen imipenem, meropenem, amikasin, gentamisin, levofloksasin, siprofloksasin, trimetoprim/sülfametoksazol, tigesiklin ve kolistin dirençli A. baumannii izolatlarında biyofilm oluşumunun yapısal özelliklerinin araştırılması ve buna katkıda bulunan genetik altyapının belirlenmesi amaçlanmıştır. Başkent Üniversitesi Ankara Hastanesi yoğun bakım ünitelerinden elde edilen toplam 52 klinik A. baumannii izolatı çalışmaya dahil edildi. Antibiyotik duyarlılıkları test edildi ve kristal viyole boyama yöntemi kullanılarak biyofilm oluşturma yetenekleri değerlendirildi. Ek olarak, biyofilmler taramalı elektron mikroskobu (SEM) altında görselleştirildi. Biyofilm canlılığı, MTT yöntemi kullanılarak belirlendi ve blaCsuE, blaOmpA, blaabaI, blapgaA, blabap ve blaPer1 dahil olmak üzere biyofilmle ilgili genlerin varlığı, PCR kullanılarak tespit edildi. 52 A. baumannii izolatının %96,1'i biyofilm oluşturma yeteneği göstermiştir. Biyofilm ilişkili genler blabap ve blaabaI izolatların %98'inde tespit edilmiştir. Bunları takiben izolatların sırasıyla %96,1'inde blaOmpA ve %94,0'ında blaCsuE saptanmıştır. İzolatların sırasıyla %50,0 ve %40,3'ünde blapgaA ve blaPer1 genleri bulunmuştur. MTT analizi ile izolatların biyofilmdeki canlılıkları %13,5 ile %112,4 arasında belirlenmiştir. Bu faktörlerin varlığını ve aralarındaki ilişkileri anlamak, A. baumannii enfeksiyonlarını önlemek ve yönetmek için yeni yaklaşımlar geliştirmek için çok önemlidir. Bu patojenle mücadelede etkili stratejiler geliştirmek için biyofilm oluşumunda yer alan genlere dikkat edilmelidir.
Özet (Çeviri)
Acinetobacter baumannii is a significant pathogen commonly associated with nosocomial infections. Its ability to form biofilms enables it to survive in hospital settings and poses challenges for eradication. This study aimed to investigate the structural characteristics of biofilm formation in imipenem, meropenem, amikacin, gentamicin, levofloxacin, ciprofloxacin, trimethoprim/sulfamethoxazole, tigecycline and colistin resistant A. baumannii isolates from intensive care units (ICUs) and identify the genetic backgrounds contributing to biofilm formation. A total of 52 clinical A. baumannii isolates obtained from ICUs at Baskent University Ankara Hospital were included in the study. Antibiotic susceptibilities were tested, and biofilm formation ability was assessed using the crystal violet staining method. Additionally, biofilms were visualized under scanning electron microscope (SEM). Biofilm viability was measured using the MTT assay, and the presence of biofilm-related genes, including blaCsuE, blaOmpA, blaabaI, blapgaA, blabap, and blaPer1, was detected using PCR. Among the 52 A. baumannii isolates, 96.1% demonstrated biofilm formation ability. The biofilm-related genes blabap and blaabaI were detected in 98% of the isolates. Following these, blaOmpA and blaCsuE were present in 96.1% and 94.0% of the isolates, respectively. The presence of blapgaA and blaPer1 was observed in 50.0% and 40.3% of the isolates, respectively. The MTT assay revealed varying viability percentages ranging from 13.5% to 112.4%. Understanding the presence and relationships between these factors is crucial for developing novel approaches to prevent and manage A. baumannii infections. Attention should be directed towards the genes involved in biofilm formation to devise effective strategies for combating this pathogen
Benzer Tezler
- Klinik örneklerden izole edilen Acinetobacter baumannii izolatlarında plazmid aracılı kinolon direncinin ve biyofilm ilişkili genlerin belirlenmesi
Determination of plasmid-mediated quinolone resistance and biofilm-associated genes in Acinetobacter baumannii isolates from clinical samples
GÖZDE ÇELEBİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2026
Moleküler TıpAmasya ÜniversitesiMoleküler Tıp Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ CEREN BAŞKAN
- Acinetobacter baumannii klinik suşlarının fenotipik ve genotipik özelliklerinin araştırılması
Investigation of phenotypic and genotypic characteristics of acinetobacter baumannii clinical isolates
NEZAHAT KOŞAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiHitit ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞE SEMRA GÜRESER
- Staphylococcus aureus suşlarında biyofilm üretimi,biyofilm pozitif ve negatif suşların genotipik ve fenotipik karakterlerinin karşılaştırılması
Biofilm production in Staphylococcus aureus strains,comparison of genotypic and phenotypic characteristics of biofilm positive and negative strains
RASİM ŞAHİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2007
MikrobiyolojiPamukkale ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. İLKNUR KALELİ
- Metisilin dirençli Staphylococcus aureus izolatlarında biyofilm oluşumunun genotipik ve fenotipik yöntemlerle araştırılması
Investigation of biofilm in methicillin resistant Staphylococcus aureus isolates by genotypic and phenotypic methods
ZELİHA SEYFİ ŞANDA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
MikrobiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ DEMET GÜR VURAL
- Sığır mastitislerinden izole edilen Enterococcus hirae'nin virulens faktörleri, biyofilm oluşturma kapasitesi ve antibiyotik direnç profilleri
Virulence factors, biofilm forming capacity and antibiotic resistance profiles of E. hirae isolated from bovine mastitis
GÜLNAZ ÖZDEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2026
MikrobiyolojiAydın Adnan Menderes ÜniversitesiVeterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HAFİZE TUĞBA YÜKSEL DOLGUN