Nöraminidaz ve hemaglutinin temelli elektro-nano diyagnostik platformlar: ınfluenza ve kanser tanısına yönelik model sistemlerin geliştirilmesi
Electro-nano diagnostic platforms based on neuraminidase and hemagglutin: development of model systems for diagnosis of influenza and cancer
- Tez No: 751292
- Danışmanlar: PROF. DR. ÜLKÜ ANIK
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Kimya, Biyokimya, Chemistry, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Biyosensörler, Hemaglutinin, Karbon temelli materyaller, Neoplazm hücreleri-dolaşan, Nöraminidaz, İnfluenza A virüsü, Biosensors, Hemaglutinin, Carbon based materials, Neoplastic cells-circulating, Neuraminidases, Influenza A virus
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Muğla Sıtkı Koçman Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu doktora tezinde, kanser hücreleri ve Influenza A virüsü tanısına yönelik nöraminidaz (NEU3) ve hemaglutinin (H) temelli elektrokimyasal model tanı sistemleri geliştirilmiştir. Çalışma iki bölümden oluşmaktadır. İlk bölümde, kanser tanısına yönelik NEU3 temelli elektrokimyasal model biyosensörün geliştirilmesi amacıyla altın yüzey baskılı elektrot (AuSPE) Grafen-Platin hibrit nanomalzeme ile modifiye edilmiş ve ardından bir kanser biyobelirteci olan NEU3 ile spesifik olarak etkileşim sağlayan sialik asit (SA) kaynağı GD3 gangliositi elektrot yüzeyine immobilize edilmiştir. Ortamda bulunan NEU3 elektrot yüzeyindeki GD3 gangliositini SA uçlarından kestiğinde açığa çıkan galaktozların Fıstık aglutinin (PNA) Lektine spesifik olarak bağlanması üzerinden dolaylı olarak NEU3 tayini gerçekleştirilmiştir. Geliştirilen model sistemin örnek denemesi için HeLa kanser hücre hattı kullanılmıştır. Tüm elektrokimyasal ölçümler elektrokimyasal impedans spektroskopisi (EIS) yöntemi kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Çalışmanın ikinci bölümünde ise, Influenza A tanısına yönelik anti-H temelli iki farklı elektrokimyasal model immunosensörü geliştirmek için model olarak H1N1 ve H3N2 inaktif virüsleri kullanılmıştır. H1N1 inaktif virüsü belirlenmesi amacıyla, çok duvarlı karbon nanotüp-altın-platin hibrit nanopartikülü ile modifiye edilmiş AuSPE yüzeyine anti-H1 antikorları immobilize edilmiştir. Diğer yandan, H3N2 inaktif virüsü belirlenmesi amacıyla, Grafen-Altın hibrit nanopartikülü ile modifiye edilmiş AuSPE yüzeyine anti-H3 antikorları immobilize edilmiştir. Geliştirilen Influenza model immunosensörleri H1N1 ve H3N2 inaktif virüsleri inkübe edildikten sonra anti-H1 antikoru ile H1N1 ve anti-H3 antikoru ile H3N2 arasındaki spesifik etkileşim EIS ile incelenmiştir. Sentetik tükürük içerisine standart H1N1 ve H3N2 virüsleri katımı yapılarak, serum matriks etkisi incelenmiştir.
Özet (Çeviri)
In this doctoral thesis, neuraminidase (NEU3) and hemaglutinin (H) based electrochemical model diagnosis systems were developed for cancer cells and Influenza A virus. Present work consist of two sections. In the first section, the development of NEU3 based model cancer electrochemical biosensor is described. For this purpose, first gold screen printed electrode (AuSPE) was modified with Grafen-Platinum hybrid nanoparticle. Then the sialic acid (SA) source GD3 ganglioside, which interacts specifically with a cancer biomarker NEU3, was immobilized on to the electrode surface. Indirect determination of NEU3 was carried out through the the specific binding of PNA Lectin to galactose units released when NEU3 enzyme in the medium cleaveges the GD3 ganglioside on the electrode surface from the SA ends. Sample application study of the developed model system was carried out with HeLa cancer cell lines. All electrochemical measurements were performed using the electrochemical impedance spectroscopy (EIS) method. In the second section, H1N1 and H3N2 inactive viruses were used as models to develop two different anti-H based electrochemical model immunosensors for the diagnosis of Influenza A. In order to detect H1N1 inactivated virus, anti-H1 antibodies were immobilized on multi-walled carbon nanotube-gold-platinum hybrid nanoparticle modified AuSPE surface. On the other hand, anti-H3 antibodies were immobilized on Graphene-Gold hybrid nanoparticle modified AuSPE surface to detect H3N2 inactive virus. Both Influenza model immunosensors were tested using H1N1 and H3N2 inactive viruses. The specific interactions between anti-H1 antibody and H1N1 and also between anti-H3 antibody and H3N2 were examined by EIS. The serum matrix effect was also investigated using a synthetic saliva supplemented with the standard H1N1 and H3N2 viruses.
Benzer Tezler
- İnfluenza A virüsü yüzey antijen proteini hemaglutininin mikroorganizmalarda çözünür halde üretilmesi
İnfluenza A virüsü yüzey antijen proteini hemaglutininin mikroorganizmalarda çözünür halde üretilmesi
AYŞE ARZU GÜL
- Güncel viral enfeksiyonlara karşı antiviral ilaç keşfi için moleküler kenetleme çalışmaları
Molecular docking studies for novel antiviral drug discovery againts current viral infections
SEVİM KARAKAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Biyolojiİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMİNE ŞEKÜRE NAZLI ARDA
PROF. DR. ÖMÜR BAYSAL
- In-vivo yöntemlere alternatif olarak ın-vitro yöntemle inaktif newcastle hastalığı aşılarında etkinlik tayini
Determination of efficacy in inactive newcastle disease vaccines with an in-vitro method as an alternative to in-vivo methods.
MUSTAFA KARS
Doktora
Türkçe
2019
MikrobiyolojiEge ÜniversitesiFarmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MİNE HOŞGÖR LİMONCU
- Genetic variations in the antigenic genes of seasonal H3N2 influenza a viruses (2018-2019 season; Izmir, Turkey)
Mevsimsel H3N2 influenza a virüslerinin antijenik genlerinde ortaya çıkan genetik varyasyonlar (2018-2019 sezonu; İzmir, Türkiye)
MERT DİKMENOĞULLARI
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiMoleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ZEYNEP AHSEN KOÇER
- İnfluenza virüsü yüzey antijen proteinlerinin mikroorganizmalarda rekombinant olarak üretilmesi ve analizi
Production and analysis of influenza virus surface antigen proteins in microorganisms
ŞEYMA ÖZAYDIN