Genotype catalog for the analysis of drug-drug interactions
İlaç-ilaç etkileşimleri analizi için genotip kataloğu
- Tez No: 691252
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ AYBAR CAN ACAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Eczacılık ve Farmakoloji, Genetik, Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Pharmacy and Pharmacology, Genetics, Computer Engineering and Computer Science and Control
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Enformatik Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Sağlık Bilişimi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Polifarmasi, günümüz tedavi biliminde, özellikle yaşlı nüfusun bakımında önemli bir uygulamadır. Polifarmasinin neden olduğu çoğu ilaç-ilaç etkileşimleri (DDI'ler), genellikle ilaçlar piyasaya sürüldükten sonra fark edilmektedir. Öngörülemeyen DDI'lardan kaynaklanan sağlık problemleri ve ekonomik yük, sağlık sistemini zor durumda bırakmaktadır. Bu nedenle, DDI'lerin öngörülebilirliğini artırmak, tedavi başarısını iyileştirmeye yönelik en önemli amaçlardan biri haline gelmiştir. Birçok parametreye bağımlı olmaları, DDI'ların tahmin edilebilirliklerini zorlaştırmaktadır. Genetik çeşitlilik altta yatan parametrelerin en önemlilerinden biridir. Bu nedenle, ilaç-ilaç-gen etkileşimleri (DDGI) olarak adlandırılan, DDI-genetik arası ilişki hakkındaki daha derin bir bilgi, tedavi başarısını artıracaktır. Bu çalışma, reçete yazanlara, araştırmacılara ve ilaç endüstrisine kılavuzluk ederek, devam eden DDGI çalışmalarına katkıda bulunmak üzere tasarlanmış DDGICat adlı ilişkisel bir veritabanı tasarlamayı amaçlamaktadır. DDGICat'in içeriği DrugBank, PharmGKB, Ensembl, KEGG Drug, ve ONC High dahil olmak üzere diğer veri tabanlarından türetilmiştir. DDGICat ilaçları, ilaç hedef proteinlerini, ilaçla ilişkili SNP'leri, DDI'ları, ilaç-gen etkileşimlerini (DGI'lar) ve DDGI'ları içermektedir. İlave olarak, bahsi geçen içerikleri hem tablo hem de grafik formatında sunmak amacıyla DDGICat Browser isimli bir web portalı geliştirilmiştir. Ayrıca, bu çalışmanın nihani ürünleri, seçilen bir hastalık üzerine bir vaka çalışmasında test edilmiştir.
Özet (Çeviri)
Polypharmacy is an essential practice in today's therapeutics, especially in the care of older population. Most polypharmacy-induced drug-drug interactions (DDIs) are often discovered after drugs are put on the market. Health problems and economic burden due to unpredicted DDIs put the health system in a difficult situation. Therefore, increasing the predictability of DDIs has become one of the most critical concerns towards improving treatment success. Being dependent on several underlying parameters makes DDIs challenging to foresee. One of the most significant determinants of these underlying parameters is genetic variability. Therefore, a more profound knowledge of the DDI-genetic relationship, called drug-drug-gene interactions (DDGI), will improve treatment success. This study aims to design a relational database named DDGICat, which was designed to contribute to the ongoing DDGI research by serving as a guideline to prescribers, researchers, and the pharmaceutical industry. The content of the DDGICat was derived from other knowledge bases, including DrugBank, PharmGKB, Ensembl, KEGG Drug, and ONC High. DDGICat contains drugs, drug target proteins, drug-associated SNPs, DDIs, drug-gene interactions (DGIs), and DDGIs. Additionally, a developed web portal named DDGICat Browser provides the results of mentioned content in both tabular and graphical formats. Furthermore, the end products of this study are tested in a case study on a chosen disease.
Benzer Tezler
- Cytokine polymorphism catalog (CytoCAT) for the analysis of phenotype associations
Fenotip ilişkileri analizi için sitokin polimorfizm kataloğu(CytoCAT)
GÖKÇE OĞUZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoenformatik Bölümü
YRD. DOÇ. DR. AYBAR CAN ACAR
YRD. DOÇ. DR. YEŞİM AYDIN SON
- Tek merkez deneyimiyle ailesel hiperkolesterolemi ile ilişkili genlerin“yeni kuşak DNA dizi analizi (Next generation sequencing – NGS)”yöntemi ile incelenmesi
Investigation of genes associated with familial hypercholesterolemia with single center experience by“Next generation sequencing – NGS”method
DEMET ÖZKAY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
GenetikDokuz Eylül ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYFER ÜLGENALP
- Aktif yetişkin erkeklerde CYP1A2 rs762551 gen polimorfizminin yo-yo ıntermıttent recovery 2 test (Yo-Yo aralıklı toparlanma 2 testi) performansı üzerindeki etkilerinin incelenmesi
Evaluating the influence of the CYP1A2 rs762551 gene polymorphism on the performance of physically active adult males in the yo-yo intermittent recovery 2 test
DİDEM ÇATALO
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
GenetikLokman Hekim ÜniversitesiSpor Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MESUT CERİT
- Aktif yetişkin erkeklerde ACTN3 rs1815739 gen polimorfizmlerinin arrowhead agılıty drıll (arrowhead çeviklik yetenek testi) test performans gelişim oranlarının üzerine etkisi
Evaluating the influence of the ACTN3 rs1815739 gene polymorphism on the performance of physically active adult males in the arrowhead agility drill test
İREM ÇATALO
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
GenetikLokman Hekim ÜniversitesiSpor Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MESUT CERİT
- Genotype-phenotype correlation in cystic fibrosis and gene localization in seckel syndrome and pectus carinatum
Sistik fibrozis hastalığında, genotip-fenotip bağlantısının kurulması ve sekel sendromu ve pektus karinatum için gen bölgelerinin belirlenmesi
M. OKYAY KILINÇ