Clouing and sequencing of a PCR amplican of a novel dehalogeuase gene from pseudomonas sp strain SEC 896
Pseudomonas sp. SEC 836 suşundan yeni bir dehalogeuaz geninin bir PCR ampli kanunun klonlanması ve nükleik asit dizisinin belirlenmesi
- Tez No: 68523
- Danışmanlar: PROF. DR. SEMRA KOCABIYIK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Bilim ve Teknoloji, Science and Technology
- Anahtar Kelimeler: Pseudomonas sp. strain SEC 896, haloasit dehalogenaz, klonlama, nükleik asit dizi analizi, Polimeraz Zincir Reaksiyonu, biyolojik yıkım. VI, Amino asitler, Genler, Polimeraz zincirleme reaksiyonu, Pseudomonas, Suşlar, Pseudomonas sp. strain SEC 896, haloasit dehalogenaz, klonlama, nükleik asit dizi analizi, Polimeraz Zincir Reaksiyonu, biyolojik yıkım. VI, Amino acids, Genes, Polymerase chain reaction, Pseudomonas, Strains
- Yıl: 1997
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
öz PSEUDOMONAS SP. SEC 896 SUSUNDAN YENİ BİR DEHALOGENAZ GENİNİN BİR PCR AMPÜKONUNUN KLONLANMASI VE NÜKLEİK ASİT DİZİSİNİN BELİRLENMESİ Gürol M., Süei M.S., Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı Danışman : Prof. Dr. Semra Kocabıyık Yardımcı Danışman : Yrd. Doç. Dr. Mahinur Akkaya Temmuz 1997, 80 sayfa Bu çalışmada, Pseudomonas sp. strain SEC 896 susundan yeni bir dehalogenaz geninin klonlanması için bir strateji geliştirilmiştir. Bu strateji izlenerek, haloasit dehalogenaz genlerinin amino asit dizilerine homolog bir fragman, Polimeraz Zincir Reaksyonu (PCR) kullanılarak spesifik olarak çoğaltılmıştır. Dejenere PCR primer seti, bugüne dek nükleik asit dizileri saptanmış sekiz dehalogenaz enziminin büyük ölçüde korunmuş iki amino asit motifi dikkate alınarak tasarlanmıştır. Optimize edilmiş koşullar altında, PCR ~ 0.96 kb büyüklüğünde hiç birkontaminasyon içermeyen özgün bir amplikon oluşturmuştur. Bu amplikon pBS SK (+) fazmiti vektör olarak kullanılarak E. coli TG1 susunda klonlanmıştır. Klonlanmış PCR amplikonu,“Southern Blöf HybridizasyonuncJa prob olarak kullanıldığında, Pseudomonas sp. SEC 896 susunun kromozomal ONA sında olası haloasit dehalogenaz geninin pozisyonunu saptamada başarılı olmuştur. Ayrıca, klonlanmış PCR amplikonunun nükleik asit dizisi ”dideoxy chain termination" yöntemi kullanılarak belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
öz PSEUDOMONAS SP. SEC 896 SUSUNDAN YENİ BİR DEHALOGENAZ GENİNİN BİR PCR AMPÜKONUNUN KLONLANMASI VE NÜKLEİK ASİT DİZİSİNİN BELİRLENMESİ Gürol M., Süei M.S., Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı Danışman : Prof. Dr. Semra Kocabıyık Yardımcı Danışman : Yrd. Doç. Dr. Mahinur Akkaya Temmuz 1997, 80 sayfa Bu çalışmada, Pseudomonas sp. strain SEC 896 susundan yeni bir dehalogenaz geninin klonlanması için bir strateji geliştirilmiştir. Bu strateji izlenerek, haloasit dehalogenaz genlerinin amino asit dizilerine homolog bir fragman, Polimeraz Zincir Reaksyonu (PCR) kullanılarak spesifik olarak çoğaltılmıştır. Dejenere PCR primer seti, bugüne dek nükleik asit dizileri saptanmış sekiz dehalogenaz enziminin büyük ölçüde korunmuş iki amino asit motifi dikkate alınarak tasarlanmıştır. Optimize edilmiş koşullar altında, PCR ~ 0.96 kb büyüklüğünde hiç birkontaminasyon içermeyen özgün bir amplikon oluşturmuştur. Bu amplikon pBS SK (+) fazmiti vektör olarak kullanılarak E. coli TG1 susunda klonlanmıştır. Klonlanmış PCR amplikonu,“Southern Blöf HybridizasyonuncJa prob olarak kullanıldığında, Pseudomonas sp. SEC 896 susunun kromozomal ONA sında olası haloasit dehalogenaz geninin pozisyonunu saptamada başarılı olmuştur. Ayrıca, klonlanmış PCR amplikonunun nükleik asit dizisi ”dideoxy chain termination" yöntemi kullanılarak belirlenmiştir.
Benzer Tezler
- Cloning and expression of TaqI restriction endonuclease gene using pmal-c2 vector system in different straints of escherichia coli
TaqI restriksiyon endonükleaz geninin pmal-c2 vektör sistemi kullanılarak değişik escherichia coli suşlarında klonlanması ve ekspresyonu
ELİF ÖZKIRIMLI
Yüksek Lisans
İngilizce
1998
Kimya MühendisliğiBoğaziçi ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF.DR. BETÜL KIRDAR
- PCR amplification, cloning and sequencing of the gene coding for salivaricin B and partial characterisation of the bacteriocin produced by Lactabacillus salivarius M7
Başlık çevirisi yok
OSMAN ÇATALOLUK
Doktora
İngilizce
1999
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. CANDAN GÜRAKAN
- Molecular cloning and characterization of the common 1b subtype of HCV from Turkey
Türkiye'de baskın olarak görünen hepatit C virüsü 1b alt tipinin moleküler klonlanması ve karakterizasyonu
ASLI ÖZTAN
Yüksek Lisans
İngilizce
1999
Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET ÖZTÜRK
- Cloning of Taql endonuclease gene into E.coli and its expression
Taql endonükleaz geninin E.coli'ye klonlanması ve ekspresyonu
İZZET ENÜNLÜ
- PCR based, isolation, cloning on expression of streptokinase gene from a group c streptococcus equisimilis in e.coli
Bir grup c (Streptocossus equisimilis)'e ait olan streptokinaz genin pcr-aracılığı ile izolasyonu, klonlaması ve e.coli'de ifade edilmesi
FARZİN ROOHVAND
Doktora
İngilizce
1998
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. UFUK GÜNDÜZ