Geri Dön

Broylerden izole edilen escherichia coli'lerin önemli virulans genlerinin ve antibiyotik direncinin incelenmesi

Investigation of the important virulence genes and antibiotic resistance of escherichia coli's isolated from broiler

PDF İndir

  1. Tez No: 621095
  2. Yazar: AYHAN İLÇEBAYLIK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SÜHEYLA TÜRKYILMAZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Antibiyotikler, Escherichia coli, Etlik piliç, Genler, Virülans, İlaçlara direnç, İlaçlara direnç-bakteriyel, Antibiotics, Escherichia coli, Broiler chickens, Genes, Virulence, Drug resistance, Drug resistance-bacterial
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Aydın Adnan Menderes Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Kanatlı patojenik Escherichia coli (APEC)'nin neden olduğu kolibasilozis, E. coli'nin konakçıda yapışmasını ve çoğalmasını teşvik eden spesifik genler tarafından kodlanan virülens faktörleri bulunduğunda meydana gelir. Bu çalışmada, broyler iç organlarından elde edilen APEC izolatlarında sideroforları (iucD, iroN, iutA), toksinleri (astA, vatA, hlyF), adezinleri (papC, tsh), serum direncini (iss, ompT) ve kolisini (colV) kodlayan virülens gen (VG) varlığı polimeraz zincir reaksiyonu (PZR) ile ve izolatların antibiyotik dirençlerinin disk difüzyon yöntemi ile incelenmesi amaçlandı. En az beş VG taşıyan izolatlar klinik APEC (cAPEC) daha az VG taşıyanlar potansiyel APEC (pAPEC) ve en az üç veya daha fazla antimikrobiyal madde sınıfına dirençli olanlar çoklu antibiyotiğe dirençli (MDR) olarak değerlendirildi. cAPEC ve pAPEC arasındaki VG sıklığını karşılaştırmak için Ki-Kare (χ2) testi kullanıldı ve χ2 testinde P≤0.05 anlamlı olarak kabul edildi. Yüz yetmiş üç broylerden 140 (%80,1) APEC izole edildi. Çalışmanın sonunda 140 izolattan 86'sının (%61,4) cAPEC, 54'ünün (% 38,6) pAPEC olduğu ve bu izolatların 47 virülans genotipi taşıyordığı saptandı. iss (%78.6), iutA (%75.7), iroN (%68.6), hylF (%61.4), ompT (%60.0) genleri en yüksek oranda tespit edilen genlerdi. Araştırılan diğer genler ise; iucD (%40.0), tsh (%27.1), colV (%25.7), papC (%21.4), vatA (%8.6), astA (%4.3) daha düşük sıklıklarda saptandı. χ2 testi, tüm virülans genlerinin cAPEC ve pAPEC suşları arasındaki dağılımının önemli olduğunu gösterdi. Tüm izolatların, amoksisilin, trimetoprim sülfametoksazol, amoksisilin klavulanik asit ve siprofloksasine karşı yüksek düzeyde direnç gösterdiği bulundu. Birden fazla demir taşıma sistemine sahip olmanın APEC sağkalımı üzerinde önemli bir rol oynadığı, virülans genlerinin PZR yöntemiyle incelenmesinin patojenite testi yapmaktan daha pratik olduğu ve virülans genotiplerinin karakterize edildiği VG bazlı teşhis yöntemlerinin geliştirilmesinin gelecekteki aşı çalışmaları için faydalı olabileceği sonucuna varıldı.

Özet (Çeviri)

Colibacillosis induced by poultry pathogenic Escherichia coli (APEC) occurs when virulence factors that are encoded by specific genes that promote adhesion and proliferation of E. coli in the host. The aim of this study was to investigate the virulence genes encoding siderophores (iucD, iroN, iutA), toxins (astA, vatA, hlyF), adhesins (papC, tsh), serum resistance (iss, ompT) and colicin (colV) APECs isolated from broiler internal organs by polymerase chain reaction (PCR) and antibiotic resistance of isolates by disc diffusion method. The isolates carrying at least five VG were clinical APEC (cAPEC), whereas those carrying less VG were potentially APEC (pAPEC) and isolates resistant to at least three or more classes of antimicrobial agents were evaluated as multiple antibiotic resistant (MDR). Chi-Square (χ2) test was used to compare the frequency of VGs between cAPEC and pAPEC, P ≤ 0.05 was considered as significant. A hundred forty (80.1%) APEC were isolated from 173 broilers. At the end of the study, 86 (61.4%) of the 140 isolates were cAPEC, 54 (38.6%) were pAPEC and these isolates had 47 virulence genotypes. iss (78.6%), iutA (75.7%), iroN (68.6%), hylF (61.4%), ompT (60.0%) genes were the highest detected genes. Other genes investigated; iucD (40.0%), tsh (27.1%), colV (25.7%), papC (21.4%), vatA (8.6%), astA (4.3%) were detected at lower frequencies. The χ2 test showed that the distribution of all virulence genes between cAPEC and pAPEC strains was important. All isolates were found to be high level resistant to amoxicillin, trimethoprim sulfamethoxazole, amoxicillin clavulanic acid and ciprofloxacin and 90.0% had MDR. It was concluded that having more than one iron transport system plays an important role on APEC survival, the examination of virulence genes by PCR method is more practical than pathogenicity test and development of VG-based diagnostic methods that characterize virulence genotypes may be useful for future vaccine studies.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    578031

    Tavuk dışkılarından izole edilen escherichia coli'lerde plazmit aracılı kolistin direnci sağlayan MCR--1 geninin araştırılması

    Investigation of the plasmid mediated colistin resistance gene MCR-1 in escherichia coli isolates from chicken feces

    NİLÜFER ERZAİM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Veterinerlik Mikrobiyolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERKAN İKİZ

  2. Tez No

    887954

    Molecular identification and antimicrobial resistance profiles of Escherichia coli isolated in urine cultures from Shamiya State Hospital (Iraq)

    Şamiye Devlet Hastanesi (Irak) idrar kültürlerinden izole edilen Escherichia coli'nin moleküler tanımlanması ve antimikrobiyal direnç profilleri

    ALI HAMEED NEAMAH ALHUSSEINI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    MikrobiyolojiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Moleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET OĞUZ ÖZTÜRK

  3. Tez No

    595251

    Broylerlerde artritise neden olan aerobik bakterilerin antibiyotik dirençlilik durumlarının araştırılması

    Investigation of antibiotic resistance status of aerobic bacteria causing arthritis in broilers

    NURULLAH SAYIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiAydın Adnan Menderes Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SÜHEYLA TÜRKYILMAZ

  4. Tez No

    155427

    Broilerlerden klasik kültürel yöntemelerle Salmonella izolasyonunda çeşitli yöntem modifikasyonlarının denenmesi

    Modifications on the standard culture methods for the isolation of Salmonella from broiler

    BETÜL VAZGEÇER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    Gıda MühendisliğiHacettepe Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. AYHAN TEMİZ

  5. Tez No

    124080

    Sağlıklı bireylerden ve kandidiazisli hastalardan izole edilen candida albicans suşlarının proteinaz enzim aktivitesinin araştırılması

    Research on proteinase enzyme activity of candida albicans isolated from healty individuals and patients with candidosis

    ÖZLEM GÜLCAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    Eczacılık ve FarmakolojiAnkara Üniversitesi

    Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ.DR. SULHİYE YILDIZ

Geri Dön