Yoğun bakımda yatan COVID olan ve olmayan hastalarda candida kolonizasyonunun karşılaştırılması
Comparison of Candida colonization in intensive care unit patients with and without COVID-19: First prospective cohort study from Turkey
- Tez No: 758649
- Danışmanlar: PROF. DR. ZAYRE ERTURAN
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: COVID 19, Kandida, Risk faktörleri, Yoğun bakım, Yoğun bakım üniteleri, COVID 19, Candida, Risk factors, Intensive care, Intensive care units
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu araştırma, COVID-19 olan ve olmayan yoğun bakım hastalarını; Candida türlerinin zamanla değişen kolonizasyon özellikleri açısından karşılaştıran ilk prospektif kohort çalışmasıdır. Çalışmada Candida kolonizasyonunu belirlemek ve karşılaştırmak için 62 COVID ve 60 COVID olmayan YBÜ hastasından 1464 örnek alındı. Tüm örnekler CHROMagar Candida ve CHROMagar Candida Plus besiyerlerine inoküle edildi ve izole edilen tüm suşlar MALDI-TOF MS kullanılarak tür düzeyinde tanımlandı. Hasta grupları; izole Candida türleri, bölgelere göre dağılımları ve risk faktörleri açısından istatistiksel olarak karşılaştırıldı. COVID-19 pozitif hastalar, negatiflere göre oral, rektal ve üriner örneklerde anlamlı olarak daha yüksek kolonize bulundu (p<0,05). Üreyen toplamda 471 suş en sık C.albicans (%42,25) ve C. glabrata (%24,2) olarak tanımlandı. C. auris izole edilmedi. Albicans-dışı Candida suşları, COVID-19 pozitiflerde diğer hastalara göre oral (p<0,001) ve rektal bölgelerde anlamlı olarak daha sık bulundu (p<0,05). Mikst Candida türleri ile kolonizasyon da yine COVID-19 hastalarında ve orofaringeal bölgede anlamlı olarak yüksek saptandı (p<0,05). Risk faktörlerinden mekanik ventilasyon ve kortikosteroid kullanımı COVID'li hastalarda olmayanlara göre anlamlı olarak yüksek bulundu (p<0,05). Bu hastalarda yüksek kolonizasyon oranına rağmen kandidoz gelişim oranı düşük (%9,67) ve COVID olmayanlarla benzer (%6,67) bulundu. Bununla birlikte, COVID pozitiflerde kolonizasyon indeksinin ilk haftadaki artışı, COVID negatif kişilere göre anlamlı olarak daha yüksek bulundu (p<0,05). Sonuç olarak hastanemiz YBÜ'deki COVID-19 hastalarında yüksek kolonizasyon oranlarına rağmen kandidemi gelişiminin düşük olduğu belirlenmiştir. Bununla birlikte, profilaktik veya ampirik antifungal tedavi planlanırken intrensek dirençli olabilen albicans-dışı suşlar göz önünde tutulmalıdır. Yine bu hastalarda saptanan yüksek mikst kolonizasyon oranı rutin değerlendirme için kromojenik besiyerinin kullanılmasının önemini vurgulamaktadır.
Özet (Çeviri)
This is the first prospective cohort study comparing the time-varying colonization features of Candida species in ICU patients with and without COVID-19. In this study,1464 samples were taken from 62 COVID and 60 non-COVID ICU patients in order to determine and compare Candida colonization. All specimens were inoculated on CHROMagar Candida and CHROMagar Candida Plus media and all strains identified to the species level using MALDI-TOF MS. Patient groups were compared statistically in terms of isolated Candida species, distribution according to regions and risk factors. Patients with COVID-19 compared to non-COVID-19 patients were found more frequently colonized in oral, rectal and urine samples (p<0.05). A total of 471 strains were identified most commonly as C.albicans (42.25%) and C. glabrata (24.2%). C. auris was not isolated. Non-albicans Candida strains was found significantly more frequent in patients with COVID-19 in oral (p<0.001) and rectal regions (p<0.05). Colonization with mixed Candida species was also found to be significantly higher in the oropharyngeal region in COVID-19 patients (p<0.05). Mechanical ventilation and using corticosteroid were found higher in COVID-19 patients (p<0.05) as risk factors. Despite the high colonization rates, patients with and without COVID-19 had a low and similar rate of candidosis 9,67% and 6.67% respectively. The increase in the colonization index in COVID positives in the first week was found to be significantly higher than in COVID negative individuals (p<0.05). As a result, it was determined that despite high colonization rates, the development of candidemia was low in COVID-19 patients in the ICU of our hospital. However, non-albicans strains that may be intrinsically resistant should be considered when planning prophylactic or empirical antifungal therapy. Also, the high mixed colonization rate detected in these patients emphasizes the importance of using chromogenic media for routine evaluation.
Benzer Tezler
- COVID-19 pandemisi öncesinde ve pandemi süresinde yoğun bakım ünitesinde yatan ve kandidemi gelişen hastaların epidemiyolojik, klinik ve laboratuvar özellikler açısından karşılaştırılması
Başlık çevirisi yok
BURAK KIZILÇAY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ZUHAL YEŞİLBAĞ
- Yoğun bakımda yatan COVID-19 olan ve olmayan hastaların bakteriyemi etken dağılımının ve risk faktörlerinin kıyaslanması
Comparison of the distribution of bacteremia-causing bacteria and risk factors for bacteremia in patients with and without COVID-19 in the intensive care unit
ÇAĞLA KESKİN SARITAŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HALİT ÖZSÜT
- COVID-19 pnömonisi olan hastalarda pnömoni derecesi ve serum NGAL düzeyi ilişkisi
The relationship between pneumonia grade and serum NGAL level in patients with COVID-19 pneumonia
SEMA NUR ARASAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
İç HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
UZMAN SELMA KARAAHMETOĞLU
- Yoğun bakım ihtiyacı olan COVID-19 PCR pozitif / BT pozitif hastaların uzun dönem pulmoner sekel/durum analizi
The Analysis of long term pulmonary sequale of the patient diagnosed with COVID-19 PCR ve CT positive were followed up in intensive care unite
HAMİDE GÜL ŞEKERBEY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Göğüs HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiGöğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SİNEM GÜNGÖR
DOÇ. DR. EYLEM TUNÇAY
- COVID-19 nedeniyle hastaneye yatan hastalarda karaciğer laboratuvar bulgularının hastalık seyriyle ilişkisi
Başlık çevirisi yok
HALİT UĞUR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
İç HastalıklarıAkdeniz Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİNÇ DİNÇER