Divergent functions of NLRP7 in \\embryogenesis, inflammation and oncogenesis
NLRP7'nin embryogenez, enflamasyon ve onkogenezdeki farklı fonksiyonları
- Tez No: 560650
- Danışmanlar: PROF. NESRİN ÖZÖREN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2019
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
NLRP7 hakkında kısıtlı bilgiye sahip olduğumuz yeni bir proteindir. Bu güne kadar, NLRP7 mutasyonları rekürren komplet Hidatidiform mole (RKHM) sebep olan ilk gen olarak belirlenmiştir. RKHM embryo oluşumu gözlenmeyen ve hipertrofik trophoblast proliferasyonu ile takip eden hamilelikler olarak tanımlanmıştır. Bunun yanı sıra, NLRP7'nin gen ifadesi testiküler seminoma, endometriyum ve embiryonal karsinomalarda fazla bulunmuştur. Fakat, NLRP7'nin bu yolaklardaki muhtemel çalışma mekanizması henüz aydınlatılamamıştır. Bu tezde, NLRP7'nin RHM'deki görevini ortaya çıkarmak üzere hastaya özel indüklenmiş pluripotent kök hücreler (iPKH) geliştiril-miş ve yetersiz NLRP7 seviyelerinin BMP4 yolakları üzerinden iPKH'lerin trofoblastlara farklılaşmasını arttırdığını ortaya çıkarılmıştır. NLRP7'nin gen ifadesinin geri kazandırılması veya BMP yolaklarının baskılanması hastadan elde edilen hücrelerdeki artmış trofoblast farklılaşmasını geri çevirebilmiştir. Bunun yanı sıra NLRP7'nin NOD benzeri alıcılar ailesi üyesi olması sebebiyle doğuştan gelen bağışıklık sisteminde de görev alması beklenmektedir. Bu calişmada \textit{Pseudomonas aeruginosa}'nın NLRP7 inflamazomunu aktive ederek IL-1$\beta$ salımına sebep olduğu bulunmuştur. Sürekli NLRP7 ekspresyonu TNF-alpha, IL-6, i-309 gibi pro-inflamatuar sitokinlerin salımıyla korelasyon göstermiştir. Bunun yanı sıra NLRP7'nin potansiyel proto-onkogenik rolünü ortaya çıkarmak için \textit{in-vivo} tümör zenogreft deneyleri gerçekleştirilmiştir. Sürekli NLRP7 ifade eden endometriyum kanser hücrelerinde tümör oluşumunun arttığı gösterilmiştir. Bu hücrelerde yapılan beraber immün çöktürme sonucunda gercekleştirilen kütle spektreskopisi NLRP7'nin potansiyel etkileşim ortaklarını ortaya çıkarmıştır. Sonuçlarımız, NLRP7'nin embiryogenezde, enflamasyonda ve onkogenezde, kesişen ve farklılık göste-ren moleküler yolaklarda görev aldığını ortaya koymuştur.
Özet (Çeviri)
NLRP7 is a novel protein about which we have limited information. To date, mutations in NLRP7 gene have been associated with recurrent Complete Hydatidiform Mole (RCHM) and NLRP7 is accepted to be the first causative gene for RHM. CHM is a gestational disease characterized by hyper trophoblast proliferation with no embryo formation. Furthermore, NLRP7 expression was found to be elevated in testicular seminoma, endometrium cancer and embryonal carcinoma. Yet, the possible mechanisms of action of NLRP7 in these biological conditions or pathways have not been enlightened. In this thesis, we generated patient derived induced Pluripotent Stem Cells (iPSC) to address the role of NLRP7 in HM. We revealed that inadequate NLRP7 levels expedited the differentiation of iPSCs towards the trophoblasts through BMP4. Recovery of NLRP7 expression or BMP pathway inhibition decelerated excessive differentiation of patient iPSCs to trophoblasts. Also, as NLRP7 is an NOD Like Receptor Family member, it is expected to play a role in innate immunity. We have found that infection of human monocytic cells with \textit{Pseudomonas aeruginosa} activated the NLRP7 inflammasome followed by increased IL-1$\beta$ secretion. Clearly, stable overexpression of NLRP7 is correlated with increased secretion of pro-inflammatory cytokines such as; TNF-alpha, IL-6, i-309. In addition, to elucidate the possible proto-oncogenic role of NLRP7 in tumorogenesis, we performed xenograft experiments in vivo. We found that stable expression of NLRP7 in the endometrial cancer cell line (Hec1a) resulted in increased tumor growth. Furthermore, potential interaction partners of NLRP7 were identified after co-immunoprecipitation followed by mass spectrometry. Our results shed further light to the overlapping and diverging molecular pathways regulated by NLRP7 in embryogenesis, inflammation and oncogenesis.
Benzer Tezler
- Serilerle çözüm
Solutions with the series
DENİZ BOZKUŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
MatematikYıldız Teknik ÜniversitesiMatematik Ana Bilim Dalı
Y.DOÇ.DR. SERVET ES
- Shock characteristics of supersonic two phase free jets
Sesüstü akışlarda iki fazlı serbest jetlerin şok yapıları
GÖKHAN ÖZKAN
- Evaluation of functional changes in AKR1B1 and AKR1B10 overexpressing colorectal cancer cell lines
AKR1B1 VE AKR1B10 aşırı ifadelenmesinin kolorektal kanser hücre hatları üzerindeki fonksiyonel etkilerinin değerlendirilmesi
İSMAİL GÜDERER
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SREEPARNA BANERJEE
- Identification of interaction sites of G protein-coupled receptors using machine learning techniques
Makine öğrenme teknikleri kullanılarak g protein-kenetli reseptörlerin etkileşim bölgelerinin tespit edilmesi
MEHMET EMRE ŞAHİN
Doktora
İngilizce
2014
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. TOLGA CAN
- An analysis of the relationships between the British and the Indians based on the representation of settings in E. M. Forster's“A Passage to India”
E. M. Forster'ın“Hindistan'a Bir Geçit”adlı romanında mekan temsili üzerinden Britanyalılar ile Hintlilerin ilişkilerinin analizi
BEYZA DEMET SARIKAYA
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
İngiliz Dili ve EdebiyatıYaşar Üniversitesiİngiliz Dili ve Edebiyatı Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA AHMET SÜNER