Geri Dön

Investigation on prevalence of Roditis leaf discoloration-associated virus causing disease in grapevines in Turkey vineyards

Türkiye bağlarında asmada hastalık yapan Roditis yaprak renk değişikliği ilişkili virüs (Roditis leaf discoloration associated virus)'ün yaygınlığı üzerine araştırmalar

  1. Tez No: 712249
  2. Yazar: SEDA AYDINLIK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ÇİĞDEM ULUBAŞ SERÇE
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Ziraat, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Asma, Filogenetik, Virüsler, Grapevine, Phylogenetic, Viruses
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Bitkisel Üretim ve Teknolojileri Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Asma Roditis yaprak renk değişikliği ile ilişkili virüs (GRLDaV), Türkiye'de asmalarda tespit edilen ilk DNA virüsüdür. Bu araştırma, Türkiye'de bağ alanlarında GRLDaV yaygınlığını araştırmak ve viral izolatların varyasyon durumunu DNA sekansı ve filogenetik analizlerle belirlemek amacıyla yapılmıştır. Test edilen 800 asma örneğinde GRLDaV enfeksiyon oranı %8,12 olarak belirlenmiştir. Bölgeleri temsil eden iller bazında test edilen örneklerde Bursa'da GRLDaV enfeksiyonu %1,04, Manisa'da %2,15, İzmir'de %67,56, Denizli'de %9,1, Adıyaman'da %4, Şanlıurfa'da %11,3, Elazığ'da %7,6, Antalya'da %57,14, Mersin'de %47,5, Adana'da %6,25, Kahramanmaraş'ta %4,76 ve Ankara'da %4,76 oranında tespit edilmiştir. Batman, Diyarbakır, Mardin, Gaziantep, Malatya, Tekirdağ, Çanakkale, Burdur, Isparta Konya ve Nevşehir'den alınan örneklerde GRLDaV tespit edilmemiştir. İlkbahar sonu ve sonbaharda toplanan örneklerde GRLDaV enfeksiyon oranı sırasıyla %9,26 ve %9,59 olarak belirlenmiştir. Filogenetik analiz sonuçlarına göre GRLDaV izolatları intraspesifik çeşitlilik göstermiş, grup 1 ve 2 olarak iki ana gruba ayrılmış ve grup 2 ayrıca kendi içinde 2a ve 2b olarak belirtilen alt gruplara ayrılmıştır. Bu çalışma, dünyada ve Türkiye'de kapsamlı GRLDaV surveyi yapılan ilk çalışmadır.

Özet (Çeviri)

Grapevine Roditis leaf discoloration associated virus (GRLDaV) is the first DNA virus detected in grapevines in Turkey. This research scope was to investigate the prevalence of GRLDaV in vineyard areas in Turkey and to determine the variability of the viral isolates with DNA sequence and phylogenetic analysis. GRLDaV infection rate was determined as 8.12% among the 800 tested grapevine samples. Based on the provinces to represent the regions, GRLDaV infection in the samples tested was 1.04% from Bursa, 2.15% from Manisa, 67.56% from İzmir, 9.1% from Denizli, 4% from Adıyaman, 11.3% from Şanlıurfa, 7.6% from Elazığ, 20% from Antalya, 57.14% from Mersin, 47.5% from Adana, 6.25% from Kahramanmaraş and 4.76% from Ankara. GRLDaV was not detected among the samples obtained from Batman, Diyarbakır, Mardin, Gaziantep, Malatya, Tekirdağ, Çanakkale, Burdur, Isparta Konya and Nevşehir. The GRLDaV infection rate was 9.26% and 9.59% among the samples collected in late spring and autumn, respectively. According to phylogenetic analysis, GRLDaV isolates were divided in two main groups as indicated group 1 and 2 and, group 2 divided in subgroups as indicated 2a and 2b, highlighting the extensive intraspecific diversity. This study is the first comprehensive survey for GRLDaV in the world and in Turkey.

Benzer Tezler

  1. Sivas'da köpeklerde echinococcus granulosus yaygınlığı, hidatidozun epidemiyolojisi, tanısı ve tedavisi üzerinde çalışmalar

    Investigation on the prevalence of echinococcus granulosus in dogs in Sivas epidemiology, diagnosis and treatment of hydatidosis

    SEMRA ÖZÇELİK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1988

    MikrobiyolojiCumhuriyet Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. GÜLENDAME SAYGI

  2. Van'da çiğ olarak tüketime sunulan tavuk etlerinde Listeria türlerinin varlığı ve yaygınlığı üzerine araştırmalar

    Investigation on the presence and prevalence of listeria species in raw chicken meat consumed in Van

    CİHANGİR ELİBOL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    Besin Hijyeni ve TeknolojisiYüzüncü Yıl Üniversitesi

    Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YAKUP CAN SANCAK

  3. Os trigonum görülme sıklığı ve dağılımının radyografik olarak incelenmesi

    The investigation of prevalence and distrubiation of os trigonum on radiographs

    HATİCE NERGİZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    AnatomiTokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi

    Anatomi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BİRSEN ÖZYURT

  4. Kedilerde böbrek ultrasonografisinde medullar kenar işaretinin prevalansı ve klinik öneminin araştırılması

    investigation of the prevalence and clinical significance of the medullary rim sign on renal ultrasound in cats

    ŞEYMA KAHRAMAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    Veteriner HekimliğiAydın Adnan Menderes Üniversitesi

    Veterinerlik İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. GÜLTEN EMEK TUNA

  5. Minimal hepatik ensefalopati tanısında kullanılan psikometrik testlerde yaş ve eğitim durumuna göre Türkiye normal değerlerinin belirlenmesi ve kompanze sirozlu hastalarda minimal hepatik ensefalopati prevalansının araştırılması

    Determination of normal values in Turkish population based on psychometric tests used in the diagnosis of minimal hepatic encephalopathy in age and educational status and investigation of prevalence and minimal hepatic encephalopathy in patients with compensated cirrhosis

    BURAK ÖZBAŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    GastroenterolojiAnkara Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SÜLEYMAN CİHAN YURTAYDIN