Geri Dön

Potent inhibitors designed for methionine aminopeptidase II using pharmocophore modeling

Başlık çevirisi mevcut değil.

  1. Tez No: 536306
  2. Yazar: SAFANAH A. AL BAYATI
  3. Danışmanlar: PROF. DR. KEMAL YELEKÇİ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Kadir Has Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Metaloenzimlerden Metiyonin Aminopeptidazlar (MetAP2), yeni sentezlenmiş polipep-titlerin başından metionin amino asidini kesmekle sorumludur. MetAP2'nin seçimli olarak engellenmesi damar oluşumunu baskıladığını, katı tümörlerde tümör boyunu ve metastazı sınırlandırdığı gösterilmiştir. Romatizma, kanser v.b. gibi tedavisi zor hastalıklarla direkt ilgili olduğu bulunmuştur. Araştırmacılar uzun süredir bu enzimi inhibe eden ilaçlar üzerine çalışmaktadır. Fumagillin MetAP2'nin doğal geri dönüşümsüz inhibitörüdür. Fumagillin ve yarı sentetik analogları potansiyel ilaç olarak umut vaat etmelerine karşı farmakokinetik ve nörotoksik özelliklerinden dolayı FDA'dan klinik deneyler için izin alamamıştır. Bu çalışmada, Zinc15 ve Ulusal Kanser Enstitüsü (NCI) veri bankalarından MatAP2'nin potansiyel ve tok- sik olmayan inhibitörleri in silico tarama, ligand ve yapı bazlı farmakofor modelleme yöntemleri ile elde edilmiştir. PyRx ve Doklama işlemleri ile uygulanarak aralarından daha isabetli ilaç adayları seçilmiştir. Discovery Studio (2016)'nın ADMET protokolü adayların farmakokinetik özelliklerini tespiti için kullanılmıştır. Bulunan bu adaylar MetAP2 enzimine potansiyel inhibitör olabilecekleri ve farmkokinetik özelliklerinin Fumagillian'dan daha iyi oldukları bulunmuştur. Bulunan bu moleküller biyolojik testler için ve tedavisi zor kanser ve bu gibi hastalıklara karşı çok iyi potansiyel ilaç adayları olacağı görüşüne varılmıştır.

Özet (Çeviri)

Methionine Aminopeptidase (Metap2) is a metalloenzyme that is responsible of removing of the N-terminal of newly synthesized protein. The inhibition of the enzyme was found to be crucial in diminishing tumor's nourishment, growth, and metastasis. It is directly related to incurable diseases such as Cancer, Rheumatoid Arthritis, etc. Over the year, different compounds were developed to inhibit that enzyme. Fumagillin, a natural irreversible inhibitor of MetAP2 and its derivatives, has been showing great potential therapy, however, their toxicity and poor pharmacokinetic characteristics have forbidden them from passing clinical trial and FDA approval. In this research, an in-silico approach was conducted to obtain a compound that is capable of inhibiting the enzyme with non-toxic properties. Two different approaches were conducted using a pharmacophore modeling; Ligand-Based, and Structure-Based. The Zinc15 and National Institute of Cancer Data (NCI) Databases was screened to obtain diversity of pre-synthesized compound. Followed by Molecular Docking filtration process using PyRx, and Autodock4. Followed by Discovery Studios protocol called ADMET prediction to signify the ability of these compound to pass the blood barriers and demonstrate batter pharmacokinetics properties than the Fumagillian. These compounds will serve, as Great Drug Candidate for the biological test in our continuous war against cancer and others Incurable disease.

Benzer Tezler

  1. In silico screening of potent HIV-1 integrase inhibitors for the treatment of human immunodeficiency virus (HIV)

    İnsan immünyetmezlik virüsü (HIV) tedavisine yönelik in silico taramayla potansiyel integraz inhibitörlerinin bulunması

    AUGUSTINE S. SAMORLU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Tıbbi BiyolojiKadir Has Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KEMAL YELEKÇİ

  2. The ınvestıgatıon of potent C-met ınhıbıtors pyrıdazıne trıazole derıvatıves on estrogen receptor posıtıve and negatıve breast cancer cell lınes

    Östrojen reseptörü pozitif ve negatif meme kanseri hücre hatlarında potansiyel c-met inhibitörleri piridazin triazol türevlerinin araştırılması

    BUSE AKTÜRK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2025

    BiyoteknolojiGebze Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    PROF. DR. ELİF DAMLA ARISAN

  3. Koroner gerçek bifürkasyon lezyon girişimlerinde potent ve potent olmayan P2Y12 reseptör inhibitörlerinin iskemik olaylar açısından karşılaştırılması

    Comparison of potential and non-potential P2Y12 receptor inhibitors with regards to ischemic events in coronary true bifurcation lesion procedures

    SEMANUR VURAL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    KardiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Kardiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ALİ NAZMİ ÇALIK

  4. Yeni anti-inflamatuar ilaçların tasarımına yönelik, COX-1/COX-2 selektif ve COX-2/5-LOX dual inhibitörlerinin hesaplamalı yöntemlerle incelenmesi

    Computational investigation of selective COX-1/COX-2 selective ve COX-2/5-LOX dual inhibitors for designing new anti-inflammatory drugs

    FATMA AKSAKAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyokimyaGebze Teknik Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ANATOLİ DİMOGLO

  5. Targeting cancer epigenetic modifiers: The design of isoform-selective histone deacetylase inhibitors

    Kanser epigenetik modifiye edicilerin hedeflenmesi: İzoforma özel seçimli histon deasetilaz inhibitör dizaynı

    ABDULLAHİ İBRAHIM UBA

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    BiyoteknolojiKadir Has Üniversitesi

    Biyoenformatik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KEMAL YELEKÇİ