Geri Dön

Clouing and sequencing of a PCR amplican of a novel dehalogeuase gene from pseudomonas sp strain SEC 896

Pseudomonas sp. SEC 836 suşundan yeni bir dehalogeuaz geninin bir PCR ampli kanunun klonlanması ve nükleik asit dizisinin belirlenmesi

  1. Tez No: 68523
  2. Yazar: GÜROL MEHMET SÜEL
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SEMRA KOCABIYIK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Bilim ve Teknoloji, Science and Technology
  6. Anahtar Kelimeler: Pseudomonas sp. strain SEC 896, haloasit dehalogenaz, klonlama, nükleik asit dizi analizi, Polimeraz Zincir Reaksiyonu, biyolojik yıkım. VI, Amino asitler, Genler, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Pseudomonas, Suşlar, Pseudomonas sp. strain SEC 896, haloasit dehalogenaz, klonlama, nükleik asit dizi analizi, Polimeraz Zincir Reaksiyonu, biyolojik yıkım. VI, Amino acids, Genes, Polymerase chain reaction, Pseudomonas, Strains
  7. Yıl: 1997
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

öz PSEUDOMONAS SP. SEC 896 SUSUNDAN YENİ BİR DEHALOGENAZ GENİNİN BİR PCR AMPÜKONUNUN KLONLANMASI VE NÜKLEİK ASİT DİZİSİNİN BELİRLENMESİ Gürol M., Süei M.S., Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı Danışman : Prof. Dr. Semra Kocabıyık Yardımcı Danışman : Yrd. Doç. Dr. Mahinur Akkaya Temmuz 1997, 80 sayfa Bu çalışmada, Pseudomonas sp. strain SEC 896 susundan yeni bir dehalogenaz geninin klonlanması için bir strateji geliştirilmiştir. Bu strateji izlenerek, haloasit dehalogenaz genlerinin amino asit dizilerine homolog bir fragman, Polimeraz Zincir Reaksyonu (PCR) kullanılarak spesifik olarak çoğaltılmıştır. Dejenere PCR primer seti, bugüne dek nükleik asit dizileri saptanmış sekiz dehalogenaz enziminin büyük ölçüde korunmuş iki amino asit motifi dikkate alınarak tasarlanmıştır. Optimize edilmiş koşullar altında, PCR ~ 0.96 kb büyüklüğünde hiç birkontaminasyon içermeyen özgün bir amplikon oluşturmuştur. Bu amplikon pBS SK (+) fazmiti vektör olarak kullanılarak E. coli TG1 susunda klonlanmıştır. Klonlanmış PCR amplikonu,“Southern Blöf HybridizasyonuncJa prob olarak kullanıldığında, Pseudomonas sp. SEC 896 susunun kromozomal ONA sında olası haloasit dehalogenaz geninin pozisyonunu saptamada başarılı olmuştur. Ayrıca, klonlanmış PCR amplikonunun nükleik asit dizisi ”dideoxy chain termination" yöntemi kullanılarak belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

öz PSEUDOMONAS SP. SEC 896 SUSUNDAN YENİ BİR DEHALOGENAZ GENİNİN BİR PCR AMPÜKONUNUN KLONLANMASI VE NÜKLEİK ASİT DİZİSİNİN BELİRLENMESİ Gürol M., Süei M.S., Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı Danışman : Prof. Dr. Semra Kocabıyık Yardımcı Danışman : Yrd. Doç. Dr. Mahinur Akkaya Temmuz 1997, 80 sayfa Bu çalışmada, Pseudomonas sp. strain SEC 896 susundan yeni bir dehalogenaz geninin klonlanması için bir strateji geliştirilmiştir. Bu strateji izlenerek, haloasit dehalogenaz genlerinin amino asit dizilerine homolog bir fragman, Polimeraz Zincir Reaksyonu (PCR) kullanılarak spesifik olarak çoğaltılmıştır. Dejenere PCR primer seti, bugüne dek nükleik asit dizileri saptanmış sekiz dehalogenaz enziminin büyük ölçüde korunmuş iki amino asit motifi dikkate alınarak tasarlanmıştır. Optimize edilmiş koşullar altında, PCR ~ 0.96 kb büyüklüğünde hiç birkontaminasyon içermeyen özgün bir amplikon oluşturmuştur. Bu amplikon pBS SK (+) fazmiti vektör olarak kullanılarak E. coli TG1 susunda klonlanmıştır. Klonlanmış PCR amplikonu,“Southern Blöf HybridizasyonuncJa prob olarak kullanıldığında, Pseudomonas sp. SEC 896 susunun kromozomal ONA sında olası haloasit dehalogenaz geninin pozisyonunu saptamada başarılı olmuştur. Ayrıca, klonlanmış PCR amplikonunun nükleik asit dizisi ”dideoxy chain termination" yöntemi kullanılarak belirlenmiştir.

Benzer Tezler

  1. Cloning and expression of TaqI restriction endonuclease gene using pmal-c2 vector system in different straints of escherichia coli

    TaqI restriksiyon endonükleaz geninin pmal-c2 vektör sistemi kullanılarak değişik escherichia coli suşlarında klonlanması ve ekspresyonu

    ELİF ÖZKIRIMLI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1998

    Kimya MühendisliğiBoğaziçi Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. BETÜL KIRDAR

  2. Molecular cloning and characterization of the common 1b subtype of HCV from Turkey

    Türkiye'de baskın olarak görünen hepatit C virüsü 1b alt tipinin moleküler klonlanması ve karakterizasyonu

    ASLI ÖZTAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1999

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK

  3. Cloning of Taql endonuclease gene into E.coli and its expression

    Taql endonükleaz geninin E.coli'ye klonlanması ve ekspresyonu

    İZZET ENÜNLÜ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1996

    BiyolojiBoğaziçi Üniversitesi

    PROF.DR. BETÜL KIRDAR

  4. PCR based, isolation, cloning on expression of streptokinase gene from a group c streptococcus equisimilis in e.coli

    Bir grup c (Streptocossus equisimilis)'e ait olan streptokinaz genin pcr-aracılığı ile izolasyonu, klonlaması ve e.coli'de ifade edilmesi

    FARZİN ROOHVAND

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    1998

    BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. UFUK GÜNDÜZ