Geri Dön

Türkiye'nin değişik bölgelerinden toplanan çeşitli su örneklerinde hepatit E virüsü RNA'sının araştırılması

Detection of hepatitis E virus RNA in diverse water samples from different areas of Turkey

  1. Tez No: 69730
  2. Yazar: SEVGİ ERGİN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. KEMAL ALTAŞ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji, Mikrobiyoloji, Infectious Diseases and Clinical Microbiology, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Hepatit E virüsü, RNA, Hepatitis E virus, RNA
  7. Yıl: 1998
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

ÖZET Virüs hepatitleri dünyada önemli bir sağlık sorunudur, özellikle geri kalmış ve gelişmekte olan ülkelerde salgınlar yapan HEVin ana bulaşma kaynağı sulardır. Bu sebeple çalışmamız da, Türkiye'nin farklı bölgelerinden toplanan 150 su örneği (içme suyu:66, deniz suyu: 18, kuyu suyu: 18, kaynak suyu: 19, göl suyu:5, akarsu:11, havuz suyu:7, baraj suyu:2, lağım suyu:3, bahçe sulama suyu:1) HEV RNA'sının saptanması amacıyla RT-PCR yöntemiyle incelendi. Yaptığımız inceleme sonucunda, yöntemine uygun olarak çalıştığımız 150 su örneğinden sadece üç tanesinde gözlenen bant pUC Mix Marker 8 [pUCıgDNA / Msp I (Hpa II) mixed with PUC57DNA / Dra I + Hind İli ] (MBI, Fermentas, Litvanya) ile karşılaştırılarak 240 bp olarak belirlendi. RT-PCR yöntemi uygulanarak elde edilen ürünlere 3' ucundan ddUTP Digoxigenin (Boehringer Mannheim GmbH, Mannheim, Germany) ile işaretlenmiş anti-sens primerin prob olarak kullanıldığı Dot-Blot testi uygulandı ve sadece RT- PCR'da pozitif olarak bulunan üç su örneği bu test sonucunda da pozitif olarak saptandı. Bu su örneklerinden ikisi, İstanbul Kemerburgaz'dan alınan bir kaynak suyu ve Tuzla'dan alınan bir kuyu suyu, diğeri ise Ünye'den alınan bir artezyen suyu idi. Ülkemizin farklı bölgelerinden temin ettiğimiz su örnekleriyle yaptığımız bu çalışma da ana bulaşma kaynağı olan sularda düşük HEV varlığı gösterildi. Bu bulgu gelişmemiş ülkelerde yüksek oranlarda bulunduğu halde, ülkemizde daha önceden serolojik yöntemlere dayandırılarak bildirilen düşük HEV seroprevalensiyle uyumlu görülmektedir. 59

Özet (Çeviri)

Summary Detection of Hepatitis E virus RNA in diverse water samples from different areas of Turkey Viral hepatitis is a major health problem worldwide. The major source of hepatitis E causing epidemics especially in underdevoleped and devoloping countries is water. In this study, 150 water samples (consisting of 66 tap water, 18 spring water, 18 sea water, 19 underground water, 11 river water, 7 pond water, 5 lake water, 3 sewage water, 2 dam water and 1 garden watering) collected from different regions of Turkey closely after rain falls were screened for HEV RNA by RT-PCR. Only three of 150 water samples handled according to previously described methods yielding a band of 240 bp [compared with pUC Mix Marker 8 (pUCigDNA / Msp I (Hpa II) mixed with pUC57DNA / Dra I + Hind III )] (MBI, Fermentas, Lithuania) were positive for HEV RNA. The positive samples were confirmed by Dot-Blotting using antisense primer labelled with ddUTP digoxigenin at 3' end as probe. The positive sample were a spring water sample from Istanbul, two underground water samples from Ünye (eastern part of Black see region) and Tuzla (same geographic region with Istanbul). In this study conducted on diverse water samples obtained from different regions of Turkey, using RT-PCR method we showed that the prevalence of HEV in water samples is low. Although, the HEV seroprevalence is high in underdeveloped and developing countries, our results are consistent with the low HEV seroprevalence in Turkey, previously reported from serological studies. so

Benzer Tezler

  1. Türkiye'de yetiştirilen mısırlarda hektolitre ağırlığı ile ham besin maddeleri ve enerji değerleri arasındaki ilişkilerin saptanması üzerinde bir araştırma

    A Research on estimation of relationship between kernel density and nutrients contents, energy values of corn cultivated in Turkey

    SİNAN YURTOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2000

    ZiraatAnkara Üniversitesi

    Zootekni Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. İBRAHİM ÇİFTÇİ

  2. Wet and dry deposition fluxes of pollutants over a black sea forest region

    Wet and dry deposition fluxes of pollutants over a black sea forest region

    OMAR EL-AGHA

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2000

    KimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMRA G. TUNCEL

    PROF. DR. GURDAL TUNCEL

  3. Antalya'da depolanmış ürün ve materyalde zararlı böcek ve akar türleri.Yayılışları ve habitatları üzerine araştırmalar.

    Başlık çevirisi yok

    YILDIRIM YANAROĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1993

    ZiraatAkdeniz Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İRFAN TUNÇ

  4. Long-range atmospheric transport of pollutants to the Eastern Mediterranean Basın

    Kirleticilerin Doğu Akdeniz Havzasına uzun mesafe atmosfer taşınımı

    IDREES AL-MOMANI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    1995

    KimyaOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    PROF.DR. GÜRDAL TUNCEL

  5. Çok katlı konut tasarımında kullanıcıların esneklik taleplerini karşılayacak yapı elemanlarının seçimine yönelik bir karar verme yaklaşımı

    In Multi-storey housing design a decision making approach oriented to the selection of building elements that meet the flexibility demands of users

    ÖMER Ş. DENİZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    Mimarlıkİstanbul Teknik Üniversitesi

    PROF.DR. HEYECAN GİRİTLİ