IL-6'nın ADAMTS-8 gen ifadesi üzerine etkisinin belirlenmesi
Determination of the effect of IL-6 on ADAMTS-8 gene expression
- Tez No: 741327
- Danışmanlar: PROF. DR. FERAY KÖÇKAR, DR. ÖĞR. ÜYESİ MELTEM ALPER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Moleküler Tıp, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Genler-ADAMTS, Kolon neoplazmları, Kolorektal neoplazmlar, İnterleukin 6, Genes-ADAMTS, Colonic neoplasms, Colorectal neoplasms, Interleukin 6
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Balıkesir Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kolorektal kanser dünya çapında en sık görülen kanserlerden biridir. ADAMTS-8 önemli bir anjiyoinhibitör gendir. IL-6 sitokinin kolorektal kanser ile ilişkili olduğunu gösteren çalışmalar mevcuttur. Bu tezin amacı, IL-6 sitokinin ADAMTS-8 gen ekspresyonu üzerindeki etkisini belirlemektir. MTT deneyi, 10 ng/mL, 20 ng/mL ve 40 ng/mL'lik farklı konsantrasyonlarda IL-6'nın HCT-116 proliferasyonu üzerindeki etkisini incelemek için kurulmuştur. IL-6 sitokininin HCT-116 hücre proliferasyonu üzerinde istatistiki olarak önemli bir fark oluşturmadığı belirlenmiştir. IL-6'nın 20 ng/mL konsantrasyonunda ADAMTS-8 gen ekspresyonu üzerindeki etkisi, western blot ve gerçek zamanlı PCR teknikleri kullanılarak protein ve mRNA düzeyinde belirlenmiştir. IL-6 ADAMTS-8 mRNA seviyesinde 1, 3 ve 24. saatlerde istatistiksel olarak anlamlı olarak artış gösterdiği belirlenmiştir. IL-6 sitokini ADAMTS-8 protein seviyesinde artan bir etki oluşturmaktadır. IL6'in ADAMTS8 gen ifadesi üzerinde gösterdiği bu etkinin hangi yolaktan gösterdiği ile ilgili yolak inhibisyon çalışmaları gerçekleştirilmiştir. IL-6 farklı yolak inhibitörler ile uygulandığında MEK inhibitörü ADAMTS-8 mRNA seviyesinin 0.5 kat azaldığı sonucuna varılmıştır. PI3K inhibitörü olarak Worthmannin inhibitörü uygulandığında 2-7 kat, p38 MAP kinaz inhibitörü olarak PD169 inhibitörü uygulandığında, 2-10 kat, JNK inhibitörü olarak SP600125 inhibitörü uygulandığında 2-7 kat artış, NFKB inhibitörü uygulandığında 20-30 kat artışı ADAMTS-8 geninin mRNA düzeyinde belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Colorectal cancer is one of the most common cancers worldwide. ADAMTS-8 is an important angioinhibitory gene. There are studies showing that IL-6 cytokine is associated with colorectal cancer. The aim of this thesis is to determine the effect of IL-6 cytokine on ADAMTS-8 gene expression. The MTT assay was set up to examine the effect of IL-6 at different concentrations of 10 ng/mL, 20 ng/mL and 40 ng/mL on the proliferation of HCT-116. It was determined that IL-6 cytokine did not make a statistically significant difference on HCT-116 cell proliferation. The effect of IL-6 on ADAMTS-8 gene expression at 20 ng/mL concentration was determined at the protein and mRNA level using western blot and real-time PCR techniques. It was determined that IL-6 ADAMTS-8 mRNA level increased statistically at 1, 3 and 24 hours. The IL-6 cytokine has an increased effect on the ADAMTS-8 protein level. Pathway inhibition studies have been carried out to determine from which pathway IL6 exerts this effect on ADAMTS8 gene expression. It was concluded that MEK inhibitor ADAMTS-8 mRNA level decreased 0.5-fold when IL-6 was applied with different pathway inhibitors. 2-7 fold when Worthmannin inhibitor is applied as PI3K inhibitor, when PD169 inhibitor was applied as a p38 MAP kinase inhibitor, 2-10 fold increase was determined when SP600125 inhibitor was applied as JNK inhibitor, 2-7 fold increase when NFKB inhibitor was applied, 20-30 fold increase was determined in the mRNA level of ADAMTS-8 gene.
Benzer Tezler
- Geç epilepsilerde etyolojinin aydınlatılmasında bilgisayarlı beyin tomografisinin yeri ve değeri
Başlık çevirisi yok
A. FİGEN TUNALI
- Pulmoner rehabilitasyonun ankilozan spondilitli hastalarda ergospirometre parametreleri ve klinik bulguları üzerine etkileri
Başlık çevirisi yok
SİBEL DEMİR DEVİREN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1997
Fiziksel Tıp ve RehabilitasyonSağlık BakanlığıFiziksel Tıp ve Rehabilitasyon Ana Bilim Dalı
- Trombospondin motifli disintegrin benzeri matriks metalloproteinaz genlerinin behçet hastalığı patogenezindeki rollerinin araştırılması
Investigation of the roles of A disintegrin-like metalloproteinase with thrombospondin TYPE-1 motif in the pathogenesis of behcet disease
ABDULLAH ZÜBEYİR DAĞLI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
RomatolojiDicle ÜniversitesiFiziksel Tıp ve Rehabilitasyon Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHTAP BOZKURT
- Biomimicking cartilage: Engineering the matrix, molecular pathways and oxygen sensing of chondrocytes
Biyomimik kıkırdak: Kondrositlerin matriksi, moleküler yolakları ve oksijen duyarlılığı mühendisliği
ECE ÖZTÜRK
Doktora
İngilizce
2017
BiyomühendislikEıdgenossısche Technısche Hochschule Zurıch (eth)Biyomedikal Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MARCY ZENOBI-WONG
- Ketojenik diyet ve kalori kısıtlı diyetin anti-inflamatuvar etkilerinin incelenmesi
Investigation of anti-inflammatory effects of ketogenic diet and calori restricted diet
ŞEYDA KARABULUT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıMarmara ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİLŞAD TÜRKDOĞAN