Geri Dön

Investigation of UNG genetic variants in sporadic alzheimer disease

Sporadik alzheimer hastalığında UNG genetik varyantlarının araştırılması

PDF İndir

  1. Tez No: 515932
  2. Yazar: ASLI SEMERCİ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MELTEM MÜFTÜOĞLU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Biyoteknoloji, Biyoloji, Genetics, Biotechnology, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Base excision repair, Genetic variant, Next generation sequencing, Sporadic Alzheimer disease, Uracil DNA glycosylase, Alzheimer hastalığı, DNA, DNA hasarı, DNA onarımı, Dizi analizi-DNA, Flüorourasil, Genetik, Genetik varyasyon, Genomik değişim, Baz eksizyon tamiri, Genetik varyant, Sporadik Alzheimer hastalığı, Urasil DNA Glikozilaz, Yeni nesil dizileme, Alzheimer disease, DNA, DNA damage, DNA repair, Sequence analysis-DNA, Fluorouracil, Genetics, Genetic variation, Genomic change
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Medikal Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Oksidatif DNA hasarının birikmesi ve bu hasarı onaran baz eksizyon tamir (BER) mekanizmasındaki bozukluk sporadik Alzheimer hastalığının (AH) etiyolojisi ve patogenezinde rol oynamaktadır. Urasil DNA glikozilaz (UDG) urasil DNA lezyonunu keser ve nükleer ve mitokondriyal BER yolağının ilk basamağında yer alır. Sporadik Alzheimer hastalarının post-mortem beyin dokularında, Alzheimer fare modellerinde ve hücre hatlarında yapılan biyokimyasal, moleküler, hücresel ve davranış çalışmaları, sporadik AH'nın patogenezi ile UDG'nin ekspresyon ve aktivitesindeki azalmanın neden olduğu BER hasarı arasındaki güçlü ilişkiyi ortaya çıkarmıştır. UNG geninin sessizleştirilmesi sinir hücrelerini amiloid AβPP toksisitesine duyarlı kılmaktadır. Bu nedenle, bu çalışmada, UNG geni sporadik AH için genetik risk faktörü adayı olarak seçilmiştir. Sporadik Alzheimer hasta ve sağlıklı kontrol gruplarında UNG geni (promoter, ekzon ve intron bölgeleri) Ion-PGM NGS teknolojisi kullanılarak dizilendi ve önemli UNG gen varyantları Sanger sekanslama ile doğrulandı. Bu çalışma, sporadik AH için iki yeni genetik risk faktörü olduğunu ortaya çıkarmıştır (p <0.05). Ayrıca, bu çalışma aynı zamanda, sporadik AH'de UDG'nin ekspresyon, protein ve aktivite düzeylerindeki azalmanın, UNG gen varyant (lar) ından kaynaklanmadığını da göstermiştir.

Özet (Çeviri)

The oxidative DNA damage accumulation and defect of its repair through“base excision repair (BER)”mechanism is crucial for the sporadic AD's etiology and pathogenesis. Uracil DNA glycosylase (UDG) incises uracil lesion from DNA involved in the first step of both nuclear and mitochondrial BER. The biochemical, cellular, molecular and behavioral studies are done with the post-mortem brain tissues of sporadic Alzheimer patients, Alzheimer mouse models and cell lines revealed the strong relation between BER deficiency due to the decrease in the expression levels and activities of UDG, and sporadic AD pathogenesis. In addition, UNG gene silencing makes neurons susceptible to amyloid AβPP toxicity. Therefore, in this study, UNG gene was selected as potential genetic factor for sporadic AD. Thus, UNG gene covering promoter, exon and intron regions in sporadic Alzheimer patients and healthy controls were sequenced using Ion-PGM NGS technology and the significant UNG gene variants were confirmed with Sanger sequencing. This study revealed two new genetic risk factors for sporadic AD (p<0.05). Furthermore, this study also demonstrated that the decrease in the expression, protein and activity levels of UDG in sporadic AD is not due to UNG gene variant(s).

Benzer Tezler

  1. Tez No

    579062

    T hücre immünitesinde fonksiyon gösteren Ctla-4 Gen varyantlarının küçük hücreli dışı akciğer kanseriyle olası ilişkisinin araştırılması

    Investigation of possible relationship between CTLA-4 Gene variants functioning with non-small cell lung cancer in t-cell immunity

    BURCU İSENLİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Moleküler Tıpİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İLHAN YAYLIM

  2. Tez No

    444003

    Kolorektal kanser olgularında atm, RAD51 veTP73 genetik varyasyonlarının incelenmesi

    Investigation of ATM, RAD51 and tp73 genetic variations in colorectal cancer patients

    MERVE YAZICI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Moleküler Tıpİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞAKİR ÜMİT ZEYBEK

  3. Tez No

    816309

    Miyomlu hastalarda ölüm reseptörü 4 (Death reseptör-DR4) geni varyant analizi

    Death receptor 4 - DR4 gene variant analysis in patients with leiomyomas

    TOLGA HALICI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Kadın Hastalıkları ve DoğumMuğla Sıtkı Koçman Üniversitesi

    Kadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. EREN AKBABA

    PROF. DR. TUBA EDGÜNLÜ

  4. Tez No

    499195

    The ınvestıgatıon of changes ın chromosome 9 INV (9) and 9QH (+) varıant regıons by molecular cytogenetıc analysıs(fluorescence ın situ hybridization (FISH)

    Kromozom 9'un inv(9) ve 9qh(+) variant bölgelerindeki değişimlerin moleküler sitogenetik yöntemle ( fluorescence in situ hybridization (FİSH) incelenmesi

    RAJAA UMRAN MOSA AL-RUBAYE

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    GenetikSelçuk Üniversitesi

    Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. NADİR KOÇAK

  5. Tez No

    771365

    Kars yöresine ait ata buğdayı Kavılca ve modern ekmeklik buğdaydan hazırlanan un ve ekmeğin fonksiyonel özelliklerinin ve sağlık etkilerinin incelenmesi

    Investigation of the functional properties and health effects of flour and bread prepared from Kavılca wheat grown in Kars and modern bread wheat

    ELİF FEYZA AYDAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BERAAT ÖZÇELİK

Geri Dön